-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
so_reverse_complement.plot
698 lines (698 loc) · 8.32 KB
/
so_reverse_complement.plot
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
"Revision" "--enable-gems"
29335 2.183
29407 2.166
29460 2.153
29510 2.164
29578 2.103
29628 2.149
29690 2.145
29740 2.135
29806 2.115
29875 2.164
29953 2.125
30006 2.121
30087 2.182
30152 2.205
30205 2.186
30271 2.194
30356 2.221
30411 2.193
30463 2.251
30517 2.228
30645 2.259
30709 2.266
30759 2.266
30809 2.249
30859 2.313
30926 2.289
30977 2.308
31029 2.232
31080 2.223
31130 2.313
31180 2.219
31239 2.224
31289 2.21
31343 2.243
31393 2.324
31447 1.793
31497 2.317
31560 2.295
31613 2.262
31676 2.292
31728 2.311
31826 2.215
31905 2.361
31958 2.344
32014 2.381
32065 2.411
32115 2.411
32169 2.343
32221 2.368
32274 2.389
32330 2.426
32334 2.392
32339 2.385
32344 2.377
32349 2.347
32354 2.37
32359 2.359
32367 2.371
32373 2.374
32395 2.395
32401 2.404
32451 2.323
32506 2.309
32583 2.324
32657 2.251
32731 2.255
32806 2.375
32869 2.3
32973 2.286
33060 2.296
33140 2.237
33199 2.254
33254 2.233
33328 2.308
33379 2.225
33429 2.285
33499 2.241
33551 2.291
33606 2.319
33657 2.295
33711 2.323
33762 2.294
33812 2.237
33862 2.562
33917 2.541
33967 2.541
34027 2.59
34084 2.575
34134 2.571
34212 2.552
34266 2.614
34328 2.613
34383 2.616
34469 2.679
34584 2.613
34669 2.645
34728 2.513
34786 2.553
34847 2.697
34902 2.677
34963 12.582
35015 12.65
35067 12.684
35118 12.728
35173 12.758
35235 12.769
35291 12.648
35354 12.651
35422 12.702
35476 12.652
35529 12.754
35584 12.72
35638 12.76
35695 12.723
35765 12.676
35822 12.749
35875 12.862
35926 12.885
35981 12.893
36033 12.726
36083 12.857
36134 12.697
36185 12.762
36186 12.774
36202 12.728
36217 12.887
36237 12.735
36258 12.687
36273 12.709
36297 12.716
36314 12.739
36315 12.703
36330 12.731
36345 12.683
36360 12.688
36375 12.846
36391 12.891
36406 12.732
36421 12.728
36436 12.676
36451 12.671
36466 12.704
36481 12.649
36497 12.662
36512 12.66
36528 12.641
36543 12.704
36565 12.717
36580 12.686
36596 12.585
36611 12.564
36626 12.765
36641 12.794
36658 12.871
36674 12.857
36689 12.798
36704 12.827
36719 12.755
36736 12.736
36751 12.767
36766 12.826
36781 12.81
36798 12.768
36813 12.734
36828 13.078
36835 12.735
36840 12.759
36845 12.782
36850 12.768
36855 12.802
36862 12.831
36867 12.79
36872 12.769
36877 12.772
36882 12.744
36888 12.736
36893 12.794
36898 12.746
36903 12.793
36908 12.764
36913 12.789
36918 12.759
36923 12.787
36931 12.903
36936 12.82
36942 12.906
36947 12.969
36952 12.875
36957 12.886
36962 12.894
36968 12.902
36973 12.807
36978 12.793
36984 12.778
36989 12.774
36994 12.769
36999 12.783
37008 12.77
37013 12.795
37018 12.762
37027 12.734
37033 12.761
37039 12.832
37044 12.832
37046 12.836
37051 12.804
37057 12.818
37062 12.77
37068 12.842
37074 12.887
37079 14.384
37084 15.085
37089 15.039
37095 15.443
37106 15.506
37111 15.456
37116 15.591
37121 15.475
37126 15.503
37131 15.549
37137 15.534
37145 15.565
37163 15.51
37167 15.549
37174 15.573
37180 15.499
37186 15.471
37191 15.457
37196 15.474
37201 15.449
37213 15.479
37225 15.501
37230 15.395
37235 15.419
37240 15.443
37245 15.409
37250 15.48
37255 15.402
37260 15.508
37265 15.516
37271 15.405
37277 15.455
37282 15.458
37287 15.448
37292 15.532
37297 15.467
37302 15.031
37307 15.483
37312 15.461
37317 15.432
37326 15.492
37335 15.483
37341 15.479
37346 15.622
37351 15.503
37356 15.451
37361 15.445
37366 15.469
37371 15.495
37376 15.477
37381 15.456
37386 15.427
37391 15.405
37397 15.451
37402 15.477
37407 15.465
37413 15.517
37418 15.07
37423 15.484
37428 15.507
37433 15.421
37438 15.434
37443 15.463
37448 15.416
37453 15.463
37458 15.407
37463 15.458
37468 15.386
37473 15.438
37478 15.453
37484 15.43
37778 2.865
37783 2.815
37788 2.829
37807 2.773
37848 2.865
37851 2.815
37856 2.781
37861 2.791
37866 2.794
37871 2.772
37876 2.816
37881 2.849
37886 2.882
37891 2.838
37896 2.841
37901 2.876
37906 2.85
37911 2.891
37916 2.822
37921 2.83
37926 2.862
37931 2.902
37936 2.851
37941 2.796
37946 2.835
37950 2.818
37955 2.808
37960 2.81
37965 2.784
37970 2.773
37975 2.837
37980 2.831
37985 2.841
37990 2.849
37996 2.856
38001 2.915
38006 2.873
38011 2.816
38016 2.848
38021 2.808
38026 2.815
38031 2.796
38036 2.823
38041 2.8
38046 2.744
38051 2.764
38056 2.771
38061 2.771
38066 2.772
38071 2.806
38076 2.8
38081 2.776
38086 2.872
38091 2.858
38096 2.848
38101 2.81
38106 2.799
38111 2.803
38116 2.829
38121 2.822
38127 2.806
38129 2.842
38134 2.81
38139 2.796
38144 2.948
38150 2.827
38155 2.824
38160 2.842
38165 2.834
38170 2.818
38175 2.784
38180 2.771
38185 2.819
38189 2.774
38194 2.789
38199 2.788
38204 2.755
38209 2.794
38214 2.774
38215 2.772
38220 2.789
38225 2.851
38230 2.78
38235 2.812
38240 2.778
38241 2.766
38246 2.802
38251 2.817
38256 2.801
38261 2.818
38266 2.842
38271 2.796
38276 2.796
38280 2.866
38281 2.853
38287 2.848
38292 2.867
38297 2.873
38300 2.814
38305 2.858
38310 2.821
38323 2.822
38328 2.858
38333 2.807
38338 2.816
38343 2.766
38348 2.776
38349 2.809
38355 2.795
38361 2.806
38366 2.833
38369 2.863
38374 2.879
38379 2.812
38380 2.84
38385 2.827
38390 2.82
38395 2.846
38400 2.866
38405 2.858
38410 2.906
38415 2.833
38419 2.864
38424 2.854
38429 2.848
38434 2.88
38439 2.859
38444 2.849
38449 2.853
38454 2.804
38459 2.83
38464 2.847
38474 2.836
38475 2.847
38480 2.887
38485 2.867
38490 2.856
38495 2.844
38509 2.834
38510 2.81
38517 2.789
38522 2.798
38527 2.847
38533 2.798
38538 2.793
38539 2.794
38546 2.899
38551 2.836
38556 2.816
38557 2.826
38562 2.831
38567 2.863
38572 2.927
38577 2.857
38581 2.888
38584 2.934
38590 2.791
38595 2.824
38604 2.807
38609 2.845
38615 2.862
38620 2.875
38625 2.886
38626 2.892
38632 2.915
38635 2.909
38640 2.91
38645 2.925
38651 2.917
38656 2.845
38661 2.886
38666 2.884
38671 2.883
38676 2.87
38681 2.874
38686 2.832
38691 2.868
38696 2.868
38702 2.83
38707 2.836
38713 2.825
38718 2.835
38723 2.879
38729 2.894
38735 2.851
38740 2.857
38745 2.834
38750 2.84
38753 2.803
38758 2.797
38763 2.783
38768 2.828
38769 2.842
38775 2.808
38784 2.791
38787 2.82
38792 2.82
38797 2.847
38802 2.815
38803 2.838
38808 2.828
38813 2.837
38817 2.835
38822 2.798
38834 2.818
38839 2.807
38843 2.801
38848 2.849
38853 2.831
38859 2.841
38864 2.809
38869 2.853
38877 2.805
38878 2.829
38883 2.829
38888 2.789
38892 2.806
38896 2.783
38899 2.799
38904 2.796
38909 2.776
38914 2.812
38919 2.784
38924 2.812
38929 2.796
38930 2.798
38935 2.798
38940 2.798
38943 2.8
38948 2.815
38953 2.823
38958 2.822
38962 2.847
38965 2.852
38970 2.855
38975 2.853
38978 2.826
38983 2.809
38988 2.841
38993 2.839
38994 2.841
38999 2.859
39004 2.836
39005 2.826
39010 2.855
39015 2.846
39020 2.887
39021 2.878
39027 2.85
39032 2.834
39033 2.832
39038 2.821
39043 2.833
39047 2.841
39052 2.872
39057 2.846
39062 2.818
39067 2.858
39072 2.821
39077 2.878
39082 2.922
39087 2.823
39098 2.872
39106 2.85
39117 2.869
39120 2.817
39125 2.891
39130 2.898
39135 2.853
39138 2.871
39143 2.871
39148 2.846
39153 2.854
39158 2.874
39164 2.86
39169 2.873
39176 2.875
39177 2.881
39182 2.888
39187 2.865
39192 2.913
39197 2.912
39200 2.885
39205 2.889
39210 2.85
39211 2.868
39221 2.846
39226 2.815
39230 2.791
39235 2.825
39241 2.797
39245 2.817
39250 2.819
39255 2.774
39256 2.834
39261 2.827
39266 2.791
39276 2.818
39283 2.804
39288 2.834
39293 2.826
39294 2.852
39300 2.857
39307 2.844
39313 2.879
39321 2.877
39328 2.874
39334 2.861
39339 2.881
39347 2.864
39352 2.869
39359 2.91
39360 2.887
39365 2.884
39370 2.914
39375 2.883
39388 2.902
39393 2.919
39399 2.903
39404 2.9
39410 2.884
39418 2.895
39428 2.902
39434 2.931
39438 2.911
39447 2.93
39461 2.95
39476 2.928
39481 2.904
39486 2.931
39491 2.915
39496 2.805
39499 2.838
39506 2.851
39511 2.882
39514 2.865
39519 2.838
39524 2.855
39529 2.868
39534 2.837
39539 2.876
39540 2.897
39546 2.889
39547 2.868
39553 2.865
39556 2.865
39561 2.838
39574 2.866
39575 2.865
39580 2.864
39593 2.851
39598 2.811
39603 2.853
39617 2.856
39621 2.819
39626 2.818
39628 2.825
39633 2.826
39639 2.796
39643 2.799
39649 2.793
39681 2.836
39686 2.887
39691 2.331
39696 2.835
39710 2.894
39715 2.877
39720 2.829
39725 2.804
39729 2.818
39735 2.801
39739 2.874
39745 2.862
39747 2.825
39752 2.92
39755 2.804
39760 2.33
39765 2.903
39773 2.881
39779 2.827
39784 2.815
39804 2.833
39810 2.776
39818 2.833
39823 2.833
39828 2.905
39833 2.829
39841 2.818
39853 2.853
39858 2.824
39864 2.862
39869 2.925
39875 2.847
39879 2.8
39884 2.913
39887 2.829
39893 2.863
39898 2.851
39903 2.871
39908 2.871
39923 2.815
39928 2.864
39929 2.851
39934 2.849
39939 2.891
39944 2.836
39945 2.846
39950 2.838
39963 2.876
39968 2.835
39970 2.825
39975 2.875
39987 2.877
39989 2.827
39994 2.901
40000 2.741