de-omicron-wave-results

This repository contains results of a modelling study regarding the spread of SARS-CoV-2 VOC "Omicron" in Germany.

Columns and values

column name	type	description EN	description DE
infectious_period_both	int	Mean infectious period (in days) for both variants	Mittlere Infektiositaetsperiode fuer beide Varianten (in Tagen)
omicron_latent_period	int	Mean latent period of VOC Omicron (in days)	Mittlere Latenzzeit der VOC Omikron (in Tagen)
booster_reach	str	Reach of the booster campaign	Reichweite der Auffrischkampagne
booster_VE	str	Vaccine efficacy of the booster vaccination	Impfeffektivitaet der Auffrischimpfung
contact_reduction_scenario_id	int	ID of the contact reduction scenario	ID des Kontaktreduktionsszenarios
contact_reduction_strength	float	prefactor with which the contact modulation f(t) is multiplied	Vorfaktor, mit der die Kontaktmodulation f(t) waehrend der Kontaktreduktionsperiode skaliert wird
contact_reduction_start	date (ISO 8601)	Date when contact reduction begins	Beginn der Kontaktreduktion
contact_reduction_end	date (ISO 8601)	Date when contact reduction ends	Ende der Kontaktreduktion
relative_risk_hospitalization	float	Relative risk (RR) of hospitalization after infection with Omicron as compared to infection with Delta	Relatives Risiko (RR) der Hospitalisierung nach Infektion mit Omicron gegenueber Infektion mit Delta
relative_risk_icu	float	Relative risk (RR) of ICU admission after infection with Omicron as compared to infection with Delta	Relatives Risiko (RR) der Intensivpflichtigkeit nach Infektion mit Omicron gegenueber Infektion mit Delta
value_type	str	Wich value is shown in the value column	Art des Wertes in der Spalte value
date	date (ISO 8601)	Date associated with the modeling result given in column value	Datum assoziiert mit dem Modellergebnis des Wertes in der Spalte value
value	int	Model result (rounded to nearest integer)	Modellergebnis (gerundet auf ganze Zahl)

Additional columns regarding combinations of plausible scenarios (rounded to nearest integer) and 180 stochastic simulations per parameter combination:

column name	type	description EN	description DE
95_PI_lower	int	95% PI lower bound (rounded to nearest integer)	Untere Schranke des 95% PIs (gerundet auf ganze Zahl)
50_PI_lower	int	50% PI lower bound (rounded to nearest integer)	Untere Schranke des 50% PIs (gerundet auf ganze Zahl)
median	int	median (rounded to nearest integer)	Median (gerundet auf ganze Zahl)
50_PI_upper	int	50% PI upper bound (rounded to nearest integer)	Obere Schranke des 50% PIs (gerundet auf ganze Zahl)
95_PI_upper	int	95% PI upper bound (rounded to nearest integer)	Obere Schranke des 95% PIs (gerundet auf ganze Zahl)

Values: booster_reach

value	description EN	description DE
md	medium booster campaign reach (80% of those that received full vaccination in 2021 receive booster vaccination)	Medium, 80% derjenigen, die in 2021 vollstaendig geimpft wurden, erhalten eine Auffrischimpfung
hi	high booster campaign reach (100% of those that received full vaccination in 2021 receive booster vaccination)	Hoch, 100% derjenigen, die in 2021 vollstaendig geimpft wurden, erhalten eine Auffrischimpfung
hi-and-90perc-2dose	100% receive booster vaccination and vaccine uptake of first immunization suddenly increases to 90% in Jan 2022	100% erhalten Auffrischimpfung und Impfquote der Erstimmunisierung erreicht schnell 90% im Januar 2022

Values: booster_VE

value	description EN	description DE
lo	low booster vaccine efficacy (assumption: booster protects as well against infection as 2nd dose)	Niedrige Impfeffektivitaet (Auffr. schuetzt genauso gut vor Infektion wie 2 Dosen)
hi	high booster vaccine efficacy (assumption: booster protects as well against infection as against symptomatic disease)	Hohe Impfeffektivitaet (Auffr. schuetzt genauso gut vor Infektion wie vor symptomatischer Erkrankung)

Values: value_type

value	description EN	description DE
inc	incidence (absolute number of new reported cases per day)	Inzidenz (Zahl der gemeldeten Neuinfektion an diesem Tag, absolut)
hsp	hospitalization incidence (absolute number of new hospital admissions per day)	Hospitalisierungsinzidenz (Zahl der gemeldeten Neuhospitalisierungen an diesem Tag, absolut)
icu	total number of patients in ICUs	Gesamtzahl der intensivpflichtigen Patient:innen

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