Para algumas aplicações de bioinformática (em geral relacionadas a Machine Learning) é necessário colocar em uma tabela sequências genômicas a serem comoparadas. Este código permite criar uma tabela na qual cada linha é uma sequência, a primeira coluna é o índice com o código da sequência e cada coluna é uma base da sequência. No entando, para poder comparar as alterações de base com este código é necessário que o arquivo fasta seja criado já com as sequências previamente alinhadas.
Python 3, na versão 3.10
Pandas, na versão 1.3.4
TQDM, na versão 4.62.3
Caso ainda não tenhas as bibliotecas instaladas no computador, instalar o pandas com pip install pandas e o tqdm com pip install tqdm pelo prompt.
Caso utilize o Jupyter Notebook, baixar o arquivo de extensão .ipynb e abrir com o Jupyter Notebook. Alterar o nome do arquivo para o arquivo fasta desejado e executar pelo Jupyter.
Caso não utilize o Jupyter Notebook, baixar o arquivo de extensão .py, editar o nome do arquivo (linha 16) para o arquivo fasta desejado e rodar por linha de comando.