The R-script for merging ISSR data replications
Специальный скрипт для запуска в среде R для обработки повторных запусков ISSR на одних и тех же образцах:
issr321_0.2.r
Скрипт считывает исходные матрицы. Сравнивает их между собой и выдает итоговый расчет в N вариантах, где N- число повторностей (= число файлов).
Запускать скрипт можно так:
- Поместить в рабочий каталог папку с исходными данными, сгенерированные GenMapper по одному праймеру. Допустим папка, содержащая файлы, по праймеру P2 называется "P2_data"
- Скопировать в рабочий каталог скрипт "issr321_0.2.r"
- Запустить R
- Перейти в рабочий каталог
- Загрузить в R содержимое скрипта: > source("issr321_0.2.r")
- Запустить функцию issr321, указав в качестве параметров:
- название папки с исходными данными, подлежащими обработке
- минимальную высоту пика, при которой можно учитывать наличие фрагмента (по умолчанию минимальная высота = 50 единицам):