Conda Deletes All Modules During Update #8842
Comments
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It's exactly the same on Linux. |
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The likely reason for this is that update --all frees up all of your constraints to be optional (as they were not explicitly specs) and they get cleaned up. It's definitely a bug. I'd avoid update --all until we can get to the bottom of this. |
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So I get that this is a bug, but I am not clear on where the issue happened. There was a new version of |
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What's happening here is this:
You can restore these by running |
msarahan
added
¡breaking!
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Thanks everyone. I'm glad that everything is restorable, though I wish I had known that before re-installing anaconda. I'm still not clear as to the correct procedure for updating my system. I ran the |
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Yes, that should be fine going forward. The behavior with the metapackage is very undesirable, and we'll be trying to help other people not have that issue in the future. You should be all set, though. |
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actually , i had the same issue on MacOS mojave , and when i tried to use conda install --only-deps anaconda it still wants to remove lots of packages Collecting package metadata (current_repodata.json): done Package Planenvironment location: /anaconda3 added / updated specs: The following packages will be REMOVED: anaconda-project-0.8.3-py_0 |
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Apparently I have a related issue, have been recommended to post here what happened. I work with three different machines, a Linux Mint 19.1 64 bits laptop, a Windows 10 64 bits laptop and a Windows 7 64 bits desktop. I have Anaconda installed on all three machines (base environment only) and I keep them updated. You can find what I did in here (https://groups.google.com/a/continuum.io/forum/#!topic/anaconda/1PxQi3Q_4WQ), I am pasting below just the (partial) error I could retrieve from my console while doing a simple "conda update conda" on the third machine mentioned above (edited username for privacy): """ Proceed ([y]/n)? Downloading and Extracting Packages (base) C:\Users---> |
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And my response from that mailing list post: You have 2 things coming together to ruin your day. One is definitely the issue that I pointed you to. That is causing removal of the console_shortcut package, which takes away your start menu anaconda prompt shortcut. The next is this: #8835 The simplest way to recover is:
This should restore everything, including your start menu shortcuts. Future updates will not mess up, because the explicit dependencies will be in the history now. |
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We are working on fixing the Anaconda metapackage to account for this change in behavior. The change in behavior is expected and desired, but the side effect here with the anaconda metapackage in particular is not. |
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I ran "conda install --only-deps anaconda" but the apps shortcuts are still not displayed on the navigator. I am using a MacOS 10.10.5. Also, I can only create new environments in python2.7. |
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Hi,
I can confirm that on my Linux Mint 19.1 64 bits laptop all the apps also
disappeared from the Anaconda Navigator (but not on the Windows machines).
At this point I am taking a conservative approach and after having to
reinstall Anaconda on all machines (both Linux and Windows) I am not
performing a "conda update conda" until further notice.
BR,
Paulo
Evangelos Constantinou <notifications@github.com> escreveu no dia quarta,
3/07/2019 à(s) 01:00:
… I ran "conda install --only-deps anaconda" but the apps shortcuts are
still not displayed on the navigator. I am using a MacOS 10.10.5.
Also, I can only create new environments in python2.7.
—
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or mute the thread
<https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/ACXPIV6NGIF5WHPOKB2WNHLP5PT3RANCNFSM4H4G6BNA>
.
--
Paulo Xavier Candeias
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I also had the same problem: https://github.com/ContinuumIO/anaconda-issues/issues/11073#issuecomment-508009172
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There are testing packages that will replace the existing anaconda "custom" metapackages up on the c3i_test2 channel: conda install -c c3i_test2 anaconda We are testing these ourselves, and will move them to defaults later today or tomorrow. |
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I am kind of newbie still to this (ana)conda world, but... what if you do not have any longer the metapackage installed? I needed to remove it to update python because of ContinuumIO/anaconda-issues#10822 and if I try to update, the process says it will delete all those packages as well. |
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The new metapackage is uploaded. Further updates might allow updates of more than you expect, but they should no longer go crazy removing things. if you don't have it installed, you can just install it: Sorry for our clumsiness on this one, and thank you for your patience. We'll be writing up a post-mortem next week. If you continue having issues, please post here. |
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@msarahan i still have the same problems, any ideas ? Package Planenvironment location: /anaconda3 added / updated specs: The following packages will be downloaded: The following packages will be REMOVED: alabaster-0.7.12-py37_0 The following packages will be UPDATED: glob2 pkgs/main/osx-64::glob2-0.6-py37_1 --> pkgs/main/noarch::glob2-0.7-py_0 |
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I think I was able to resolve by first doing |
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@aakhmetz yeah that is working fine now, what is the c3i-test3 metapackage ?. thanks a lot anyhow |
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@eltabbal it was a temporary solution proposed in the thread above |
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I had this too after the update. But then i did conda update conda first to get to 4.7.5. Then it worked just fine.
…Sent from my iPhone
On 6 Jul 2019, at 08:07, eltabbal ***@***.***> wrote:
@msarahan i still have the same problems, any ideas ?
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: done
Package Plan
environment location: /anaconda3
added / updated specs:
- anaconda
The following packages will be downloaded:
package | build
---------------------------|-----------------
glob2-0.7 | py_0 14 KB
ipython-7.6.0 | py37h39e3cac_0 1.1 MB
jupyter_core-4.5.0 | py_0 48 KB
parso-0.5.0 | py_0 67 KB
prometheus_client-0.7.1 | py_0 42 KB
psutil-5.6.3 | py37h1de35cc_0 333 KB
python-libarchive-c-2.8 | py37_8 22 KB
pyyaml-5.1.1 | py37h1de35cc_0 170 KB
qtpy-1.8.0 | py_0 38 KB
tornado-6.0.3 | py37h1de35cc_0 644 KB
------------------------------------------------------------
Total: 2.5 MB
The following packages will be REMOVED:
alabaster-0.7.12-py37_0
anaconda-project-0.8.3-py_0
appscript-1.1.0-py37h1de35cc_0
astroid-2.2.5-py37_0
astropy-3.2.1-py37h1de35cc_0
atomicwrites-1.3.0-py37_1
babel-2.7.0-py_0
backports.os-0.1.1-py37_0
backports.shutil_get_terminal_size-1.0.0-py37_2
bitarray-0.9.3-py37h1de35cc_0
bkcharts-0.2-py37_0
blas-1.0-mkl
blosc-1.16.3-hd9629dc_0
bokeh-1.2.0-py37_0
boto-2.49.0-py37_0
bottleneck-1.2.1-py37h1d22016_1
cloudpickle-1.1.1-py_0
colorama-0.4.1-py37_0
contextlib2-0.5.5-py37_0
cycler-0.10.0-py37_0
cython-0.29.10-py37h0a44026_0
cytoolz-0.9.0.1-py37h1de35cc_1
dask-2.0.0-py_0
dask-core-2.0.0-py_0
distributed-2.0.1-py_0
docutils-0.14-py37_0
et_xmlfile-1.0.1-py37_0
fastcache-1.1.0-py37h1de35cc_0
flask-1.0.3-py37_0
get_terminal_size-1.0.0-h7520d66_0
gevent-1.4.0-py37h1de35cc_0
gmp-6.1.2-hb37e062_1
gmpy2-2.0.8-py37h6ef4df4_2
greenlet-0.4.15-py37h1de35cc_0
h5py-2.9.0-py37h3134771_0
hdf5-1.10.4-hfa1e0ec_0
heapdict-1.0.0-py37_2
html5lib-1.0.1-py37_0
imageio-2.5.0-py37_0
imagesize-1.1.0-py37_0
importlib_metadata-0.17-py37_1
intel-openmp-2019.4-233
isort-4.3.20-py37_0
itsdangerous-1.1.0-py37_0
jbig-2.1-h4d881f8_0
jdcal-1.4.1-py_0
joblib-0.13.2-py37_0
jupyter-1.0.0-py37_7
jupyter_console-6.0.0-py37_0
keyring-18.0.0-py37_0
kiwisolver-1.1.0-py37h0a44026_0
lazy-object-proxy-1.4.1-py37h1de35cc_0
libxslt-1.1.33-h33a18ac_0
llvmlite-0.29.0-py37h98b8051_0
locket-0.2.0-py37_1
lxml-4.3.3-py37hef8c89e_0
matplotlib-3.1.0-py37h54f8f79_0
mccabe-0.6.1-py37_1
mkl-2019.4-233
mkl-service-2.0.2-py37h1de35cc_0
mkl_fft-1.0.12-py37h5e564d8_0
mkl_random-1.0.2-py37h27c97d8_0
mock-3.0.5-py37_0
more-itertools-7.0.0-py37_0
mpc-1.1.0-h6ef4df4_1
mpfr-4.0.1-h3018a27_3
mpmath-1.1.0-py37_0
msgpack-python-0.6.1-py37h04f5b5a_1
multipledispatch-0.6.0-py37_0
networkx-2.3-py_0
nltk-3.4.1-py37_0
nose-1.3.7-py37_2
numba-0.44.1-py37h6440ff4_0
numexpr-2.6.9-py37h7413580_0
numpy-1.16.4-py37hacdab7b_0
numpy-base-1.16.4-py37h6575580_0
numpydoc-0.9.1-py_0
openpyxl-2.6.2-py_0
packaging-19.0-py37_0
pandas-0.24.2-py37h0a44026_0
partd-0.3.10-py37_1
path.py-12.0.1-py_0
pathlib2-2.3.3-py37_0
patsy-0.5.1-py37_0
pep8-1.7.1-py37_0
pluggy-0.12.0-py_0
ply-3.11-py37_0
py-1.8.0-py37_0
pycodestyle-2.5.0-py37_0
pycrypto-2.6.1-py37h1de35cc_9
pycurl-7.43.0.2-py37ha12b0ac_0
pyflakes-2.1.1-py37_0
pylint-2.3.1-py37_0
pyodbc-4.0.26-py37h0a44026_0
pyparsing-2.4.0-py_0
pytables-3.5.2-py37h5bccee9_1
pytest-4.6.2-py37_0
pytest-arraydiff-0.3-py37h39e3cac_0
pytest-astropy-0.5.0-py37_0
pytest-doctestplus-0.3.0-py37_0
pytest-openfiles-0.3.2-py37_0
pytest-remotedata-0.3.1-py37_0
pywavelets-1.0.3-py37h1d22016_1
qtawesome-0.5.7-py37_1
qtconsole-4.5.1-py_0
rope-0.14.0-py_0
scikit-image-0.15.0-py37h0a44026_0
scikit-learn-0.21.2-py37h27c97d8_0
scipy-1.2.1-py37h1410ff5_0
seaborn-0.9.0-py37_0
simplegeneric-0.8.1-py37_2
singledispatch-3.4.0.3-py37_0
snappy-1.1.7-he62c110_3
snowballstemmer-1.2.1-py37_0
sortedcollections-1.1.2-py37_0
sortedcontainers-2.1.0-py37_0
sphinx-2.1.0-py_0
sphinxcontrib-1.0-py37_1
sphinxcontrib-applehelp-1.0.1-py_0
sphinxcontrib-devhelp-1.0.1-py_0
sphinxcontrib-htmlhelp-1.0.2-py_0
sphinxcontrib-jsmath-1.0.1-py_0
sphinxcontrib-qthelp-1.0.2-py_0
sphinxcontrib-serializinghtml-1.1.3-py_0
sphinxcontrib-websupport-1.1.2-py_0
spyder-3.3.4-py37_0
spyder-kernels-0.5.0-py37_0
sqlalchemy-1.3.4-py37h1de35cc_0
statsmodels-0.9.0-py37h1d22016_0
sympy-1.4-py37_0
tblib-1.4.0-py_0
toolz-0.9.0-py37_0
unicodecsv-0.14.1-py37_0
werkzeug-0.15.4-py_0
wrapt-1.11.1-py37h1de35cc_0
wurlitzer-1.0.2-py37_0
xlrd-1.2.0-py37_0
xlsxwriter-1.1.8-py_0
xlwings-0.15.8-py37_0
xlwt-1.3.0-py37_0
zict-0.1.4-py37_0
zipp-0.5.1-py_0
The following packages will be UPDATED:
glob2 pkgs/main/osx-64::glob2-0.6-py37_1 --> pkgs/main/noarch::glob2-0.7-py_0
ipython 7.5.0-py37h39e3cac_0 --> 7.6.0-py37h39e3cac_0
jupyter_core pkgs/main/osx-64::jupyter_core-4.4.0-~ --> pkgs/main/noarch::jupyter_core-4.5.0-py_0
parso 0.4.0-py_0 --> 0.5.0-py_0
prometheus_client pkgs/main/osx-64::prometheus_client-0~ --> pkgs/main/noarch::prometheus_client-0.7.1-py_0
psutil 5.6.2-py37h1de35cc_0 --> 5.6.3-py37h1de35cc_0
python-libarchive~ 2.8-py37_6 --> 2.8-py37_8
pyyaml 5.1-py37h1de35cc_0 --> 5.1.1-py37h1de35cc_0
qtpy 1.7.1-py_0 --> 1.8.0-py_0
tornado 6.0.2-py37h1de35cc_0 --> 6.0.3-py37h1de35cc_0
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Thanks for your patience. We have reproduced it and are looking into it.
…On Thu, Jul 11, 2019 at 11:27 AM o12johns ***@***.***> wrote:
Sorry, msarahan, but this problem is not gone. I did a clean install of
2019.03, then did conda upgrade --all and then did conda upgrade --all
again. The following is what happened. This is on an iMac running MacOS
Mojave 10.14.5.
108-211-183-124:~ ojohns$ conda upgrade --all
WARNING: The conda.compat module is deprecated and will be removed in a
future release.
Collecting package metadata: done
Solving environment: done
Package Plan
environment location: /Users/ojohns/anaconda3
The following packages will be downloaded:
package | build
---------------------------|-----------------
_anaconda_depends-2019.03 | py37_0 5 KB
anaconda-custom | py37_1 3 KB
anaconda-project-0.8.3 | py_0 212 KB
astropy-3.2.1 | py37h1de35cc_0 6.9 MB
babel-2.7.0 | py_0 5.8 MB
backports-1.0 | py_2 139 KB
backports.functools_lru_cache-1.5| py_2 9 KB
backports.tempfile-1.0 | py_1 12 KB
backports.weakref-1.0.post1| py_1 7 KB
bitarray-0.9.3 | py37h1de35cc_0 59 KB
blosc-1.16.3 | hd9629dc_0 64 KB
bokeh-1.2.0 | py37_0 3.9 MB
bzip2-1.0.7 | h1de35cc_0 104 KB
ca-certificates-2019.5.15 | 0 133 KB
certifi-2019.6.16 | py37_0 154 KB
cffi-1.12.3 | py37hb5b8e2f_0 214 KB
cloudpickle-1.2.1 | py_0 28 KB
conda-4.7.5 | py37_0 3.0 MB
conda-build-3.18.7 | py37_0 528 KB
conda-package-handling-1.3.11| py37_0 260 KB
conda-verify-3.4.2 | py_0 25 KB
cryptography-2.7 | py37ha12b0ac_0 571 KB
curl-7.64.1 | ha441bb4_0 131 KB
cython-0.29.11 | py37h0a44026_0 2.0 MB
dask-2.1.0 | py_0 11 KB
dask-core-2.1.0 | py_0 578 KB
defusedxml-0.6.0 | py_0 23 KB
distributed-2.1.0 | py_0 369 KB
fastcache-1.1.0 | py37h1de35cc_0 29 KB
filelock-3.0.12 | py_0 12 KB
flask-1.0.3 | py37_0 123 KB
glob2-0.7 | py_0 14 KB
importlib_metadata-0.17 | py37_1 39 KB
intel-openmp-2019.4 | 233 1.1 MB
ipykernel-5.1.1 | py37h39e3cac_0 162 KB
ipython-7.6.1 | py37h39e3cac_0 1.1 MB
isort-4.3.21 | py37_0 68 KB
jdcal-1.4.1 | py_0 11 KB
jinja2-2.10.1 | py37_0 188 KB
joblib-0.13.2 | py37_0 367 KB
jupyter_core-4.5.0 | py_0 48 KB
jupyterlab-0.35.5 | py37hf63ae98_0 10.6 MB
kiwisolver-1.1.0 | py37h0a44026_0 60 KB
lazy-object-proxy-1.4.1 | py37h1de35cc_0 28 KB
libcurl-7.64.1 | h051b688_0 546 KB
libpng-1.6.37 | ha441bb4_0 325 KB
libssh2-1.8.2 | ha12b0ac_0 221 KB
libxml2-2.9.9 | hf6e021a_1 1.9 MB
llvm-openmp-4.0.1 | hcfea43d_1 454 KB
llvmlite-0.29.0 | py37h98b8051_0 13.7 MB
lxml-4.3.4 | py37hef8c89e_0 1.3 MB
matplotlib-3.1.0 | py37h54f8f79_0 6.6 MB
mkl-2019.4 | 233 155.2 MB
mkl-service-2.0.2 | py37h1de35cc_0 51 KB
mkl_fft-1.0.12 | py37h5e564d8_0 155 KB
mock-3.0.5 | py37_0 47 KB
more-itertools-7.0.0 | py37_0 93 KB
nbconvert-5.5.0 | py_0 381 KB
networkx-2.3 | py_0 1.1 MB
nltk-3.4.3 | py37_0 2.1 MB
numba-0.44.1 | py37h6440ff4_0 2.8 MB
numpy-1.16.4 | py37hacdab7b_0 49 KB
numpy-base-1.16.4 | py37h6575580_0 4.2 MB
numpydoc-0.9.1 | py_0 31 KB
openpyxl-2.6.2 | py_0 157 KB
openssl-1.1.1c | h1de35cc_1 3.4 MB
parso-0.5.0 | py_0 67 KB
partd-1.0.0 | py_0 19 KB
path.py-12.0.1 | py_0 23 KB
pathlib2-2.3.4 | py37_0 36 KB
pexpect-4.7.0 | py37_0 82 KB
pillow-6.0.0 | py37hb68e598_0 579 KB
pip-19.1.1 | py37_0 1.8 MB
pluggy-0.12.0 | py_0 20 KB
prometheus_client-0.7.1 | py_0 42 KB
psutil-5.6.3 | py37h1de35cc_0 333 KB
pycurl-7.43.0.3 | py37ha12b0ac_0 71 KB
pygments-2.4.2 | py_0 664 KB
pyparsing-2.4.0 | py_0 58 KB
pysocks-1.7.0 | py37_0 29 KB
pytables-3.5.2 | py37h5bccee9_1 1.4 MB
pytest-5.0.0 | py37_0 358 KB
python-libarchive-c-2.8 | py37_10 22 KB
pytz-2019.1 | py_0 236 KB
pywavelets-1.0.3 | py37h1d22016_1 4.2 MB
pyyaml-5.1.1 | py37h1de35cc_0 170 KB
qtconsole-4.5.1 | py_0 92 KB
qtpy-1.8.0 | py_0 38 KB
requests-2.22.0 | py37_0 89 KB
rope-0.14.0 | py_0 113 KB
scikit-image-0.15.0 | py37h0a44026_0 27.6 MB
scikit-learn-0.21.2 | py37h27c97d8_0 5.9 MB
setuptools-41.0.1 | py37_0 635 KB
snowballstemmer-1.9.0 | py_0 53 KB
sphinx-2.1.2 | py_0 1.4 MB
sphinxcontrib-applehelp-1.0.1| py_0 29 KB
sphinxcontrib-devhelp-1.0.1| py_0 23 KB
sphinxcontrib-htmlhelp-1.0.2| py_0 28 KB
sphinxcontrib-jsmath-1.0.1 | py_0 8 KB
sphinxcontrib-qthelp-1.0.2 | py_0 26 KB
sphinxcontrib-serializinghtml-1.1.3| py_0 24 KB
sphinxcontrib-websupport-1.1.2| py_0 35 KB
spyder-3.3.5 | py37_0 2.5 MB
spyder-kernels-0.5.0 | py37_0 69 KB
sqlalchemy-1.3.5 | py37h1de35cc_0 1.7 MB
sqlite-3.28.0 | ha441bb4_0 2.3 MB
statsmodels-0.10.0 | py37h1d22016_0 8.8 MB
sympy-1.4 | py37_0 9.7 MB
tblib-1.4.0 | py_0 14 KB
terminado-0.8.2 | py37_0 22 KB
tornado-6.0.3 | py37h1de35cc_0 644 KB
tqdm-4.32.1 | py_0 48 KB
urllib3-1.24.2 | py37_0 152 KB
werkzeug-0.15.4 | py_0 262 KB
wheel-0.33.4 | py37_0 39 KB
wrapt-1.11.2 | py37h1de35cc_0 44 KB
xlsxwriter-1.1.8 | py_0 105 KB
xlwings-0.15.8 | py37_0 464 KB
zict-1.0.0 | py_0 12 KB
zipp-0.5.1 | py_0 8 KB
------------------------------------------------------------
Total: 307.1 MB
The following NEW packages will be INSTALLED:
_anaconda_depends pkgs/main/osx-64::_anaconda_depends-2019.03-py37_0
backports.functoo~ pkgs/main/noarch::backports.functools_lru_cache-1.5-py_2
backports.tempfile pkgs/main/noarch::backports.tempfile-1.0-py_1
backports.weakref pkgs/main/noarch::backports.weakref-1.0.post1-py_1
conda-package-han~ pkgs/main/osx-64::conda-package-handling-1.3.11-py37_0
joblib pkgs/main/osx-64::joblib-0.13.2-py37_0
llvm-openmp pkgs/main/osx-64::llvm-openmp-4.0.1-hcfea43d_1
mock pkgs/main/osx-64::mock-3.0.5-py37_0
sphinxcontrib-app~ pkgs/main/noarch::sphinxcontrib-applehelp-1.0.1-py_0
sphinxcontrib-dev~ pkgs/main/noarch::sphinxcontrib-devhelp-1.0.1-py_0
sphinxcontrib-htm~ pkgs/main/noarch::sphinxcontrib-htmlhelp-1.0.2-py_0
sphinxcontrib-jsm~ pkgs/main/noarch::sphinxcontrib-jsmath-1.0.1-py_0
sphinxcontrib-qth~ pkgs/main/noarch::sphinxcontrib-qthelp-1.0.2-py_0
sphinxcontrib-ser~
pkgs/main/noarch::sphinxcontrib-serializinghtml-1.1.3-py_0
The following packages will be UPDATED:
anaconda-project pkgs/main/osx-64::anaconda-project-0.~ -->
pkgs/main/noarch::anaconda-project-0.8.3-py_0
astropy 3.1.2-py37h1de35cc_0 --> 3.2.1-py37h1de35cc_0
babel pkgs/main/osx-64::babel-2.6.0-py37_0 -->
pkgs/main/noarch::babel-2.7.0-py_0
backports pkgs/main/osx-64::backports-1.0-py37_1 -->
pkgs/main/noarch::backports-1.0-py_2
bitarray 0.8.3-py37h1de35cc_0 --> 0.9.3-py37h1de35cc_0
blosc 1.15.0-hd9629dc_0 --> 1.16.3-hd9629dc_0
bokeh 1.0.4-py37_0 --> 1.2.0-py37_0
bzip2 1.0.6-h1de35cc_5 --> 1.0.7-h1de35cc_0
ca-certificates 2019.1.23-0 --> 2019.5.15-0
certifi 2019.3.9-py37_0 --> 2019.6.16-py37_0
cffi 1.12.2-py37hb5b8e2f_1 --> 1.12.3-py37hb5b8e2f_0
cloudpickle pkgs/main/osx-64::cloudpickle-0.8.0-p~ -->
pkgs/main/noarch::cloudpickle-1.2.1-py_0
conda 4.6.11-py37_0 --> 4.7.5-py37_0
conda-build 3.17.8-py37_0 --> 3.18.7-py37_0
conda-verify pkgs/main/osx-64::conda-verify-3.1.1-~ -->
pkgs/main/noarch::conda-verify-3.4.2-py_0
cryptography 2.6.1-py37ha12b0ac_0 --> 2.7-py37ha12b0ac_0
curl 7.64.0-ha441bb4_2 --> 7.64.1-ha441bb4_0
cython 0.29.6-py37h0a44026_0 --> 0.29.11-py37h0a44026_0
dask pkgs/main/osx-64::dask-1.1.4-py37_1 -->
pkgs/main/noarch::dask-2.1.0-py_0
dask-core pkgs/main/osx-64::dask-core-1.1.4-py3~ -->
pkgs/main/noarch::dask-core-2.1.0-py_0
defusedxml pkgs/main/osx-64::defusedxml-0.5.0-py~ -->
pkgs/main/noarch::defusedxml-0.6.0-py_0
distributed pkgs/main/osx-64::distributed-1.26.0-~ -->
pkgs/main/noarch::distributed-2.1.0-py_0
fastcache 1.0.2-py37h1de35cc_2 --> 1.1.0-py37h1de35cc_0
filelock pkgs/main/osx-64::filelock-3.0.10-py3~ -->
pkgs/main/noarch::filelock-3.0.12-py_0
flask 1.0.2-py37_1 --> 1.0.3-py37_0
glob2 pkgs/main/osx-64::glob2-0.6-py37_1 -->
pkgs/main/noarch::glob2-0.7-py_0
importlib_metadata 0.8-py37_0 --> 0.17-py37_1
intel-openmp 2019.3-199 --> 2019.4-233
ipykernel 5.1.0-py37h39e3cac_0 --> 5.1.1-py37h39e3cac_0
ipython 7.4.0-py37h39e3cac_0 --> 7.6.1-py37h39e3cac_0
isort 4.3.16-py37_0 --> 4.3.21-py37_0
jdcal pkgs/main/osx-64::jdcal-1.4-py37_0 -->
pkgs/main/noarch::jdcal-1.4.1-py_0
jinja2 2.10-py37_0 --> 2.10.1-py37_0
jupyter_core pkgs/main/osx-64::jupyter_core-4.4.0-~ -->
pkgs/main/noarch::jupyter_core-4.5.0-py_0
jupyterlab 0.35.4-py37hf63ae98_0 --> 0.35.5-py37hf63ae98_0
kiwisolver 1.0.1-py37h0a44026_0 --> 1.1.0-py37h0a44026_0
lazy-object-proxy 1.3.1-py37h1de35cc_2 --> 1.4.1-py37h1de35cc_0
libcurl 7.64.0-h051b688_2 --> 7.64.1-h051b688_0
libpng 1.6.36-ha441bb4_0 --> 1.6.37-ha441bb4_0
libssh2 1.8.0-ha12b0ac_4 --> 1.8.2-ha12b0ac_0
libxml2 2.9.9-hab757c2_0 --> 2.9.9-hf6e021a_1
llvmlite 0.28.0-py37h8c7ce04_0 --> 0.29.0-py37h98b8051_0
lxml 4.3.2-py37hef8c89e_0 --> 4.3.4-py37hef8c89e_0
matplotlib 3.0.3-py37h54f8f79_0 --> 3.1.0-py37h54f8f79_0
mkl 2019.3-199 --> 2019.4-233
mkl-service 1.1.2-py37hfbe908c_5 --> 2.0.2-py37h1de35cc_0
mkl_fft 1.0.10-py37h5e564d8_0 --> 1.0.12-py37h5e564d8_0
more-itertools 6.0.0-py37_0 --> 7.0.0-py37_0
nbconvert pkgs/main/osx-64::nbconvert-5.4.1-py3~ -->
pkgs/main/noarch::nbconvert-5.5.0-py_0
networkx pkgs/main/osx-64::networkx-2.2-py37_1 -->
pkgs/main/noarch::networkx-2.3-py_0
nltk 3.4-py37_1 --> 3.4.3-py37_0
numba 0.43.1-py37h6440ff4_0 --> 0.44.1-py37h6440ff4_0
numpy 1.16.2-py37hacdab7b_0 --> 1.16.4-py37hacdab7b_0
numpy-base 1.16.2-py37h6575580_0 --> 1.16.4-py37h6575580_0
numpydoc pkgs/main/osx-64::numpydoc-0.8.0-py37~ -->
pkgs/main/noarch::numpydoc-0.9.1-py_0
openpyxl pkgs/main/osx-64::openpyxl-2.6.1-py37~ -->
pkgs/main/noarch::openpyxl-2.6.2-py_0
openssl 1.1.1b-h1de35cc_1 --> 1.1.1c-h1de35cc_1
parso pkgs/main/osx-64::parso-0.3.4-py37_0 -->
pkgs/main/noarch::parso-0.5.0-py_0
partd pkgs/main/osx-64::partd-0.3.10-py37_1 -->
pkgs/main/noarch::partd-1.0.0-py_0
path.py pkgs/main/osx-64::path.py-11.5.0-py37~ -->
pkgs/main/noarch::path.py-12.0.1-py_0
pathlib2 2.3.3-py37_0 --> 2.3.4-py37_0
pexpect 4.6.0-py37_0 --> 4.7.0-py37_0
pillow 5.4.1-py37hb68e598_0 --> 6.0.0-py37hb68e598_0
pip 19.0.3-py37_0 --> 19.1.1-py37_0
pluggy pkgs/main/osx-64::pluggy-0.9.0-py37_0 -->
pkgs/main/noarch::pluggy-0.12.0-py_0
prometheus_client pkgs/main/osx-64::prometheus_client-0~ -->
pkgs/main/noarch::prometheus_client-0.7.1-py_0
psutil 5.6.1-py37h1de35cc_0 --> 5.6.3-py37h1de35cc_0
pycurl 7.43.0.2-py37ha12b0ac_0 --> 7.43.0.3-py37ha12b0ac_0
pygments pkgs/main/osx-64::pygments-2.3.1-py37~ -->
pkgs/main/noarch::pygments-2.4.2-py_0
pyparsing pkgs/main/osx-64::pyparsing-2.3.1-py3~ -->
pkgs/main/noarch::pyparsing-2.4.0-py_0
pysocks 1.6.8-py37_0 --> 1.7.0-py37_0
pytables 3.5.1-py37h5bccee9_0 --> 3.5.2-py37h5bccee9_1
pytest 4.3.1-py37_0 --> 5.0.0-py37_0
python-libarchive~ 2.8-py37_6 --> 2.8-py37_10
pytz pkgs/main/osx-64::pytz-2018.9-py37_0 -->
pkgs/main/noarch::pytz-2019.1-py_0
pywavelets 1.0.2-py37h1d22016_0 --> 1.0.3-py37h1d22016_1
pyyaml 5.1-py37h1de35cc_0 --> 5.1.1-py37h1de35cc_0
qtconsole pkgs/main/osx-64::qtconsole-4.4.3-py3~ -->
pkgs/main/noarch::qtconsole-4.5.1-py_0
qtpy pkgs/main/osx-64::qtpy-1.7.0-py37_1 -->
pkgs/main/noarch::qtpy-1.8.0-py_0
requests 2.21.0-py37_0 --> 2.22.0-py37_0
rope pkgs/main/osx-64::rope-0.12.0-py37_0 -->
pkgs/main/noarch::rope-0.14.0-py_0
scikit-image 0.14.2-py37h0a44026_0 --> 0.15.0-py37h0a44026_0
scikit-learn 0.20.3-py37h27c97d8_0 --> 0.21.2-py37h27c97d8_0
setuptools 40.8.0-py37_0 --> 41.0.1-py37_0
snowballstemmer pkgs/main/osx-64::snowballstemmer-1.2~ -->
pkgs/main/noarch::snowballstemmer-1.9.0-py_0
sphinx pkgs/main/osx-64::sphinx-1.8.5-py37_0 -->
pkgs/main/noarch::sphinx-2.1.2-py_0
sphinxcontrib-web~ pkgs/main/osx-64::sphinxcontrib-websu~ -->
pkgs/main/noarch::sphinxcontrib-websupport-1.1.2-py_0
spyder 3.3.3-py37_0 --> 3.3.5-py37_0
spyder-kernels 0.4.2-py37_0 --> 0.5.0-py37_0
sqlalchemy 1.3.1-py37h1de35cc_0 --> 1.3.5-py37h1de35cc_0
sqlite 3.27.2-ha441bb4_0 --> 3.28.0-ha441bb4_0
statsmodels 0.9.0-py37h1d22016_0 --> 0.10.0-py37h1d22016_0
sympy 1.3-py37_0 --> 1.4-py37_0
tblib pkgs/main/osx-64::tblib-1.3.2-py37_0 -->
pkgs/main/noarch::tblib-1.4.0-py_0
terminado 0.8.1-py37_1 --> 0.8.2-py37_0
tornado 6.0.2-py37h1de35cc_0 --> 6.0.3-py37h1de35cc_0
tqdm pkgs/main/osx-64::tqdm-4.31.1-py37_1 -->
pkgs/main/noarch::tqdm-4.32.1-py_0
urllib3 1.24.1-py37_0 --> 1.24.2-py37_0
werkzeug pkgs/main/osx-64::werkzeug-0.14.1-py3~ -->
pkgs/main/noarch::werkzeug-0.15.4-py_0
wheel 0.33.1-py37_0 --> 0.33.4-py37_0
wrapt 1.11.1-py37h1de35cc_0 --> 1.11.2-py37h1de35cc_0
xlsxwriter pkgs/main/osx-64::xlsxwriter-1.1.5-py~ -->
pkgs/main/noarch::xlsxwriter-1.1.8-py_0
xlwings 0.15.4-py37_0 --> 0.15.8-py37_0
zict pkgs/main/osx-64::zict-0.1.4-py37_0 -->
pkgs/main/noarch::zict-1.0.0-py_0
zipp pkgs/main/osx-64::zipp-0.3.3-py37_1 -->
pkgs/main/noarch::zipp-0.5.1-py_0
The following packages will be DOWNGRADED:
anaconda 2019.03-py37_0 --> custom-py37_1
Proceed ([y]/n)? y
Downloading and Extracting Packages
conda-verify-3.4.2 | 25 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
kiwisolver-1.1.0 | 60 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
sphinxcontrib-appleh | 29 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
openpyxl-2.6.2 | 157 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
libxml2-2.9.9 | 1.9 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
flask-1.0.3 | 123 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
cython-0.29.11 | 2.0 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
libssh2-1.8.2 | 221 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
tblib-1.4.0 | 14 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
statsmodels-0.10.0 | 8.8 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
tornado-6.0.3 | 644 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
bitarray-0.9.3 | 59 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
sphinxcontrib-htmlhe | 28 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
sphinxcontrib-jsmath | 8 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
sphinxcontrib-qthelp | 26 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
libcurl-7.64.1 | 546 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
bzip2-1.0.7 | 104 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
pysocks-1.7.0 | 29 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
conda-4.7.5 | 3.0 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
qtpy-1.8.0 | 38 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
isort-4.3.21 | 68 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
lazy-object-proxy-1. | 28 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
path.py-12.0.1 | 23 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
partd-1.0.0 | 19 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
pip-19.1.1 | 1.8 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
scikit-image-0.15.0 | 27.6 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
psutil-5.6.3 | 333 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
pathlib2-2.3.4 | 36 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
ca-certificates-2019 | 133 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
pyparsing-2.4.0 | 58 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
pluggy-0.12.0 | 20 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
setuptools-41.0.1 | 635 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
jinja2-2.10.1 | 188 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
babel-2.7.0 | 5.8 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
conda-package-handli | 260 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
sympy-1.4 | 9.7 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
bokeh-1.2.0 | 3.9 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
mkl-2019.4 | 155.2 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
numpy-1.16.4 | 49 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
anaconda-custom | 3 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
jdcal-1.4.1 | 11 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
distributed-2.1.0 | 369 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
xlsxwriter-1.1.8 | 105 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
urllib3-1.24.2 | 152 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
terminado-0.8.2 | 22 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
cloudpickle-1.2.1 | 28 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
nltk-3.4.3 | 2.1 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
jupyterlab-0.35.5 | 10.6 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
openssl-1.1.1c | 3.4 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
pexpect-4.7.0 | 82 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
matplotlib-3.1.0 | 6.6 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
wrapt-1.11.2 | 44 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
numpy-base-1.16.4 | 4.2 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
parso-0.5.0 | 67 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
backports.tempfile-1 | 12 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
pillow-6.0.0 | 579 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
backports-1.0 | 139 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
spyder-kernels-0.5.0 | 69 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
numpydoc-0.9.1 | 31 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
blosc-1.16.3 | 64 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
pyyaml-5.1.1 | 170 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
llvm-openmp-4.0.1 | 454 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
pytest-5.0.0 | 358 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
glob2-0.7 | 14 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
joblib-0.13.2 | 367 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
sqlalchemy-1.3.5 | 1.7 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
wheel-0.33.4 | 39 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
cryptography-2.7 | 571 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
sphinxcontrib-websup | 35 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
ipykernel-5.1.1 | 162 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
pycurl-7.43.0.3 | 71 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
mkl-service-2.0.2 | 51 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
zict-1.0.0 | 12 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
backports.weakref-1. | 7 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
spyder-3.3.5 | 2.5 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
numba-0.44.1 | 2.8 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
astropy-3.2.1 | 6.9 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
qtconsole-4.5.1 | 92 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
anaconda-project-0.8 | 212 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
prometheus_client-0. | 42 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
mock-3.0.5 | 47 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
werkzeug-0.15.4 | 262 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
conda-build-3.18.7 | 528 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
nbconvert-5.5.0 | 381 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
ipython-7.6.1 | 1.1 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
sqlite-3.28.0 | 2.3 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
dask-core-2.1.0 | 578 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
llvmlite-0.29.0 | 13.7 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
libpng-1.6.37 | 325 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
python-libarchive-c- | 22 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
dask-2.1.0 | 11 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
xlwings-0.15.8 | 464 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
backports.functools_ | 9 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
fastcache-1.1.0 | 29 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
cffi-1.12.3 | 214 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
zipp-0.5.1 | 8 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
pytables-3.5.2 | 1.4 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
pygments-2.4.2 | 664 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
pywavelets-1.0.3 | 4.2 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
certifi-2019.6.16 | 154 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
networkx-2.3 | 1.1 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
defusedxml-0.6.0 | 23 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
pytz-2019.1 | 236 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
scikit-learn-0.21.2 | 5.9 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
rope-0.14.0 | 113 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
_anaconda_depends-20 | 5 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
requests-2.22.0 | 89 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
filelock-3.0.12 | 12 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
intel-openmp-2019.4 | 1.1 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
tqdm-4.32.1 | 48 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
snowballstemmer-1.9. | 53 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
importlib_metadata-0 | 39 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
jupyter_core-4.5.0 | 48 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
sphinxcontrib-devhel | 23 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
mkl_fft-1.0.12 | 155 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
curl-7.64.1 | 131 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
lxml-4.3.4 | 1.3 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
more-itertools-7.0.0 | 93 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
sphinxcontrib-serial | 24 KB |
#########################################################################################################################################
| 100%
sphinx-2.1.2 | 1.4 MB |
#########################################################################################################################################
| 100%
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done
108-211-183-124:~ ojohns$ conda upgrade --all
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: done
Package Plan
environment location: /Users/ojohns/anaconda3
The following packages will be REMOVED:
_anaconda_depends-2019.03-py37_0
alabaster-0.7.12-py37_0
anaconda-custom-py37_1
anaconda-project-0.8.3-py_0
appscript-1.1.0-py37h1de35cc_0
astroid-2.2.5-py37_0
astropy-3.2.1-py37h1de35cc_0
atomicwrites-1.3.0-py37_1
babel-2.7.0-py_0
backports.os-0.1.1-py37_0
backports.shutil_get_terminal_size-1.0.0-py37_2
bitarray-0.9.3-py37h1de35cc_0
bkcharts-0.2-py37_0
blas-1.0-mkl
blosc-1.16.3-hd9629dc_0
bokeh-1.2.0-py37_0
boto-2.49.0-py37_0
bottleneck-1.2.1-py37h1d22016_1
cloudpickle-1.2.1-py_0
colorama-0.4.1-py37_0
contextlib2-0.5.5-py37_0
curl-7.64.1-ha441bb4_0
cycler-0.10.0-py37_0
cython-0.29.11-py37h0a44026_0
cytoolz-0.9.0.1-py37h1de35cc_1
dask-2.1.0-py_0
dask-core-2.1.0-py_0
distributed-2.1.0-py_0
docutils-0.14-py37_0
et_xmlfile-1.0.1-py37_0
fastcache-1.1.0-py37h1de35cc_0
flask-1.0.3-py37_0
get_terminal_size-1.0.0-h7520d66_0
gevent-1.4.0-py37h1de35cc_0
gmp-6.1.2-hb37e062_1
gmpy2-2.0.8-py37h6ef4df4_2
greenlet-0.4.15-py37h1de35cc_0
h5py-2.9.0-py37h3134771_0
hdf5-1.10.4-hfa1e0ec_0
heapdict-1.0.0-py37_2
html5lib-1.0.1-py37_0
imageio-2.5.0-py37_0
imagesize-1.1.0-py37_0
importlib_metadata-0.17-py37_1
intel-openmp-2019.4-233
isort-4.3.21-py37_0
itsdangerous-1.1.0-py37_0
jbig-2.1-h4d881f8_0
jdcal-1.4.1-py_0
joblib-0.13.2-py37_0
jupyter-1.0.0-py37_7
jupyter_console-6.0.0-py37_0
keyring-18.0.0-py37_0
kiwisolver-1.1.0-py37h0a44026_0
krb5-1.16.1-hddcf347_7
lazy-object-proxy-1.4.1-py37h1de35cc_0
libcurl-7.64.1-h051b688_0
libgfortran-3.0.1-h93005f0_2
libssh2-1.8.2-ha12b0ac_0
libxslt-1.1.33-h33a18ac_0
llvm-openmp-4.0.1-hcfea43d_1
llvmlite-0.29.0-py37h98b8051_0
locket-0.2.0-py37_1
lxml-4.3.4-py37hef8c89e_0
matplotlib-3.1.0-py37h54f8f79_0
mccabe-0.6.1-py37_1
mkl-2019.4-233
mkl-service-2.0.2-py37h1de35cc_0
mkl_fft-1.0.12-py37h5e564d8_0
mkl_random-1.0.2-py37h27c97d8_0
mock-3.0.5-py37_0
more-itertools-7.0.0-py37_0
mpc-1.1.0-h6ef4df4_1
mpfr-4.0.1-h3018a27_3
mpmath-1.1.0-py37_0
msgpack-python-0.6.1-py37h04f5b5a_1
multipledispatch-0.6.0-py37_0
networkx-2.3-py_0
nltk-3.4.3-py37_0
nose-1.3.7-py37_2
numba-0.44.1-py37h6440ff4_0
numexpr-2.6.9-py37h7413580_0
numpy-1.16.4-py37hacdab7b_0
numpy-base-1.16.4-py37h6575580_0
numpydoc-0.9.1-py_0
openpyxl-2.6.2-py_0
packaging-19.0-py37_0
pandas-0.24.2-py37h0a44026_0
partd-1.0.0-py_0
path.py-12.0.1-py_0
pathlib2-2.3.4-py37_0
patsy-0.5.1-py37_0
pep8-1.7.1-py37_0
pluggy-0.12.0-py_0
ply-3.11-py37_0
py-1.8.0-py37_0
pycodestyle-2.5.0-py37_0
pycrypto-2.6.1-py37h1de35cc_9
pycurl-7.43.0.3-py37ha12b0ac_0
pyflakes-2.1.1-py37_0
pylint-2.3.1-py37_0
pyodbc-4.0.26-py37h0a44026_0
pyparsing-2.4.0-py_0
pytables-3.5.2-py37h5bccee9_1
pytest-5.0.0-py37_0
pytest-arraydiff-0.3-py37h39e3cac_0
pytest-astropy-0.5.0-py37_0
pytest-doctestplus-0.3.0-py37_0
pytest-openfiles-0.3.2-py37_0
pytest-remotedata-0.3.1-py37_0
pywavelets-1.0.3-py37h1d22016_1
qtawesome-0.5.7-py37_1
qtconsole-4.5.1-py_0
rope-0.14.0-py_0
scikit-image-0.15.0-py37h0a44026_0
scikit-learn-0.21.2-py37h27c97d8_0
scipy-1.2.1-py37h1410ff5_0
seaborn-0.9.0-py37_0
simplegeneric-0.8.1-py37_2
singledispatch-3.4.0.3-py37_0
snappy-1.1.7-he62c110_3
snowballstemmer-1.9.0-py_0
sortedcollections-1.1.2-py37_0
sortedcontainers-2.1.0-py37_0
sphinx-2.1.2-py_0
sphinxcontrib-1.0-py37_1
sphinxcontrib-applehelp-1.0.1-py_0
sphinxcontrib-devhelp-1.0.1-py_0
sphinxcontrib-htmlhelp-1.0.2-py_0
sphinxcontrib-jsmath-1.0.1-py_0
sphinxcontrib-qthelp-1.0.2-py_0
sphinxcontrib-serializinghtml-1.1.3-py_0
sphinxcontrib-websupport-1.1.2-py_0
spyder-3.3.5-py37_0
spyder-kernels-0.5.0-py37_0
sqlalchemy-1.3.5-py37h1de35cc_0
statsmodels-0.10.0-py37h1d22016_0
sympy-1.4-py37_0
tblib-1.4.0-py_0
toolz-0.9.0-py37_0
unicodecsv-0.14.1-py37_0
unixodbc-2.3.7-h1de35cc_0
werkzeug-0.15.4-py_0
wrapt-1.11.2-py37h1de35cc_0
wurlitzer-1.0.2-py37_0
xlrd-1.2.0-py37_0
xlsxwriter-1.1.8-py_0
xlwings-0.15.8-py37_0
xlwt-1.3.0-py37_0
zict-1.0.0-py_0
zipp-0.5.1-py_0
Proceed ([y]/n)? n
CondaSystemExit: Exiting.
—
You are receiving this because you were mentioned.
Reply to this email directly, view it on GitHub
<#8842?email_source=notifications&email_token=AAAJL6OSTKBNLUGDU7NDQA3P65NN5A5CNFSM4H4G6BNKYY3PNVWWK3TUL52HS4DFVREXG43VMVBW63LNMVXHJKTDN5WW2ZLOORPWSZGODZXH4ZY#issuecomment-510557799>,
or mute the thread
<https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AAAJL6NHW2CYUOW2F365D7TP65NN5ANCNFSM4H4G6BNA>
.
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After doing a |
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@SomeUserName1 I had also a similar error, and the command |
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I could be off-base here, but running a The other thing that I noticed is that there seem to be dependency solving issues due to the new The problem after that is with version priority vs. channel priority, since |
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Anything that works for you is a good thing. @SomeUserName1 other users have had success deleting files in their package cache. |
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Updated version of |
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funnily |
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@msarahan I am a very new to anaconda and just now seeing the statement referred to earlier: WARNING conda.base.context:use_only_tar_bz2(632): Conda is constrained to only using the old .tar.bz2 file format because you have conda-build installed, and it is <3.18.3. Update or remove conda-build to get smaller downloads and faster extractions. What is the correct fix? Running Mac OS 10.14.5 |
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This comment is for new users trying to install and upgrade the anaconda distro. This works currently (2019.07.22) on an iMac running MacOS 10.14.5 The new version of conda does not play well with the meta-package anaconda. The Continuum people seem unable to fix the problem. But here is a work-around that will give you a functioning, up-to-date distro. (1) Remove all trace of the anaconda distro from your system. (2) Download and install 2019.03 using the MacOS graphical installer. (3) Do conda upgrade --all This will upgrade a long list of packages, and also downgrade anaconda from 2019.03 to custom (4) Do conda upgrade --all again. This will downgrade a long list of packages (presumably the ones you just upgraded in step 3.) It will also upgrade anaconda from custom back to 2019.03 This should not happen, but currently it does. (5) Do conda upgrade mkl This will update a long list of packages (the same ones we had at the end of step 3?). It will also downgrade anaconda from 2019.03 to custom. (6) As a test, do conda upgrade --all This should tell you that "All requested packages are already installed." You now should have a functioning, up-to-date anaconda distro. |
No, we just haven't managed to find and close all of the related issues. The answer to this is in #8842 Closing this as a duplicate issue. For specific explanations of the behavior and the fix, see:
The entire reason why your instructions work is encapsulated in those 2 comments. The fix was to make the anaconda-custom metapackage have named dependencies, rather than just python. All of your other steps are just fidgeting with that metapackage - flip-flopping between optimizing its version and the versions of everything else. This happens because of how explicit vs. implicit dependencies get optimized. |
|
Mr. Sarahan, I know that my list of steps is a kludge. But it does work. It gets a new user to an up-to-date, functioning system. Maybe you should publish a HOWTO that tells a new user the correct step-by-step process to go from installing a new system to finally getting an up-to-date system that works. If you have already done that, please give me the URL. I mean step-by-step instructions, do this and then do that, etc. All best, Oliver (o12johns) |
|
FWIW, applying @msarahan's second suggestion twice times landed me in what seems a stable state. At least
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@msarahan I am on I know I had to install certain libraries to work on a project in crypto. So I believe that the project downgraded five files or so. The rest were all upto date as of May. I currently(Oct 17) performed a conda update --prefix /home/john/anaconda3 anaconda and I got pretty much what everyone else described. I removed as per recommendation the *.bz2 and .conda files from the pkgs . I re-executed the conda update -n base -c defaults conda and got the same but also with assertion errors at the end just as Mr. 00krishna commented on Jul 8 .
........... text deleted for convenience --------------
==> WARNING: A newer version of conda exists. <== Please update conda by running Package Plan environment location: /home/john/anaconda3 added / updated specs: The following NEW packages will be INSTALLED: _anaconda_depends pkgs/main/linux-64::_anaconda_depends-2019.03-py37_0 The following packages will be UPDATED: ca-certificates 2019.1.23-0 --> 2019.8.28-0 The following packages will be DOWNGRADED: anaconda 2019.03-py37_0 --> custom-py37_1 Proceed ([y]/n)? y Preparing transaction: done Rolling back transaction: done AssertionError() What is the best plan forward? Do I have to destroy the env and reinstall anaconda from scratch and rebuild everything? |
|
Had to do Edit: Still had other errors, ended up uninstalling 2019.3 and installing fresh 2019.10 |
In my recent experience with #9807 In my trial, after conda removed all packages that comes with anaconda metapackage, I used |
|
On Fedora 32 with Python 3.7 I've tried every variation from It always fails with the Should I just uninstall Anaconda Python completely and install 3.8? |
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Hi,
I have tried everything listed above, e.g. conda install anaconda, my reply: 'conda' is not recognized as an internal or external command, operable program or batch file. Please help |
kenodegard
added
type::support
and others
Current Behavior
I attempt to do a
conda update --alland it informs me thatcondawants to remove nearly every module. This can't be correct.Steps to Reproduce
Expected Behavior
I think
condashould update whichever packages need updating.Environment Information
`conda info``conda config --show-sources``conda list --show-channel-urls`The text was updated successfully, but these errors were encountered: