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aviczhl2 committed Apr 6, 2024
1 parent 771f02c commit 452cb0a
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Showing 4 changed files with 166 additions and 77 deletions.
64 changes: 44 additions & 20 deletions automated-issue-ref.ipynb
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"['JN.1.36.1', 'sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1326']\n",
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"['GE.1.2.2', 'sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1340']\n",
"['XDD.1.1.1', 'sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1450']\n",
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"Add 3 references from cov-lineages/pango-designation.\n",
"Add 1 references from cov-lineages/pango-designation.\n",
"Upgrade 0 references from cov-lineages/pango-designation.\n",
"Add 10 references from sars-cov-2-variants/lineage-proposals.\n"
"Add 31 references from sars-cov-2-variants/lineage-proposals.\n"
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Expand Down
72 changes: 59 additions & 13 deletions autoref/milestone.txt
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sars#378 JN.1.1 JN.1.1+JN.1.4+JN.1.44
sars#378 JN.1.4 JN.1.1+JN.1.4+JN.1.44
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sars#381 JN.1.5 JN.1.5
sars#382 JN.1.1.2 JN.1.1.2
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sars#385 XDD.1.1 XDD.1+XDD.1.1
sars#386 XDD.2 XDD.2
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sars#390 JN.1.6.1 JN.1.1.3+JN.1.6.1+JN.1.18
sars#390 JN.1.18 JN.1.1.3+JN.1.6.1+JN.1.18
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sars#389 JN.1.9.1 JN.1.1.1+JN.1.8.1+JN.1.7+JN.1.9.1+JN.1.4.3,+JN.1.4.6+KV.2
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sars#391 JN.2.3 JN.2.3
sars#392 HN.8 HN.8
sars#393 XDM XDM
Expand All @@ -1360,9 +1360,6 @@ sars#404 JN.11 JN.11
sars#405 JN.12 JN.12
sars#408 JN.1.4.1 JN.1.4.1
sars#409 JN.1.2.1 JN.1.2.1
sars#410 JN.1.12 JN.1.12+JN.1.11.1+JN.1.16
sars#410 JN.1.11.1 JN.1.12+JN.1.11.1+JN.1.16
sars#410 JN.1.16 JN.1.12+JN.1.11.1+JN.1.16
sars#411 XDQ XDQ
sars#412 XDR XDR
sars#413 JN.1.4.2 JN.1.4.2
Expand All @@ -1372,3 +1369,52 @@ sars#416 XDT XDT
sars#417 JN.1.1.4 JN.1.1.4
sars#418 HK.13.2.1 HK.13.2.1
sars#419 KP.1 KP.1
sars#420 JN.1.7.1 JN.1.7.1
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sars#425 KP.1.1 JN.1.1.3+JN.1.6.1+JN.1.18+JN.1.1.5+KP.1.1+KP.2+JN.1.26,+JN.1.4.4,+JN.1.8.2,+JN.1.16.1+JN.1.30.1+KU.2
sars#425 KP.2 JN.1.1.3+JN.1.6.1+JN.1.18+JN.1.1.5+KP.1.1+KP.2+JN.1.26,+JN.1.4.4,+JN.1.8.2,+JN.1.16.1+JN.1.30.1+KU.2
sars#425 JN.1.26 JN.1.1.3+JN.1.6.1+JN.1.18+JN.1.1.5+KP.1.1+KP.2+JN.1.26,+JN.1.4.4,+JN.1.8.2,+JN.1.16.1+JN.1.30.1+KU.2
sars#425 JN.1.4.4 JN.1.1.3+JN.1.6.1+JN.1.18+JN.1.1.5+KP.1.1+KP.2+JN.1.26,+JN.1.4.4,+JN.1.8.2,+JN.1.16.1+JN.1.30.1+KU.2
sars#425 JN.1.8.2 JN.1.1.3+JN.1.6.1+JN.1.18+JN.1.1.5+KP.1.1+KP.2+JN.1.26,+JN.1.4.4,+JN.1.8.2,+JN.1.16.1+JN.1.30.1+KU.2
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sars#425 KU.2 JN.1.1.3+JN.1.6.1+JN.1.18+JN.1.1.5+KP.1.1+KP.2+JN.1.26,+JN.1.4.4,+JN.1.8.2,+JN.1.16.1+JN.1.30.1+KU.2
sars#426 JQ.2 JQ.2+JQ.2.1
sars#426 JQ.2.1 JQ.2+JQ.2.1
sars#427 JN.13.1 JN.13.1
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sars#430 JN.1.4.5 JN.1.4.5
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sars#438 KP.2.2 KP.2.2
sars#439 KP.2.1 KP.2.1
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sars#443 JN.1.36.1 JN.1.36+JN.1.36.1
sars#444 JN.1.41 JN.1.41
sars#447 JN.1.28.1 JN.1.28.1+KW.1+KW.1.1
sars#447 KW.1 JN.1.28.1+KW.1+KW.1.1
sars#447 KW.1.1 JN.1.28.1+KW.1+KW.1.1
sars#448 XDU XDU
sars#449 XDP.1 XDP.1
sars#450 JN.14 JN.14
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sars#452 JN.1.7.3 JN.1.7.3
43 changes: 31 additions & 12 deletions autoref/missing_refs.txt
@@ -1,13 +1,32 @@
JN.1.2.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1322
JN.1.4.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1175
JN.1.9.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1097
JN.1.11.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1253
KP.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1364
JN.1.12 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1253
JN.1.13 #2464
JN.1.16 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1253
JN.1.18 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1089
JN.1.21 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1162
JN.12 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1102
KR.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1253
KV.2 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1097
JN.1.4.6 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1097
JN.1.7.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1371
JN.1.7.3 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1343
JN.1.8.2 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1089
KP.2.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1440
KP.2.2 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1446
KP.3 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1410
JN.1.18.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1414
JN.1.18.2 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1441
JN.1.26 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1089
JN.1.28.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1244
KW.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1244
KW.1.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1244
JN.1.30.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1089
KU.2 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1089
JN.1.31 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1319
JN.1.35 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1362
JN.1.36 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1326
JN.1.36.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1326
JN.1.40 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1451
JN.1.41 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1256
JN.1.42.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1474
JN.1.44 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#987
JN.13.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1386
JQ.2.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1373
JH.2 #2068
GN.1.4 #2349
GE.1.2.2 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1340
XDD.1.1.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1450
XDK.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1407
XDP.1 sars-cov-2-variants/lineage-proposals#1358

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