FTP vs Local Importation : symbol non importé #334

Elineau · 2020-02-03T10:22:57Z

Par FTP nous e pouvons pas importer de sample ayant dans leurs noms un symbole (ex : 200µm).
Par l'import local cela marche très bien pourtant

grololo06 · 2020-03-23T06:02:49Z

Bonjour, j'ai un peu du mal à voir de quoi il s'agit. Pourriez-vous joindre un fichier ou me donner son nom sur le FTP?
Merci.

Second link attempt: ecotaxa/ecotaxa_front#334

Elineau · 2020-03-23T09:15:33Z

Salut Laurent,
Voici un exemple : /Ecotaxa_Data_to_import/ZOOSCAN_Universite_Toulon/Zooscan_zooscan_rade_toulon_apstein_200/_work

grololo06 · 2020-04-30T07:40:14Z

Salut,
Quand tu dis "par l'import local", ca veut dire en utilisant ecotaxa portable? Ou en envoyant un zip sur le serveur?
Merci.

picheral · 2020-04-30T07:48:39Z

ZIP sur le serveur. Pas d'utilisation instance mobile Windows pour cette issue.

Elineau · 2020-04-30T08:16:15Z

dans les murs du labo

…

__________________________________________ Amanda Elineau Engineer (PIQv/CCP manager) Institut de la Mer - FR3761 181 chemin du Lazaret 06230 Villefranche sur Mer - France Tel : 33 +4 93 76 38 51

__________________________________________ De: "grololo06" <notifications@github.com> À: "oceanomics/ecotaxa_dev" <ecotaxa_dev@noreply.github.com> Cc: "Elineau" <elineau@obs-vlfr.fr>, "Author" <author@noreply.github.com> Envoyé: Jeudi 30 Avril 2020 09:40:29 Objet: Re: [oceanomics/ecotaxa_dev] FTP vs Local Importation : symbol non importé (#334) Salut, Quand tu dis "par l'import local", ca veut dire en utilisant ecotaxa portable? Ou en envoyant un zip sur le serveur? Merci. — You are receiving this because you authored the thread. Reply to this email directly, [ #334 (comment) | view it on GitHub ] , or [ https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AFL63G3ONBFUGTRWHOE6LX3RPETO3ANCNFSM4KPCSVZA | unsubscribe ] .

grololo06 · 2020-04-30T08:51:03Z

J'essaie de résumer ce qui s'est passé:

Il y a un .zip sur un PC sous Windows.
Le .zip a été extrait sur le PC Windows.
Le répertoire résultant de l'extraction a été copié sur le FTP plankton en utilisant ??? (filezilla?)
Le répertoire FTP a été utilisé pour un import EcoTaxa, option "Choose a folder or zip file on the server"
Ca a planté, objet de la présente issue.

En faisant un import EcoTaxa avec l'option "Upload folder(s) compressed as a zip file" et en envoyant le même .zip, ça marche.

Merci de me corriger ou de confirmer.

Elineau · 2020-04-30T09:00:47Z

je vais retester

…

__________________________________________ Amanda Elineau Engineer (PIQv/CCP manager) Institut de la Mer - FR3761 181 chemin du Lazaret 06230 Villefranche sur Mer - France Tel : 33 +4 93 76 38 51

__________________________________________ De: "grololo06" <notifications@github.com> À: "oceanomics" <ecotaxa_dev@noreply.github.com> Cc: "Elineau" <elineau@obs-vlfr.fr>, "Author" <author@noreply.github.com> Envoyé: Jeudi 30 Avril 2020 10:51:19 Objet: Re: [oceanomics/ecotaxa_dev] FTP vs Local Importation : symbol non importé (#334) J'essaie de résumer ce qui s'est passé: 1. Il y a un .zip sur un PC sous Windows. 2. Le .zip a été extrait sur le PC Windows. 3. Le répertoire résultant de l'extraction a été copié sur le FTP plankton en utilisant ??? (filezilla?) 4. Le répertoire FTP a été utilisé pour un import EcoTaxa, option "Choose a folder or zip file on the server" 5. Ca a planté, objet de la présente issue. En faisant un import EcoTaxa avec l'option "Upload folder(s) compressed as a zip file" et en envoyant le même .zip, ça marche. Merci de me corriger ou de confirmer. — You are receiving this because you authored the thread. Reply to this email directly, [ #334 (comment) | view it on GitHub ] , or [ https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AFL63GZB2LCXJYJJECDD2GTRPE3YPANCNFSM4KPCSVZA | unsubscribe ] .

Elineau · 2020-04-30T09:50:22Z

Sur FileZilla : /Ecotaxa_Data_to_import/ZOOSCAN_Universite_Toulon/Zooscan_zooscan_rade_toulon_apstein_200/_work Quand j'importe le work dans un projet, il me met l'erreur ci dessous, car il ne lit pas le symbole "µm" quand il va checker la table .tsv et non pas parce qu'il manque des lignes dans la table. Donc ce n'est pas une question de zip là.

…

__________________________________________ Amanda Elineau Engineer (PIQv/CCP manager) Institut de la Mer - FR3761 181 chemin du Lazaret 06230 Villefranche sur Mer - France Tel : 33 +4 93 76 38 51

__________________________________________ De: "Amanda Elineau" <amanda.elineau@imev-mer.fr> À: "oceanomics" <reply@reply.github.com> Cc: "oceanomics" <ecotaxa_dev@noreply.github.com>, "Elineau" <elineau@obs-vlfr.fr>, "Author" <author@noreply.github.com> Envoyé: Jeudi 30 Avril 2020 11:00:38 Objet: Re: [oceanomics/ecotaxa_dev] FTP vs Local Importation : symbol non importé (#334) je vais retester

__________________________________________ Amanda Elineau Engineer (PIQv/CCP manager) Institut de la Mer - FR3761 181 chemin du Lazaret 06230 Villefranche sur Mer - France Tel : 33 +4 93 76 38 51

__________________________________________ De: "grololo06" <notifications@github.com> À: "oceanomics" <ecotaxa_dev@noreply.github.com> Cc: "Elineau" <elineau@obs-vlfr.fr>, "Author" <author@noreply.github.com> Envoyé: Jeudi 30 Avril 2020 10:51:19 Objet: Re: [oceanomics/ecotaxa_dev] FTP vs Local Importation : symbol non importé (#334) J'essaie de résumer ce qui s'est passé: 1. Il y a un .zip sur un PC sous Windows. 2. Le .zip a été extrait sur le PC Windows. 3. Le répertoire résultant de l'extraction a été copié sur le FTP plankton en utilisant ??? (filezilla?) 4. Le répertoire FTP a été utilisé pour un import EcoTaxa, option "Choose a folder or zip file on the server" 5. Ca a planté, objet de la présente issue. En faisant un import EcoTaxa avec l'option "Upload folder(s) compressed as a zip file" et en envoyant le même .zip, ça marche. Merci de me corriger ou de confirmer. — You are receiving this because you authored the thread. Reply to this email directly, [ #334 (comment) | view it on GitHub ] , or [ https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AFL63GZB2LCXJYJJECDD2GTRPE3YPANCNFSM4KPCSVZA | unsubscribe ] .

grololo06 · 2020-04-30T16:12:32Z

Il y a des soupçons qui se confirment sur FileZilla ou le serveur FTP.
Dans /Ecotaxa_Data_to_import/TestLaurentS, j'ai transféré 2 fichiers, l'un à partir de mon PC linux, l'autre à partir de ma VM windows, avec le signe micron dedans.
FileZilla sous linux affiche:

FileZilla sous Windows affiche:

Par contre le répertoire sur la machine newecotaxa contient:

Le micron est "abîmé" lors du transfert.

grololo06 · 2020-04-30T16:31:14Z

Les zips recrées à partir du serveur FTP sont dans plankton:/zooscan_w/work, c-a-d /plankton/local_plankton/zooscan/zooscan_w/_work sur la box newecotaxa.

grololo06 · 2020-04-30T16:57:32Z

Il y a un réglage FileZilla:

Il faut le forcer à UTF-8 s'il y a des caractères spéciaux. => Doc
Il faut aussi détecter les fichiers avec un mauvais charset pour un meilleur message=> Code import

grololo06 · 2020-05-20T13:43:06Z

Code fixed and validated by users, doc. updated.

Elineau added the bug label Feb 3, 2020

grololo06 added a commit to ecotaxa/ecotaxa_back that referenced this issue Mar 23, 2020

Update README.md

037d74c

Second link attempt: ecotaxa/ecotaxa_front#334

grololo06 self-assigned this Apr 30, 2020

grololo06 added the to clarify label Apr 30, 2020

grololo06 removed the to clarify label Apr 30, 2020

grololo06 added the to clarify label Apr 30, 2020

grololo06 removed the to clarify label Apr 30, 2020

grololo06 pushed a commit that referenced this issue May 5, 2020

#334: Warn user when error comes from bad file transfer.

57979e2

grololo06 assigned Elineau and unassigned grololo06 May 6, 2020

grololo06 closed this as completed May 20, 2020

Provide feedback

Saved searches

Use saved searches to filter your results more quickly

FTP vs Local Importation : symbol non importé #334

FTP vs Local Importation : symbol non importé #334

Elineau commented Feb 3, 2020

grololo06 commented Mar 23, 2020

Elineau commented Mar 23, 2020

grololo06 commented Apr 30, 2020

picheral commented Apr 30, 2020

Elineau commented Apr 30, 2020 via email

grololo06 commented Apr 30, 2020

Elineau commented Apr 30, 2020 via email

Elineau commented Apr 30, 2020 via email

grololo06 commented Apr 30, 2020 •

edited

grololo06 commented Apr 30, 2020 •

edited

grololo06 commented Apr 30, 2020 •

edited

grololo06 commented May 20, 2020

FTP vs Local Importation : symbol non importé #334

FTP vs Local Importation : symbol non importé #334

Comments

Elineau commented Feb 3, 2020

grololo06 commented Mar 23, 2020

Elineau commented Mar 23, 2020

grololo06 commented Apr 30, 2020

picheral commented Apr 30, 2020

Elineau commented Apr 30, 2020 via email

grololo06 commented Apr 30, 2020

Elineau commented Apr 30, 2020 via email

Elineau commented Apr 30, 2020 via email

grololo06 commented Apr 30, 2020 • edited

grololo06 commented Apr 30, 2020 • edited

grololo06 commented Apr 30, 2020 • edited

grololo06 commented May 20, 2020

grololo06 commented Apr 30, 2020 •

edited

grololo06 commented Apr 30, 2020 •

edited

grololo06 commented Apr 30, 2020 •

edited