/
nuc.D00000001
237 lines (237 loc) · 16.5 KB
/
nuc.D00000001
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 435453.50000 0.0000 0.0000 1 2.03627e+07
10 1545.71802 0.0565 1.2785 21 11126.8
20 603.25201 0.0165 0.1824 41 2213.53
30 391.80505 0.0040 0.0486 61 325.753
40 304.18588 0.0090 0.1095 81 649.925
50 253.97266 0.0014 0.0348 101 94.4483
60 247.19411 0.0009 0.0482 121 154.52
70 242.42543 0.0007 0.0473 141 136.801
80 237.94943 0.0007 0.0471 161 131.798
90 233.66858 0.0006 0.0470 181 126.246
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 2866.40894 0.0000 0.0000 1 14116.8
10 2055.62671 0.0051 0.1700 22 66301.3
20 1920.88464 0.0012 0.0244 42 9287.39
30 1890.89575 0.0007 0.0280 62 7646.66
40 1864.33508 0.0006 0.0317 82 7232.99
50 1838.96570 0.0005 0.0335 102 7128.24
60 1814.89136 0.0005 0.0338 122 6548.69
70 1792.38489 0.0005 0.0343 142 6759.43
80 1771.08997 0.0004 0.0343 162 6567.3
90 1750.67517 0.0004 0.0342 182 6431.85
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 9638.39648 0.0000 0.0000 1 57695.2
10 6620.62402 0.0191 0.3360 23 492734
20 5311.50000 0.0038 0.0989 43 288778
30 4565.55762 0.0087 0.1432 63 164949
40 3941.66016 0.0051 0.0893 83 131079
50 3535.60889 0.0054 0.1095 103 129418
60 3198.54102 0.0059 0.1432 123 61735.5
70 2929.09644 0.0048 0.1250 143 64189.8
80 2723.27515 0.0040 0.1079 163 50034.5
90 2557.17896 0.0032 0.0758 183 34267.2
98 2468.34814 0.0005 0.0095 200 21000.6
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 5432.43652 0.0000 0.0000 1 93980.7
1 5426.85400 0.0003 0.0041 3 33813
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 6936.41162 0.0000 0.0000 1 95219.4
0000 0.0000 1 408.671
1 196.47314 0.0007 0.0034 3 391.937
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 196.47314 0.0000 0.0000 1 391.937
1 196.34863 0.0007 0.0028 3 365.188
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 202.71132 0.0000 0.0000 1 435.919
1 202.53346 0.0008 0.0039 3 549.361
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 259.35007 0.0000 0.0000 1 6606.82
10 207.87184 0.0048 0.0353 21 2088.89
20 197.03271 0.0069 0.0299 41 1231.99
30 190.00568 0.0104 0.0433 61 951.037
40 184.21973 0.0094 0.0339 81 789.131
50 178.97018 0.0116 0.0361 101 1023.63
60 172.86382 0.0040 0.0128 122 776.822
62 172.15303 0.0011 0.0056 127 294.035
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 190.83949 0.0000 0.0000 1 4660.01
8 173.24139 0.0012 0.0096 17 279.045
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 174.22934 0.0000 0.0000 1 621.767
3 173.38857 0.0007 0.0081 7 189.562
# Molecular dynamics simulation at 150.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 173.38857 0.0000 0.0000 101.72509 148.47740
10 229.81117 0.0157 0.0386 59.43863 86.75631
20 243.31357 0.0189 0.0458 88.46600 129.12451
30 246.98199 0.0203 0.0473 99.82822 145.70872
40 252.65858 0.0199 0.0492 95.79252 139.81825
50 255.86853 0.0203 0.0494 101.92277 148.76593
# Molecular dynamics simulation at 400.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 255.86853 0.0000 0.0000 102.76824 149.99998
10 254.36119 0.0208 0.0494 104.06674 151.89526
20 317.79993 0.0294 0.0709 207.86546 303.39932
30 348.22015 0.0330 0.0822 267.54550 390.50800
40 349.98560 0.0328 0.0881 260.14365 379.70428
50 357.83789 0.0330 0.0819 268.18491 391.44125
# Molecular dynamics simulation at 1000.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 357.83789 0.0000 0.0000 274.04874 400.00006
10 349.80103 0.0331 0.0801 265.73984 387.87244
20 497.07553 0.0477 0.1225 569.86517 831.77216
30 516.21069 0.0523 0.1432 662.48834 966.96448
40 538.19232 0.0524 0.1170 664.30145 969.61084
50 564.61084 0.0517 0.1175 646.60962 943.78796
# Molecular dynamics simulation at 1000.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 564.61084 0.0000 0.0000 685.12183 1000.00018
10 573.67932 0.0532 0.1117 676.45990 987.35724
20 546.23816 0.0542 0.1316 710.55164 1037.11743
30 574.66077 0.0525 0.1141 668.56921 975.84009
40 586.66815 0.0514 0.1124 649.28247 947.68921
50 598.31799 0.0513 0.1288 646.48840 943.61102
60 575.52820 0.0530 0.1314 672.88556 982.14020
70 575.62225 0.0521 0.1249 653.75989 954.22443
80 596.37378 0.0519 0.1223 653.98401 954.55157
90 575.54834 0.0528 0.1084 660.50482 964.06934
100 599.67908 0.0506 0.1108 617.01807 900.59625
110 602.37866 0.0537 0.1319 698.65057 1019.74664
120 573.42035 0.0548 0.1229 734.11737 1071.51379
130 623.15118 0.0544 0.1424 713.83173 1041.90503
140 600.56177 0.0544 0.1244 719.33728 1049.94080
150 594.01752 0.0545 0.1225 718.72949 1049.05371
160 613.69202 0.0548 0.1197 718.02472 1048.02502
170 601.20544 0.0548 0.1308 722.43549 1054.46301
180 598.63257 0.0551 0.1119 733.67657 1070.87036
190 594.57953 0.0546 0.1437 719.93549 1050.81396
200 613.25812 0.0547 0.1081 728.72034 1063.63635
210 604.79541 0.0518 0.1330 662.51300 967.00043
220 592.05548 0.0535 0.1169 686.58234 1002.13190
230 599.84021 0.0525 0.1207 673.37140 982.84930
240 599.93903 0.0523 0.1337 665.77252 971.75800
250 605.03986 0.0528 0.1373 679.94141 992.43884
260 616.91876 0.0515 0.1472 643.76538 939.63654
270 597.92749 0.0521 0.1381 667.99426 975.00085
280 613.24188 0.0524 0.1434 656.05664 957.57678
290 588.34216 0.0522 0.1224 666.10309 972.24054
300 587.67224 0.0536 0.1171 690.38397 1007.68079
# Molecular dynamics simulation at 800.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 587.67224 0.0000 0.0000 685.12158 999.99982
10 601.52032 0.0510 0.1283 651.53784 950.98114
20 612.99268 0.0514 0.1285 643.22247 938.84412
30 605.45709 0.0530 0.1176 673.43713 982.94525
40 594.77625 0.0523 0.1338 672.60095 981.72473
50 603.92584 0.0530 0.1233 673.89374 983.61169
60 616.80072 0.0522 0.1335 659.99921 963.33130
70 642.76843 0.0510 0.1233 627.34601 915.67090
80 622.02802 0.0512 0.1164 647.89215 945.65991
90 643.61743 0.0498 0.1258 613.83771 895.95422
100 623.71008 0.0514 0.1467 646.27856 943.30475
110 550.30255 0.0494 0.1340 599.75531 875.39966
120 574.38257 0.0498 0.1251 599.41602 874.90442
130 554.78510 0.0500 0.1104 610.44067 890.99597
140 580.68616 0.0482 0.1164 586.25403 855.69324
150 556.41852 0.0503 0.1161 620.55524 905.75909
160 588.80115 0.0493 0.1125 590.76813 862.28198
170 573.70288 0.0485 0.1120 589.66626 860.67371
180 632.11731 0.0476 0.1049 547.19556 798.68372
190 606.74023 0.0490 0.1042 577.39117 842.75708
200 565.29163 0.0497 0.1125 591.87097 863.89172
210 571.05682 0.0485 0.1165 578.23700 843.99164
220 547.80438 0.0481 0.1276 570.65997 832.93225
230 575.60730 0.0482 0.1109 570.16333 832.20734
240 558.68671 0.0476 0.1054 555.75482 811.17676
250 551.70721 0.0485 0.1165 583.98132 852.37604
260 579.69293 0.0478 0.1161 552.98260 807.13043
270 589.02209 0.0467 0.1271 542.93445 792.46423
280 564.12823 0.0483 0.1106 569.64771 831.45477
290 582.90344 0.0482 0.1114 553.15570 807.38312
300 586.62091 0.0482 0.1309 557.99414 814.44525
# Molecular dynamics simulation at 500.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 586.62091 0.0000 0.0000 548.09723 799.99982
10 582.87640 0.0467 0.0919 520.51422 759.73981
20 564.22284 0.0475 0.1215 568.31744 829.51312
30 610.69055 0.0453 0.1134 515.85864 752.94452
40 573.42938 0.0477 0.1286 541.39215 790.21307
50 569.06323 0.0472 0.1220 544.87286 795.29352
60 570.33032 0.0483 0.1133 564.00696 823.22156
70 542.82770 0.0480 0.1217 568.18433 829.31879
80 532.07312 0.0489 0.1239 591.30646 863.06775
90 570.31183 0.0464 0.1018 526.56445 768.57068
100 554.32239 0.0492 0.1221 585.03961 853.92072
110 447.16397 0.0421 0.1080 427.85883 624.50049
120 474.65408 0.0398 0.0923 397.14084 579.66467
130 450.77115 0.0426 0.1010 440.69516 643.23633
140 453.06372 0.0419 0.1041 423.26010 617.78821
150 462.56540 0.0415 0.1080 423.03278 617.45636
160 479.64844 0.0414 0.0889 407.99387 595.50568
170 475.10120 0.0414 0.0880 412.25089 601.71918
180 455.04919 0.0422 0.1018 432.89566 631.85217
190 452.54044 0.0419 0.0946 431.13260 629.27887
200 457.93872 0.0426 0.1008 434.67181 634.44464
210 405.59305 0.0404 0.0963 389.43265 568.41382
220 427.97247 0.0395 0.1028 380.94931 556.03156
230 430.75363 0.0392 0.0904 367.29163 536.09692
240 432.64526 0.0383 0.0935 358.07352 522.64221
250 413.57822 0.0394 0.0900 381.08640 556.23169
260 425.97360 0.0384 0.0921 365.68848 533.75696
270 426.35138 0.0386 0.1125 371.63342 542.43414
280 401.62109 0.0401 0.0956 391.01749 570.72705
290 421.28281 0.0394 0.1152 383.71552 560.06909
300 427.44485 0.0385 0.0943 361.97601 528.33826
# Molecular dynamics simulation at 300.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 427.44485 0.0000 0.0000 342.56073 499.99982
10 420.36084 0.0387 0.1109 373.83786 545.65173
20 412.28711 0.0378 0.0938 351.24399 512.67383
30 436.02115 0.0381 0.0875 355.04605 518.22333
40 417.85629 0.0389 0.0805 369.21191 538.89972
50 431.85364 0.0372 0.1243 345.74344 504.64526
60 429.01624 0.0380 0.0954 355.67908 519.14728
70 416.32788 0.0379 0.1030 356.97491 521.03870
80 394.15356 0.0392 0.0934 374.44110 546.53223
90 440.63953 0.0367 0.0929 339.25781 495.17889
100 404.61517 0.0388 0.1018 372.15710 543.19855
110 365.63815 0.0326 0.0774 261.53006 381.72787
120 352.85474 0.0323 0.0844 254.77831 371.87305
130 352.59637 0.0327 0.0830 256.34506 374.15988
140 335.79770 0.0333 0.0937 274.59604 400.79892
150 357.81351 0.0326 0.0782 254.59399 371.60403
160 334.96933 0.0335 0.0962 276.68542 403.84857
170 363.75858 0.0322 0.0765 249.62914 364.35736
180 336.16354 0.0325 0.0892 273.41092 399.06912
190 355.47244 0.0323 0.0776 254.28799 371.15741
200 348.11951 0.0334 0.0822 268.64792 392.11707
210 329.37894 0.0299 0.0800 221.22542 322.89944
220 342.49173 0.0296 0.0766 213.55693 311.70654
230 314.14780 0.0311 0.0834 237.49292 346.64340
240 322.61398 0.0309 0.0767 232.21973 338.94669
250 324.41016 0.0309 0.0867 238.41371 347.98740
260 312.28918 0.0312 0.0880 241.50443 352.49857
270 314.46564 0.0308 0.0883 238.48991 348.09860
280 303.52466 0.0320 0.0859 251.46783 367.04111
290 312.07956 0.0304 0.0858 232.83853 339.84988
300 324.21027 0.0303 0.0881 221.11723 322.74155
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 324.21027 0.0000 0.0000 1 327346
10 150.02486 0.0102 0.0285 21 3875.8
20 132.94318 0.0088 0.0289 41 1940.14
30 123.75477 0.0091 0.0281 61 1049.01
40 118.77337 0.0077 0.0292 81 671.742
50 115.16174 0.0041 0.0166 102 354.151
52 114.82713 0.0016 0.0064 107 659.674