Skip to content

jhcgt4869/Unpaired_Probability_Prediction_The_first_ten

Repository files navigation

Unpaired_Probability_Prediction_The_first_ten

螺旋桨RNA结构预测竞赛第10名方案

队伍名:白鹤亮对翅,黑熊飞双桨
成员:刘建建、史靖玮、项建彪 、杨静俐
成绩情况:score:3.722 rmsd_avg:0.269 rmsd_std:0.067

-详细内容说明

赛题介绍

“RNA碱基不成对概率”衡量了RNA序列在各个点位是否能形成稳定的碱基对(base pair),是RNA结构的重要属性,并可被应用在mRNA疫苗序列设计、药物研发等领域。例如mRNA疫苗序列通常不稳定,而RNA碱基不成对概率较高的点位正是易被降解的位置;又如RNA 碱基不成对概率较高的点位通常更容易与其他RNA序列相互作用,形成RNA-RNA binding等,这一特性也被广泛应用于疾病诊断和RNA药物研发。

本次比赛提供了5000条训练数据,请选手基于训练数据和飞桨平台,开发模型预测RNA碱基不成对概率。

Tips:机器学习框架方面只允许使用飞桨深度学习框架哦

比赛地址:https://aistudio.baidu.com/aistudio/competition/detail/61

比赛思路

先对基线进行了解,使用基线进行提交发现效果不错寻求进一步提升。
在实践过程中发现效果呈现过拟合的情况,进行了提前停止。
再寻求其他的优化模式,最后找到了一个成绩的段点(比较好的地方)
通过这个值周边最近的几个model进行融合得到了最后的结果并进行提交

榜单第10名,不代表最后的结果!!!

image

About

螺旋桨RNA结构预测竞赛第10名方案

Topics

Resources

License

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Packages

No packages published