准备收集整理一切表达芯片探针的ID，并且对应到entrez系统的基因ID
首先需要了解一下表达芯片的主要公司及其生产的芯片历史，可以参考我两年前的总结：https://mp.weixin.qq.com/s/HoRUzx0UJxgkgQDxouj8rw
然后需要参考我两年前的博客，收集有对应的bioconductor包的探针ID集，http://www.bio-info-trainee.com/1399.html
最后还需要整理GEO里面的那些没有bioconductor对应包的GPL的信息，同样是常见的平台及常见的物种：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/browse/?view=platforms&display=20&zsort=samples
2018-11-03 IDmap v1.0版本基础功能实现
- 使用测试文件夹中的测试数据可测试IDmap的基本功能
- 可查看函数文档，可阅读简单版IDmap指南
2018-11-02 IDmap v1.0版本更新
- 完善probeid注释函数 get_geneids()
- 增加自动从GEO下载probe注释的函数get_geo()
- 为来自bioconductor的probe注释增加gpl信息
- IDmap_0.1.0.zip windows平台二进制包上传，可安装至R 并正常使用函数
2018-10-31 IDmap v1.0版本更新
- 可实现基础的probeid注释，编译后可作为R包使用
2018-10-29 xiangyujia-IDmap v1.0版本源码上传
- （存放在IDmap目录下，IDmap_src_v1.0.zip，是未经编译的源码R包）
- IDmap v1.0版本包含1个函数get_geneids，用于annotate probeids to geneids 。函数文档正在完善，其它函数正在编写中
2018-10-24 xiangyujia-已获取top10 GPL平台的所有注释信息
- （存放在GPL文件夹中）
- 成功提取probe id和gene id
- 合并所提取的GPL平台probeid2geneid注释和来自bioconductor包的注释，存放在all_common_probeid2geneid.Rdata（在IDmap目录下,不是GPL文件夹）中
- step1,2,3,4 是下载注释，提取id和处理数据的代码
- 注：GPL文件夹中的所有数据来源和代码具体说明，请查看GPL文件夹中的GPL_文件来源和数据信息代码说明.md
2018-10-22 xiangyujia-已下载GPL对应的probe-gene注释信息
- （存放在GPL文件夹中）
2018-10-17 xiangyujia-已下载GEO数据库的所有GPL信息
- 并获取了三大公司（Affy ， Agilent，Illumina）的前10%的GPL的信息（物种限定人类，小鼠与大鼠）
在jimmy个人电脑下载安装了80个bioconductor的芯片相关R包，并且把 3个物种的ID提取成功，具体详见代码。