-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 22
Commit
This commit does not belong to any branch on this repository, and may belong to a fork outside of the repository.
add data/params for S1 suprathreshold ERP
- Loading branch information
Showing
3 changed files
with
331 additions
and
1 deletion.
There are no files selected for viewing
This file contains bidirectional Unicode text that may be interpreted or compiled differently than what appears below. To review, open the file in an editor that reveals hidden Unicode characters.
Learn more about bidirectional Unicode characters
| Original file line number | Diff line number | Diff line change |
|---|---|---|
| @@ -1 +1 @@ | ||
| __version__ = '0.1.1' | ||
| __version__ = '0.1.2' |
This file contains bidirectional Unicode text that may be interpreted or compiled differently than what appears below. To review, open the file in an editor that reveals hidden Unicode characters.
Learn more about bidirectional Unicode characters
| Original file line number | Diff line number | Diff line change |
|---|---|---|
| @@ -0,0 +1,105 @@ | ||
| 0.000000000000000000e+00 -1.265560165975102791e+01 | ||
| 1.666666666666666741e+00 -1.163996100814287260e+01 | ||
| 3.333333333333333481e+00 -1.095840822720261798e+01 | ||
| 5.000000000000000000e+00 -1.023063363803699843e+01 | ||
| 6.666666666666666963e+00 -9.185330777381457423e+00 | ||
| 8.333333333333333925e+00 -8.422820815377971559e-01 | ||
| 1.000000000000000000e+01 -2.161615546397642085e+00 | ||
| 1.166666666666666785e+01 -3.670658924816713409e+00 | ||
| 1.333333333333333393e+01 -5.295627233109076570e+00 | ||
| 1.500000000000000000e+01 6.532800671483389721e-01 | ||
| 1.666666666666666785e+01 4.301452086733755564e+00 | ||
| 1.833333333333333570e+01 6.859302737397852567e+00 | ||
| 2.000000000000000000e+01 9.046741326536899663e+00 | ||
| 2.166666666666666785e+01 1.542764213892376546e+01 | ||
| 2.333333333333333570e+01 2.029805297757283356e+01 | ||
| 2.500000000000000000e+01 1.175366929531422855e+01 | ||
| 2.666666666666666785e+01 2.194572601211587592e+00 | ||
| 2.833333333333333570e+01 -6.422254248452746950e+00 | ||
| 3.000000000000000000e+01 -1.092039708675791942e+01 | ||
| 3.166666666666666785e+01 -2.421980573325259556e+01 | ||
| 3.333333333333333570e+01 -2.854975352009530454e+01 | ||
| 3.500000000000000000e+01 -1.642003387707057271e+01 | ||
| 3.666666666666667140e+01 1.710374905922447120e-01 | ||
| 3.833333333333333570e+01 6.158531601836580549e+00 | ||
| 4.000000000000000000e+01 7.875253976821628754e+00 | ||
| 4.166666666666667140e+01 8.968477476823739636e+00 | ||
| 4.333333333333333570e+01 1.030620230044781493e+01 | ||
| 4.500000000000000000e+01 1.566671301837493502e+01 | ||
| 4.666666666666667140e+01 2.078031450021305204e+01 | ||
| 4.833333333333333570e+01 2.640052745468464224e+01 | ||
| 5.000000000000000000e+01 2.140175989006012713e+01 | ||
| 5.166666666666667140e+01 2.776794091620295113e+00 | ||
| 5.333333333333333570e+01 -1.457612966780662056e+01 | ||
| 5.500000000000000000e+01 -2.636104581179986184e+01 | ||
| 5.666666666666667140e+01 -3.901958983428232131e+01 | ||
| 5.833333333333333570e+01 -4.696454823640577558e+01 | ||
| 6.000000000000000000e+01 -5.702194408937850767e+01 | ||
| 6.166666666666667140e+01 -6.608538353790424935e+01 | ||
| 6.333333333333333570e+01 -7.539229028688609446e+01 | ||
| 6.500000000000000000e+01 -8.349827464709382241e+01 | ||
| 6.666666666666667140e+01 -9.155892282997402276e+01 | ||
| 6.833333333333334281e+01 -9.975289722248660951e+01 | ||
| 7.000000000000000000e+01 -1.058395208568482957e+02 | ||
| 7.166666666666667140e+01 -1.100517251066597737e+02 | ||
| 7.333333333333334281e+01 -1.123414742872308665e+02 | ||
| 7.500000000000000000e+01 -1.136941786624962276e+02 | ||
| 7.666666666666667140e+01 -1.109522111042946051e+02 | ||
| 7.833333333333334281e+01 -1.062922629473090552e+02 | ||
| 8.000000000000000000e+01 -9.609375924091938259e+01 | ||
| 8.166666666666667140e+01 -7.641223983376957563e+01 | ||
| 8.333333333333334281e+01 -5.688338328578383596e+01 | ||
| 8.500000000000000000e+01 -3.677663990042508146e+01 | ||
| 8.666666666666667140e+01 -2.362664796027543090e+01 | ||
| 8.833333333333334281e+01 -1.045704988512688161e+01 | ||
| 9.000000000000000000e+01 -2.970282206207155884e+00 | ||
| 9.166666666666667140e+01 1.117183205861882023e+01 | ||
| 9.333333333333334281e+01 2.596737494450245620e+01 | ||
| 9.500000000000000000e+01 3.645700136962717863e+01 | ||
| 9.666666666666667140e+01 4.278979330555615235e+01 | ||
| 9.833333333333334281e+01 4.710319786360901162e+01 | ||
| 1.000000000000000000e+02 5.101847834479702470e+01 | ||
| 1.016666666666666714e+02 5.685046058603304431e+01 | ||
| 1.033333333333333428e+02 5.955621381613050858e+01 | ||
| 1.050000000000000000e+02 6.232590441069364573e+01 | ||
| 1.066666666666666714e+02 6.480249331059908968e+01 | ||
| 1.083333333333333428e+02 6.237931936019523960e+01 | ||
| 1.100000000000000000e+02 6.088723970242576655e+01 | ||
| 1.116666666666666714e+02 5.967412769307878051e+01 | ||
| 1.133333333333333428e+02 5.862463659264690108e+01 | ||
| 1.150000000000000000e+02 5.918538847017516957e+01 | ||
| 1.166666666666666714e+02 5.996027132647974156e+01 | ||
| 1.183333333333333428e+02 6.210389518314229917e+01 | ||
| 1.200000000000000000e+02 6.533572088433506053e+01 | ||
| 1.216666666666666714e+02 7.432862690426618713e+01 | ||
| 1.233333333333333428e+02 8.012212784005888011e+01 | ||
| 1.250000000000000000e+02 8.561152342139818927e+01 | ||
| 1.266666666666666714e+02 8.995248478564866446e+01 | ||
| 1.283333333333333428e+02 9.094068849978920355e+01 | ||
| 1.300000000000000000e+02 9.209418227952366465e+01 | ||
| 1.316666666666666856e+02 9.480509496218361676e+01 | ||
| 1.333333333333333428e+02 9.766153087987397896e+01 | ||
| 1.350000000000000000e+02 1.007963634435486426e+02 | ||
| 1.366666666666666856e+02 1.035915971975448713e+02 | ||
| 1.383333333333333428e+02 1.060382135048343173e+02 | ||
| 1.400000000000000000e+02 1.097650334932699110e+02 | ||
| 1.416666666666666856e+02 1.113515649818254616e+02 | ||
| 1.433333333333333428e+02 1.087773954014647586e+02 | ||
| 1.450000000000000000e+02 1.048961016542070865e+02 | ||
| 1.466666666666666856e+02 9.967882427255881339e+01 | ||
| 1.483333333333333428e+02 9.523114039561549760e+01 | ||
| 1.500000000000000000e+02 9.159777074653302975e+01 | ||
| 1.516666666666666856e+02 8.292648951793952961e+01 | ||
| 1.533333333333333428e+02 7.437236316355665622e+01 | ||
| 1.550000000000000000e+02 6.871499773586550930e+01 | ||
| 1.566666666666666856e+02 6.463089343064309844e+01 | ||
| 1.583333333333333428e+02 5.810408993174161196e+01 | ||
| 1.600000000000000000e+02 4.805175215734627159e+01 | ||
| 1.616666666666666856e+02 4.074807621522103318e+01 | ||
| 1.633333333333333428e+02 3.488352104889536776e+01 | ||
| 1.650000000000000000e+02 3.018036678558762986e+01 | ||
| 1.666666666666666856e+02 2.498224669281869836e+01 | ||
| 1.683333333333333428e+02 2.062155624681433608e+01 | ||
| 1.700000000000000000e+02 1.679677659317943039e+01 | ||
| 1.716666666666666856e+02 1.351701140735917051e+01 | ||
| 1.733333333333333428e+02 1.198451729076989025e+01 |
This file contains bidirectional Unicode text that may be interpreted or compiled differently than what appears below. To review, open the file in an editor that reveals hidden Unicode characters.
Learn more about bidirectional Unicode characters
| Original file line number | Diff line number | Diff line change |
|---|---|---|
| @@ -0,0 +1,225 @@ | ||
| sim_prefix: ERPYesSupraT | ||
| expmt_groups: {ERPYesSupraT} | ||
| tstop: 170 | ||
| dt: 0.025 | ||
| celsius: 37.0 | ||
| N_trials: 1 | ||
| threshold: 0.0 | ||
| save_figs: 0 | ||
| save_spec_data: 0 | ||
| f_max_spec: 100 | ||
| dipole_scalefctr: 3000 | ||
| dipole_smooth_win: 20 | ||
| save_vsoma: 0 | ||
| prng_seedcore_input_prox: 4 | ||
| prng_seedcore_input_dist: 4 | ||
| prng_seedcore_extpois: 4 | ||
| prng_seedcore_extgauss: 4 | ||
| prng_seedcore_evprox_1: 4 | ||
| prng_seedcore_evdist_1: 4 | ||
| prng_seedcore_evprox_2: 4 | ||
| prng_seedcore_evdist_2: 0 | ||
| L2Pyr_soma_L: 22.1 | ||
| L2Pyr_soma_diam: 23.4 | ||
| L2Pyr_soma_cm: 0.6195 | ||
| L2Pyr_soma_Ra: 200.0 | ||
| L2Pyr_dend_cm: 0.6195 | ||
| L2Pyr_dend_Ra: 200.0 | ||
| L2Pyr_apicaltrunk_L: 59.5 | ||
| L2Pyr_apicaltrunk_diam: 4.25 | ||
| L2Pyr_apical1_L: 306.0 | ||
| L2Pyr_apical1_diam: 4.08 | ||
| L2Pyr_apicaltuft_L: 238.0 | ||
| L2Pyr_apicaltuft_diam: 3.4 | ||
| L2Pyr_apicaloblique_L: 340.0 | ||
| L2Pyr_apicaloblique_diam: 3.91 | ||
| L2Pyr_basal1_L: 85.0 | ||
| L2Pyr_basal1_diam: 4.25 | ||
| L2Pyr_basal2_L: 255.0 | ||
| L2Pyr_basal2_diam: 2.72 | ||
| L2Pyr_basal3_L: 255.0 | ||
| L2Pyr_basal3_diam: 2.72 | ||
| L2Pyr_ampa_e: 0.0 | ||
| L2Pyr_ampa_tau1: 0.5 | ||
| L2Pyr_ampa_tau2: 5.0 | ||
| L2Pyr_nmda_e: 0.0 | ||
| L2Pyr_nmda_tau1: 1.0 | ||
| L2Pyr_nmda_tau2: 20.0 | ||
| L2Pyr_gabaa_e: -80.0 | ||
| L2Pyr_gabaa_tau1: 0.5 | ||
| L2Pyr_gabaa_tau2: 5.0 | ||
| L2Pyr_gabab_e: -80.0 | ||
| L2Pyr_gabab_tau1: 1.0 | ||
| L2Pyr_gabab_tau2: 20.0 | ||
| L2Pyr_soma_gkbar_hh2: 0.01 | ||
| L2Pyr_soma_gnabar_hh2: 0.18 | ||
| L2Pyr_soma_el_hh2: -65.0 | ||
| L2Pyr_soma_gl_hh2: 4.26e-05 | ||
| L2Pyr_soma_gbar_km: 250.0 | ||
| L2Pyr_dend_gkbar_hh2: 0.01 | ||
| L2Pyr_dend_gnabar_hh2: 0.15 | ||
| L2Pyr_dend_el_hh2: -65.0 | ||
| L2Pyr_dend_gl_hh2: 4.26e-05 | ||
| L2Pyr_dend_gbar_km: 250.0 | ||
| L5Pyr_soma_L: 39.0 | ||
| L5Pyr_soma_diam: 28.9 | ||
| L5Pyr_soma_cm: 0.85 | ||
| L5Pyr_soma_Ra: 200.0 | ||
| L5Pyr_dend_cm: 0.85 | ||
| L5Pyr_dend_Ra: 200.0 | ||
| L5Pyr_apicaltrunk_L: 102.0 | ||
| L5Pyr_apicaltrunk_diam: 10.2 | ||
| L5Pyr_apical1_L: 680.0 | ||
| L5Pyr_apical1_diam: 7.48 | ||
| L5Pyr_apical2_L: 680.0 | ||
| L5Pyr_apical2_diam: 4.93 | ||
| L5Pyr_apicaltuft_L: 425.0 | ||
| L5Pyr_apicaltuft_diam: 3.4 | ||
| L5Pyr_apicaloblique_L: 255.0 | ||
| L5Pyr_apicaloblique_diam: 5.1 | ||
| L5Pyr_basal1_L: 85.0 | ||
| L5Pyr_basal1_diam: 6.8 | ||
| L5Pyr_basal2_L: 255.0 | ||
| L5Pyr_basal2_diam: 8.5 | ||
| L5Pyr_basal3_L: 255.0 | ||
| L5Pyr_basal3_diam: 8.5 | ||
| L5Pyr_ampa_e: 0.0 | ||
| L5Pyr_ampa_tau1: 0.5 | ||
| L5Pyr_ampa_tau2: 5.0 | ||
| L5Pyr_nmda_e: 0.0 | ||
| L5Pyr_nmda_tau1: 1.0 | ||
| L5Pyr_nmda_tau2: 20.0 | ||
| L5Pyr_gabaa_e: -80.0 | ||
| L5Pyr_gabaa_tau1: 0.5 | ||
| L5Pyr_gabaa_tau2: 5.0 | ||
| L5Pyr_gabab_e: -80.0 | ||
| L5Pyr_gabab_tau1: 1.0 | ||
| L5Pyr_gabab_tau2: 20.0 | ||
| L5Pyr_soma_gkbar_hh2: 0.01 | ||
| L5Pyr_soma_gnabar_hh2: 0.16 | ||
| L5Pyr_soma_el_hh2: -65.0 | ||
| L5Pyr_soma_gl_hh2: 4.26e-05 | ||
| L5Pyr_soma_gbar_ca: 60.0 | ||
| L5Pyr_soma_taur_cad: 20.0 | ||
| L5Pyr_soma_gbar_kca: 0.0002 | ||
| L5Pyr_soma_gbar_km: 200.0 | ||
| L5Pyr_soma_gbar_cat: 0.0002 | ||
| L5Pyr_soma_gbar_ar: 1e-06 | ||
| L5Pyr_dend_gkbar_hh2: 0.01 | ||
| L5Pyr_dend_gnabar_hh2: 0.14 | ||
| L5Pyr_dend_el_hh2: -71.0 | ||
| L5Pyr_dend_gl_hh2: 4.26e-05 | ||
| L5Pyr_dend_gbar_ca: 60.0 | ||
| L5Pyr_dend_taur_cad: 20.0 | ||
| L5Pyr_dend_gbar_kca: 0.0002 | ||
| L5Pyr_dend_gbar_km: 200.0 | ||
| L5Pyr_dend_gbar_cat: 0.0002 | ||
| L5Pyr_dend_gbar_ar: 1e-06 | ||
| N_pyr_x: 10 | ||
| N_pyr_y: 10 | ||
| gbar_L2Pyr_L2Pyr_ampa: 0.0005 | ||
| gbar_L2Pyr_L2Pyr_nmda: 0.0005 | ||
| gbar_L2Basket_L2Pyr_gabaa: 0.05 | ||
| gbar_L2Basket_L2Pyr_gabab: 0.05 | ||
| gbar_L2Pyr_L5Pyr: 0.00025 | ||
| gbar_L2Basket_L5Pyr: 0.001 | ||
| gbar_L5Pyr_L5Pyr_ampa: 0.0005 | ||
| gbar_L5Pyr_L5Pyr_nmda: 0.0005 | ||
| gbar_L5Basket_L5Pyr_gabaa: 0.025 | ||
| gbar_L5Basket_L5Pyr_gabab: 0.025 | ||
| gbar_L2Pyr_L2Basket: 0.0005 | ||
| gbar_L2Basket_L2Basket: 0.02 | ||
| gbar_L2Pyr_L5Basket: 0.00025 | ||
| gbar_L5Pyr_L5Basket: 0.0005 | ||
| gbar_L5Basket_L5Basket: 0.02 | ||
| t0_input_prox: 1000. | ||
| t0_input_stdev_prox: 0.0 | ||
| tstop_input_prox: 1001 | ||
| f_input_prox: 10. | ||
| f_stdev_prox: 20. | ||
| events_per_cycle_prox: 2 | ||
| repeats_prox: 10 | ||
| input_prox_A_weight_L2Pyr_ampa: 0.0 | ||
| input_prox_A_weight_L2Pyr_nmda: 0.0 | ||
| input_prox_A_weight_L2Basket_ampa: 0.0 | ||
| input_prox_A_weight_L2Basket_nmda: 0.0 | ||
| input_prox_A_delay_L2: 0.1 | ||
| input_prox_A_weight_L5Pyr_ampa: 0.0 | ||
| input_prox_A_weight_L5Pyr_nmda: 0.0 | ||
| input_prox_A_weight_L5Basket_ampa: 0.0 | ||
| input_prox_A_weight_L5Basket_nmda: 0.0 | ||
| input_prox_A_delay_L5: 1.0 | ||
| t0_input_dist: 1000 | ||
| t0_input_stdev_dist: 0.0 | ||
| tstop_input_dist: 1001 | ||
| f_input_dist: 10. | ||
| f_stdev_dist: 20. | ||
| events_per_cycle_dist: 2 | ||
| repeats_dist: 10 | ||
| input_dist_A_weight_L2Pyr_ampa: 0.0 | ||
| input_dist_A_weight_L2Pyr_nmda: 0.0 | ||
| input_dist_A_weight_L2Basket_ampa: 0.0 | ||
| input_dist_A_weight_L2Basket_nmda: 0.0 | ||
| input_dist_A_delay_L2: 5.0 | ||
| input_dist_A_weight_L5Pyr_ampa: 0.0 | ||
| input_dist_A_weight_L5Pyr_nmda: 0.0 | ||
| input_dist_A_delay_L5: 5.0 | ||
| t_evprox_1: 19.640010975644547 | ||
| sigma_t_evprox_1: 2.5179521603075745 | ||
| numspikes_evprox_1: 1 | ||
| gbar_evprox_1_L2Pyr_ampa: 0.2500674589544454 | ||
| gbar_evprox_1_L2Pyr_nmda: 0.0 | ||
| gbar_evprox_1_L2Basket_ampa: 0.20104903932585344 | ||
| gbar_evprox_1_L2Basket_nmda: 0.0 | ||
| gbar_evprox_1_L5Pyr_ampa: 0.014147863532069815 | ||
| gbar_evprox_1_L5Pyr_nmda: 0.0 | ||
| gbar_evprox_1_L5Basket_ampa: 0.411489666201271 | ||
| gbar_evprox_1_L5Basket_nmda: 0.0 | ||
| t_evdist_1: 65.68850971879435 | ||
| sigma_t_evdist_1: 3.8127684241428192 | ||
| numspikes_evdist_1: 1 | ||
| gbar_evdist_1_L2Pyr_ampa: 1.1545725280436658 | ||
| gbar_evdist_1_L2Pyr_nmda: 0.29865086671852326 | ||
| gbar_evdist_1_L2Basket_ampa: 0.060811412658119346 | ||
| gbar_evdist_1_L2Basket_nmda: 0.02097586057916285 | ||
| gbar_evdist_1_L5Pyr_ampa: 1.0041030562529438 | ||
| gbar_evdist_1_L5Pyr_nmda: 0.5793058064095374 | ||
| t_evprox_2: 90.52932757403522 | ||
| sigma_t_evprox_2: 10.375891755504085 | ||
| numspikes_evprox_2: 1 | ||
| gbar_evprox_2_L2Pyr_ampa: 48.22690868352876 | ||
| gbar_evprox_2_L2Pyr_nmda: 0.0 | ||
| gbar_evprox_2_L2Basket_ampa: 6.397573251250002e-05 | ||
| gbar_evprox_2_L2Basket_nmda: 0.0 | ||
| gbar_evprox_2_L5Pyr_ampa: 49.865907926990864 | ||
| gbar_evprox_2_L5Pyr_nmda: 0.0 | ||
| gbar_evprox_2_L5Basket_ampa: 0.017913595471474676 | ||
| gbar_evprox_2_L5Basket_nmda: 0.0 | ||
| sync_evinput: 0 | ||
| inc_evinput: 0.0 | ||
| L2Pyr_Pois_A_weight_ampa: 0.0 | ||
| L2Pyr_Pois_A_weight_nmda: 0.0 | ||
| L2Pyr_Pois_lamtha: 0.0 | ||
| L2Basket_Pois_A_weight_ampa: 0.0 | ||
| L2Basket_Pois_A_weight_nmda: 0.0 | ||
| L2Basket_Pois_lamtha: 0.0 | ||
| L5Pyr_Pois_A_weight_ampa: 0.0 | ||
| L5Pyr_Pois_A_weight_nmda: 0.0 | ||
| L5Pyr_Pois_lamtha: 0.0 | ||
| L5Basket_Pois_A_weight_ampa: 0.0 | ||
| L5Basket_Pois_A_weight_nmda: 0.0 | ||
| L5Basket_Pois_lamtha: 0.0 | ||
| t0_pois: 0.0 | ||
| T_pois: -1 | ||
| Itonic_A_L2Pyr_soma: 0.0 | ||
| Itonic_t0_L2Pyr_soma: 0.0 | ||
| Itonic_T_L2Pyr_soma: -1.0 | ||
| Itonic_A_L2Basket: 0.0 | ||
| Itonic_t0_L2Basket: 0.0 | ||
| Itonic_T_L2Basket: -1.0 | ||
| Itonic_A_L5Pyr_soma: 0.0 | ||
| Itonic_t0_L5Pyr_soma: 0.0 | ||
| Itonic_T_L5Pyr_soma: -1.0 | ||
| Itonic_A_L5Basket: 0.0 | ||
| Itonic_t0_L5Basket: 0.0 | ||
| Itonic_T_L5Basket: -1.0 |