「ベイズ統計モデリング―R,JAGS,Stanによるチュートリアル― 原著第2版」　サポートサイト用リポジトリ

こちらは、共立出版より発売された「ベイズ統計モデリング-R,JAGS,Stanによるチュートリアル- 原著第2版」のサポートサイトを設置しているリポジトリです。このリンク先に本書の目次および第1章のpdfファイルへのリンクがあります。この本は、「Doing Bayesian Data Analysis 2nd Edition - A Tutorial with R, JAGS, and Stan」の日本語版となります。

なお，サポートサイト自体は，以下のurlへ進んでください:

https://kazutan.github.io/DBDA2E-ja

このREADMEには運用などについてまとめています。

このリポジトリの構成について

*.Rmdファイル

各ページのメインとなる部分です。現時点では以下のファイルがあります:

• index.Rmd: トップページ
• about.Rmd: 「このサイトについて」のページ
• errata.Rmd: 「正誤表」のページ
• exercise.Rmd: 「エクササイズ」のページ
• code.Rmd: 「コード」のページ
• relate.Rmd: 「関連情報」のページ

_site.ymlファイル

サイト設定ファイルです。記述方法などについてはR Markdown公式サイトのこちらのページを参照してください。

docs/ディレクトリ

サイト公開用に設定しているディレクトリです。この内容はRStudioのBuildで自動生成させますので，手作業による変更はしないでください(してもすぐ消し飛びます)。

data/ディレクトリ

正誤表のためのデータ(csv)などを設置しています。ここのデータをRmdで読み取って表などを自動生成しますので，追加などはここのデータをいじります。

pics/ディレクトリ

Webページ内にて利用する画像ファイルを設置しています。Rmdファイルなどで画像を参照させたいときは，このディレクトリに画像ファイルを置いて，pics/hoge.pngといったパスで呼び出してください。

plugins/ディレクトリ

Webサイト内で使っているプラグインです。内容を把握してない方はそっとしておいてください。

css/ディレクトリ

Webサイト内で使っているcssファイルを設置しています。

partial/ディレクトリ

ヘッダー部分やフッター部分で使っているhtmlファイルを設置しています。

その他のファイル

README.mdはリポジトリの説明ファイル(このドキュメント)で，それ以外はそっとしておいてください。

運用について

masterへのPushは禁止とし，プルリク駆動とします。どなたからでもプルリクは受け付けますが，レビューによっては修正をお願いすることがあることをご了承ください。

以下，編集方法について説明します。

サイトのレンダリングについて

render_all_Rmd.Rのスクリプトを実行してください。

正誤表への追加・修正について

1. data/errata_list_Raw.csvファイルを開き，内容を追加・修正して保存
2. errata.Rmdを開き，Knitを実行して変更を確認(自動で読み込んで表にします)
3. 問題がなければcommitしてpushしてプルリクを投げてください

プルリクの内容を確認し，問題がなければそのままmergeします。その後に管理側で更新情報を追記してBuild Websiteを行います。

その他の内容の追加・修正について

1. 該当するRmdファイルを開き，編集
2. 保存してknitを実行して変更を確認
3. 問題がなければcommitしてpushしてプルリクを投げてください

プルリクの内容を確認し，問題がなければそのままmergeします。その後に管理側で更新情報を追記してBuild Websiteを行います。

サイト設定などの追加・修正について

要望や指摘についてはissueへお願いします。もしこれらの設定を含むプルリクが挙がった場合，対応には時間がかかることをご了承ください。