Este repositorio contiene el script de R y los resultados del análisis espacial llevado a cabo en el marco del contrato de apoyo tecnológico firmado entre la Agencia Estatal Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) y CORY's - Investigación y Conservación de la Biodiversidad. El informe de resultados puede enontrarse aquí.
Se ha evaluado la distribución espacial en términos de biomasa y probabilidad de ocurrencia de las tres principales especies de pequeños peces pelágicos (anchoa, sardina y alacha) en la plataforma continental ibérica dentro de la sub-área geográfica (GSA) 06, y particularmente dentro de la Zona de Especial Protección para las Aves (ZEPA) ES0000512.
Para hacer estas estimas combinamos dos bases de datos independientes (procedentes de campañas oceanográficas MEDITS y datos de capturas reportados en los diarios de pesca de buques arrastreros) con información ambiental dentro de avanzados modelos de distribución de especies (BRT-RAC).
En el repositorio se incluye tanto el código utilizado para llevar a cabo el análisis como los resultados obtenidos.
La carpeta contiene las figuras incluidas en el informe del proyecto: área de estudio, mapas de las variables ambientales, tendencias temporales y funciones de densidad de probabilidad de la biomasa de las tres especies, mapas de probabilidad de ocurrencia predicha para cada especie (anual -media de junio y julio- y media de los años 1998 a 2019) y mapas de biomasa predicha para cada especie (anual -media de junio y julio- y media de los años 1998 a 2019).
Contiene las predicciones de probabilidad de ocurrencia y de biomasa para cada especie (anchoa, sardina y alacha) para los años 1998 a 2019 (media de junio y julio), así como la media de todos los años y su desviación estándar.
El archivo BRT-RAC_Hurdle-Models.R contiene el código utilizado para ajustar modelos BRT-RAC (Boosted Regression Trees - Residual Autocovariate) con el método delta log-normal o hurdle model.
Los documentos gadm36_ESP_0_sp.rds y gadm36_FRA_0_sp.rds contienen los polígonos de España y Francia, respectivamente. Estos se han obenido mediante la función getData() del paquete <raster> (version 3.6-14).
Archivos en formato simple con las áreas (i.e. polígonos) de la sub-área geográfica (GSA) 06 y la Zona de Especial Protección para las Aves del Delta del Ebro (ZEPA ES0000512).
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