jupyterlab

省去自己配置的时间，直接在服务器上直接使用

docker run --rm -it -p 8888:9000 \
    -v `pwd`:/lab/works btrspg/jupyterlab:latest

来启动服务。

其中pwd可以替换成工作目录（包含数据/脚本/）

Example

1. run in server

2. use in desktop

在desktop的浏览器上输入服务器ip:8888即可，工作目录挂载在works下

其他说明

• 本image只包含最基本的python3.5,julia1.0.3,R3.5包， 如果想要想要安装特定的包可以用过jupyerlab进行安装

!pip install pysam
#or
!conda install -c r ggplot2

但是安装完后，如果container停掉，所有恢复原装。如果有一直使用的包，建议自建image

自己写Dockerfile

FROM btrspg/jupyterlab

RUN conda install -r anaconda bioconductor-deseq2

然后build

docker build -t <user>/<name> .

docker run --rm -it -p 8888:9000 \
    -v `pwd`:/lab/works <user>/<name> 

即可