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Mas Kot edited this page Apr 3, 2020 · 62 revisions

小寺正明

役員

  • 2012年12月1日〜 国際生化学命名委員会（JCBN）準委員
  • 2015年4月1日〜2019年3月31日 日本バイオインフォマティクス学会（JSBi） 理事
  • 2016年 日本バイオインフォマティクス学会2016年年会 第5回生命医薬情報学連合大会IIBMP2016 実行委員
  • 2016年 16th International Conference on BioInformatics and BioEngineering (IEEE BIBE 2016) PC member
  • 2018年3月1日〜 日本化学会ケモインフォマティクス部会（CICSJ） 幹事
  • 2018年3月1日〜 日本化学会ケモインフォマティクス部会（CICSJ） 若手の会 世話人
  • 2018年4月1日〜 日本バイオインフォマティクス学会（JSBi） 幹事
  • 2019年 第42回日本化学会ケモインフォマティクス討論会 実行委員
  • 2019年 日本バイオインフォマティクス学会2019年年会 第8回生命医薬情報学連合大会IIBMP2019 プログラム委員長

これまでの担当科目

  • 東京大学

    • 講義 総合科目・現代工学基礎Ⅱ「化学情報とシミュレーション」（学部１〜２年生相当）
    • 実習 全学ゼミ「機械学習を体験しデータ駆動型化学の世界に入門」（学部１〜２年生相当）、コンピュータ及び演習（学部２年生相当）、コンピュータ化学演習（学部３年生相当）、 化学システム設計特論（修士１年生相当）

  • 東京工業大学

    • 講義 バイオフロンティアゼミ（学部１年生相当）、生命統計学（学部２年生相当）、生命情報学（学部２年生相当）、生物化学（学部２年生相当）、ゲノム情報学（学部３年生相当）、生物計算科学（修士課程１年生相当）、生命化学情報学論（修士課程１年生相当）
    • 実習 バイオものつくり（学部１年生相当）、生命科学基礎実験（学部２年生相当）、生命科学総合実験（学部３年生相当）

  • 京都大学

    • 講義 バイオインフォマティクス特論Ｂ（修士課程１年生相当）
    • 実習 KEGG/GenomeNetデータベース講習会（一般人向け）

外部資金獲得実績

  • 尾崎克久 (代表者) 小寺正明（分担者） 植食性昆虫が進化に至る、最初の変化は何か 科研費・基盤研究(C) 2018-2020

  • 小寺正明（代表者） 大規模計測データからの汎用的な天然物合成経路予測 科研費・基盤研究(C) 2017-2019

  • 小寺正明（代表者） 栽培に資するファイトケミカルの具体的検討ならびにその生合成経路の予測手法に係る事前検討 さきがけ特定課題調査研究（研究領域：「情報科学との協働による革新的な農産物栽培手法を実現するための技術基盤の創出」） 2016

  • 小寺正明（代表者） 新規代謝経路再構築に向けた、化学変換パターンからの酵素オーソログ遺伝子の同時予測 公益財団法人 村田学術振興財団 （海外派遣） 2016

  • 小寺正明（代表者） 多様な昆虫ゲノム比較へ向けた情報学的基盤形成 科研費・若手研究(B) 2013-2015

  • 小寺正明（代表者） アブイニシオ代謝経路再構築へ向けた反応ネットワーク予測 科研費・新学術領域研究(研究領域提案型)「生合成マシナリー:生物活性物質構造多様性創出システムの解明と制御」 2013-2014

研究業績

受賞歴

  1. 小寺正明. 2015年度Oxford Journals-JSBi Prize受賞講演「生命情報と化学情報の融合解析による生体分子間相互作用と代謝経路予測の研究」 生命医薬情報学連合大会2015年会, 京都大学(2015).

論文（査読付き）

  1. 陳嘉修、田中健一、小寺正明、船津公人. Comparison and Improvement of the Predictability and Interpretability with Ensemble Learning Models in QSPR Applications, Journal of Cheminformatics volume 12, Article number: 19 (2020).

  2. Kohei Amano, Tsubasa Matsumoto, Kenichi Tanaka, Kimito Funatsu & Masaaki Kotera. Metabolic disassembler for understanding and predicting the biosynthetic units of natural products. BMC Bioinformatics volume 20, Article number: 728 (2019)

  3. Shohei Takase, Kota Kera, Yoshiki Nagashima, Kazuto Mannen, Tsutomu Hosouchi, Sayaka Shinpo, Moeka Kawashima, Yuki Kotake, Hiroki Yamada, Yusuke Saga, Junnosuke Otaka, Hiroshi Araya, Masaaki Kotera, Hideyuki Suzuki, and Tetsuo Kushiro. Allylic hydroxylation by cytochrome P450 from Momordica charantia triggers key transformations to produce a variety of bitter cucurbitacins. Journal of Biological Chemistry, submitted 2019.

  4. 海東和麻、小寺正明、船津公人. Novel Electrotopological Atomic Descriptors for the Prediction of Xenobiotic Cytochrome P450 Reactions, Molecular Informatics, 2019. https://doi.org/10.1002/minf.201900010

  5. 菅原悠樹、小寺正明、田中健一、船津公人. Ensemble Machine Learning and Applicability Domain Estimation for Fluorescence Properties and its Application to Structural Design, Journal of Computer Aided Chemistry, 2019, 20, 7-17. https://doi.org/10.2751/jcac.20.7

  6. 海東和麻、小寺正明、船津公人. Predictive Classification Models for Cytochrome P450 catalyzed Reactions using Substrate-Product Structure Differences, Molecular Informatics, accepted 2019.

  7. 田部井靖生、小寺正明、澤田隆介、山西芳裕. Network-based characterization of drug-protein interaction signatures with a space-efficient approach, BMC Systems Biology, 2019m, 13 (Suppl 2):39, 17th Asia Pacific Bioinformatics Conference (APBC), 2019. https://doi.org/10.1186/s12918-019-0691-1

  8. Francesca Grisoni, Claudia S. Neuhaus, Miyabi Hishinuma, Gisela Gabernet, Jan A. Hiss, Masaaki Kotera and Gisbert Schneider. De novo design of anticancer peptides by ensemble artificial neural networks, Journal of Molecular Modeling, (2019) 25: 112. https://doi.org/10.1007/s00894-019-4007-6

  9. Rutger Vos et al. BioHackathon 2015: Semantics of Data for Life Sciences and Reproducible Research, F1000Research, submitted 2019.

  10. Toshiaki Katayama et al. BioHackathon series in 2013 and 2014: improvements of semantic interoperability in life science data and services, F1000Research, submitted 2019.

  11. 陳嘉修、田中健一、小寺正明、船津公人. Atom-Interpretable Neural Network (AINN): An Interpretable Purpose Deep Neural Network, Journal of Chemical Information and Modeling, submitted 2019.

  12. 佐方冬彩子、小寺正明、田中健一、中野博史、浮田昌一、白沢楽、冨谷茂隆、船津公人. Developing Novel Descriptors to Predict Physical Properties of Inorganic Compounds from Compositional Formula. Journal of Computer Aided Chemistry (2018). https://doi.org/10.2751/jcac.19.7

  13. 武藤愛、竹本和広、金谷重彦、仲里猛留、時松敏明、松本夏史、河野麻予、忠鉢裕子、尾崎克久、小寺正明. Data integration aids understanding of butterfly–host plant networks. Scientific Reports, Mar 6;7:43368 (2017).

  14. 岩田通夫、澤田隆介、岩田浩明、小寺正明、山西芳裕. Elucidating the modes of action for bioactive compounds in a cell-specific manner by large-scale chemically-induced transcriptomics. Scientific Reports, Jan 10;7:40164 (2017).

  15. 田部井靖生、山西芳裕、小寺正明. Simultaneous prediction of enzyme orthologs from chemical transformation patterns for de novo metabolic pathway reconstruction. Bioinformatics. Jun 15;32(12):i278-i287 (2016).

  16. 守屋勇樹、山田拓司、奥田修二郎、中川善一、小寺正明、時松敏明、金久實、五斗進. Identification of Enzyme Genes Using Chemical Structure Alignments of Substrate-Product Pairs. J Chem Inf Model. Mar 28;56(3):510-516 (2016).

  17. 岩田浩明、澤田隆介、水谷紗弥佳、小寺正明、山西芳裕. Large-Scale Prediction of Beneficial Drug Combinations Using Drug Efficacy and Target Profiles. J Chem Inf Model. Dec 28;55(12):2705-16 (2015)

  18. 山西芳裕、田部井靖生、小寺正明. Metabolome-scale de novo pathway reconstruction using regioisomer-sensitive graph alignments. Bioinformatics. Jun 15;31(12):i161-70 (2015)

  19. 金昭、小寺正明、五斗進. Virus proteins similar to human proteins as possible disturbance on human pathways Syst Synth Biol. Dec;8(4):283-295 (2014)

  20. 小寺正明、西村陽介、中川善一、武藤愛、守屋勇樹、岡本忍、川島修一、片山俊明、時松敏明、金久實、五斗進. PIERO ontology for analysis of biochemical transformations: effective implementation of reaction information in the IUBMB enzyme list J Bioinform Comput Biol. Dec;12(6):1442001 (2014)

  21. 小寺正明、田部井靖生、山西芳裕、武藤愛、守屋勇樹、時松敏明、五斗進. Metabolome-scale prediction of intermediate compounds in multistep metabolic pathways with a recursive supervised approach. Bioinformatics. Jun 15;30(12):i165-i174 (2014)

  22. 田中健一、木下聖子、小寺正明、澤木弘道、土屋伸一郎、藤田典昭、鹿内俊秀、加藤雅樹、河野信、山田一作、成松久. WURCS: the Web3 unique representation of carbohydrate structures. J Chem Inf Model. Jun 23;54(6):1558-1566 (2014).

  23. 山西芳裕、小寺正明、守屋勇樹、澤田隆介、金久實、五斗進. DINIES: drug-target interaction network inference engine based on supervised analysis. Nucleic Acids Res. Jul;42(Web Server issue):W39-45 (2014).

  24. 水谷紗弥佳、野呂洋介、小寺正明、五斗進. Pharmacoepidemiological characterization of drug-induced adverse reaction clusters towards understanding of their mechanisms. Comput Biol Chem. Jun;50:50-59 (2014).

  25. 片山俊明、他84名（うち小寺正明は46番目） BioHackathon series in 2011 and 2012: penetration of ontology and linked data in life science domains. J Biomed Semantics. Feb 5;5(1):5 (2014).

  26. 小寺正明、田部井靖生、山西芳裕、守屋勇樹、時松敏明、金久實、五斗進. KCF-S: KEGG Chemical Function and Substructure for improved interpretability and prediction in chemical bioinformatics BMC Systems Biology, 7 Suppl 6:S2 (2013).

  27. 岩田浩明、水谷紗弥佳、田部井靖生、小寺正明、五斗進、山西芳裕. Inferring protein domains associated with drug side effects based on drug-target interaction network BMC Systems Biology, 7 Suppl 6:S18 (2013).

  28. 田部井靖生、岸本章宏、小寺正明、山西芳裕. Succinct Interval-Splitting Tree for Scalable Similarity Search of Compound-Protein Pairs with Property Constraints Proceedings of the 19th ACM SIGKDD international conference on Knowledge discovery and data mining, 176-184, (2013).

  29. 小寺正明、田部井靖生、山西芳裕、時松敏明、五斗進. Supervised de novo reconstruction of metabolic pathways from metabolome- scale compound sets Bioinformatics, 29 (13), i135-i144 (2013).

  30. 武藤愛、小寺正明、時松敏明、中川善一、五斗進、金久實. Modular architecture of metabolic pathways revealed by conserved sequences of reactions Journal of Chemical Information and Modeling, 53 (3): 613-622 (2013).

  31. 山西芳裕、Edouard Pauwels、小寺正明. Drug side-effect prediction based on the integration of chemical and biological spaces Journal of Chemical Information and Modeling, 52 (12): 3284-3292 (2012).

  32. 財部将孝、小寺正明、西村陽介、五斗進、山西芳裕. Drug target prediction using adverse event report systems: a pharmacogenomic approach Bioinformatics, 28 (18): i611-i618 (2012)

  33. 小寺正明、山西芳裕、守屋勇樹、金久實、五斗進. GENIES: gene network inference engine based on supervised analysis Nucleic Acids Research, 40 (W1): W162-W167 (2012).

  34. 小寺正明、時松敏明、金久實、五斗進. MUCHA: multiple chemical alignment algorithm to identify building block substructures of orphan secondary metabolites BMC Bioinformatics, 12 (Suppl 14) S1 (2011).

  35. 財部将孝、重水大智、小寺正明、五斗進、金久實. Network-based analysis and characterization of adverse drug-drug interactions Journal of Chemical Information and Modeling, 51 (11): 2977-2985 (2011).

  36. 小寺正明、小林武史、服部正泰、時松敏明、五斗進、三原久明、金久實. Comprehensive genomic analysis of sulfur-relay pathway genes Genome Informatics, 24, 104-115 (2010).

  37. 西村陽介、時松敏明、小寺正明、五斗進、金久實. Genome-wide analysis of plant UGT family based on sequence and substrate information Genome Informatics, 24, 127-138 (2010).

  38. 山西芳裕、小寺正明、金久實、五斗進. Drug-target interaction prediction from chemical, genomic and pharmacological data in an integrated framework Bioinformatics, 26 (12): i246-i254 (2010).

  39. 守屋勇樹、重水大智、服部正泰、時松敏明、小寺正明、五斗進、金久實. PathPred: an enzyme-catalyzed metabolic pathway prediction server Nucleic Acids Research, 38, W138-W143 (2010).

  40. 財部将孝、重水大智、小寺正明、五斗進、金久實. Characterization and Classification of Adverse Drug Interactions Genome Informatics, 22, 167-175 (2009)

  41. 山西芳裕、服部正泰、小寺正明、五斗進、金久實. E-zyme: predicting potential EC numbers from the chemical transformation pattern of substrate-product pairs Bioinformatics, 25 (12): i179-i186 (2009).

  42. 小寺正明、Andrew G. McDonald, Sinead Boyce, Keith F. Tipton. Eliciting possible reaction equations and metabolic pathways involving orphan metabolites Journal of Chemical Information and Modeling, 48 (12): 2335-2349 (2008).

  43. 小寺正明、Andrew G. McDonald, Sinead Boyce, Keith F. Tipton. Functional Group and Substructure Searching as a Tool in Metabolomics. PLoS ONE 3(2): e1537 (2008).

  44. 高橋-寺田彰子、小寺正明、大島健太、古本強、松村浩由、甲斐泰、泉井桂. Maize phosphoenolpyruvate carboxylase. Mutations at the putative binding site for glucose 6-phosphate caused desensitization and abolished responsiveness to regulatory phosphorylation Journal of Biological Chemistry, 280 (12): 11798-11806 (2005).

  45. 小寺正明、奥野恭史、服部正泰、五斗進、金久實. Computational assignment of the EC numbers for genomic-scale analysis of enzymatic reactions Journal of American Chemical Society, 126 (50): 16487-16498 (2004).

論文（査読無し）

  1. 尾崎克久、龍田勝輔、小寺正明、武藤愛、吉川寛. Evolution of gustatory sensing mechanism for host selection in swallowtail butterflies Chemical Senses 41 (9), E228-E228 (2016).

  2. 小寺正明、平川美夏、時松敏明、五斗進、金久實. The KEGG databases and tools facilitating omics analysis: latest developments involving human diseases and pharmaceuticals Methods in molecular biology, 802, 19-39 (2012).

  3. 小寺正明、時松敏明、中川善一、守屋勇樹、金久實、五斗進. Development of a simplified method for compound graph matching in enzyme reactions. IPSJ SIG Technical Report, Vol.2011-BIO-24, No.2 (2011).

  4. 小寺正明、服部正泰、呉敏児、山本留美子、米納朋子、藪崎純子、外村孝一郎、五斗進、金久實. RPAIR: a reactant-pair database representing chemical changes in enzymatic reactions. Genome Informatics, 15, P062 (2004)

総説

  1. 小寺正明. Physicochemical property labels on molecular descriptors for improved analysis of compound-protein and compound-compound networks. Computational Chemogenomics, Springer, 2018.

  2. 山西芳裕、田部井靖生、小寺正明. Statistical Machine Learning for Agriculture and Human Health Care Based on Biomedical Big Data In: Anderssen R., et al. (eds) Agriculture as a Metaphor for Creativity in All Human Endeavors. FMfI 2016. Mathematics for Industry, vol 28. Springer, Singapore

  3. 小寺正明、五斗進. Metabolic pathway reconstruction strategies for central metabolism and natural product biosynthesis Biophysics and Physicobiology 13:195-205 (2016)

  4. 小寺正明、五斗進. 教師付き学習法によるメタボローム規模での多段階代謝経路予測 生物物理 Vol. 55 (2015) No. 3 通巻319号 p. 160-163.

  5. 澤田隆介、小寺正明、山西芳裕. Benchmarking a wide range of chemical descriptors for drug-target interaction prediction using a chemogenomic approach. Molecular Informatics, 33(11-12), pp 719–731, 2014

  6. 小寺正明、五斗進、金久實. Predictive genomic and metabolomic analysis for the standardization of enzyme data Perspectives in Science, 1, 24-32 (2014).

  7. 山田一作、木下聖子、松原正陽、土屋伸一郎、小寺正明、田中健一、藤田典昭、鹿内俊秀、加藤雅樹. WURCS: Web3 Unique Representation of Carbohydrate Structures for Semantic Web Glycobiology, Vol. 24. No. 11., 2014.

  8. 小寺正明. 代謝反応予測のケミカルバイオインフォマティクス CICSJ Bulletin, 31 (2): 30-33 (2013).

  9. 服部正泰、小寺正明. Chemoinformatics on Metabolic Pathways: Attaching Biochemical Information on Putative Enzymatic Reactions "Bioinformatics: Concepts, Methodologies, Tools, and Applications", Chapter 52, 986-1009, IGI Global (2013).

  10. 小寺正明、守屋勇樹、時松敏明、金久實、五斗進. KEGG and GenomeNet, New Developments, Metagenomic Analysis Encyclopedia of Metagenomics (Springer Reference), Springer-Verlag Berlin Heidelberg (2012).

  11. 小寺正明. パスウェイデータベースの選び方と使い方 『実験医学増刊Vol.29 No.15「使えるデータベース・ウェブツール」』第2章6、104-109頁(2011).

  12. 時松敏明、小寺正明、五斗進、金久實. KEGG and GenomeNet resources for predicting protein function from omics data including KEGG PLANT Resource Protein function prediction for omics era, Chapter 14, 271-288, Springer (2011).

招待講演（国際会議）

  1. Masaaki Kotera. "Computational identification of biosynthetic units for the understanding of secondary metabolism." Mini-symposium - Advances in Computer-Aided Molecular Design, College Doctoral Européen, University of Strasbourg, France, 22th February 2019. http://infochim.u-strasbg.fr/spip.php?rubrique257

招待講演（国内会議）

  1. 小寺正明. Importance of chemical information on insect-plant network Metabolisms as Survival Strategy in Plants（生存戦略としての植物の物質代謝） 第60回日本植物生理学会年会シンポジウム05, 名古屋大学, 2019年3月13日（水）https://jspp.org/annualmeeting/60/pdf/sympo.pdf

  2. 小寺正明. チョウとその食草：知の集合からわかること アゲハチョウのシンポジウム2 〜コンピューターが活躍する近未来の生物学〜 JT生命誌研究館, 2018年9月15日（土）

  3. 小寺正明. KNApSAcKデータベースを用いた昆虫・植物間化学的相互作用解析 トーゴーの日シンポジウム2016（東京大学弥生講堂）

  4. 小寺正明. 化学情報学と生命情報学の融合による群集生態学 第38回ケモインフォマティクス討論会(東京)(2016)

  5. 小寺正明. 統計と聞けば疑ってかかれ 2016年 第10回 日本ゲノム微生物学会 若手の会 研究会（八王子セミナーハウス）2016

  6. 小寺正明. 天然物代謝のコンピュータ予測と群集生態学への応用 早稲田大学シンポジウム 54号館 201教室 西早稲田キャンパス 2016/3/14（月）14：00～15：30

  7. 小寺正明. 2015年度Oxford Journals-JSBi Prize受賞講演「生命情報と化学情報の融合解析による生体分子間相互作用と代謝経路予測の研究」 生命医薬情報学連合大会2015年会, 京都大学(2015).

  8. Masaaki Kotera. "Metabolome-scale de novo pathway reconstruction using regioisomer-sensitive graph alignments" 大阪大学・生命機能数理モデル検討会 （招待講演） 2015年9月9日

  9. 小寺正明 「再帰的教師付き学習によるメタボロームスケールでの代謝反応中間代謝物予測」 第1回 東京海洋大学テニュアトラック教員企画による異分野交流ミニシンポジウム－生命科学の謎を解き明かす－

主な口頭発表（国際学会）

  1. 小寺正明. Simultaneous prediction of enzyme orthologs from chemical transformation patterns for de novo metabolic pathway reconstruction. The 24th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB 2016), Orlando, Florida, USA (2016).

  2. 小寺正明. Metabolome-scale de novo pathway reconstruction using regioisomer-sensitive graph alignments. Joint conference of the 23rd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and the 14th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB2015), Dublin, Germany (2015).

  3. 小寺正明. PIERO ontology for analysis of biochemical transformations: effective implementation of reaction information in the IUBMB enzyme list. The 25th International Conference on Genome Informatics (GIW), Tokyo (2014).

  4. 小寺正明. Metabolome-scale prediction of intermediate compounds in multistep metabolic pathways with a recursive supervised approach. The 22nd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB 2014), Boston, USA (2014).

  5. 小寺正明. KCF-S: KEGG Chemical Function and Substructure for improved interpretability and prediction in chemical bioinformatics The 24th International Conference on Genome Informatics (GIW), Singapore (2013).

  6. 小寺正明. Supervised learning of enzymatic reaction likeness for de novo reconstruction of metabolic pathways The 13th Annual International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology (IBSB), Kyoto, Japan (2013).

  7. 小寺正明. Supervised de novo reconstruction of metabolic pathways from metabolome-scale compound sets. Joint conference of the 21st Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and the 12th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB), Berlin, Germany (2013).

  8. 小寺正明. MUCHA: multiple chemical alignment algorithm to identify building block substructures of orphan secondary metabolites. The 22nd International Conference on Genome Informatics (GIW), Busan, South Korea (2011).

  9. 小寺正明. Comprehensive Genomic Analysis of Sulfur-relay Pathway Genes. The 10th Annual International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology (IBSB), Kyoto, Japan (2010).

  10. 山西芳裕、小寺正明. E-zyme: predicting potential EC numbers from the chemical transformation pattern of substrate-product pairs. Joint conference of the 17th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and the 8th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB), Stockholm, Sweden (2009).

  11. 小寺正明. Substructure searching and tracing as a tool in metabolomics. Chemical Annotation Workshop, Kyoto, Japan (2007).

  12. 小寺正明. Systematic Classification of Enzymatic Reactions and Its Application to Analysis of Ortholog Candidates. The 3rd Annual International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology (IBSB), Dresden, Germany (2003).

主な口頭発表（国内学会）

  1. 小寺正明. 天然物生合成と環境物質代謝のケモインフォマティクス "Cheminformatics for natural product biosynthesis and biodegradation of environmental pollutants" 第41回ケモインフォマティクス討論会 (2018)

  2. 小寺正明. 生化学システム工学を目指したインフォマティクス 質量分析インフォマティクス研究会・第3回ワークショップ（2018年）質量分析法とオミクス計算処理 2018年4月23日（月）10時30分 ～ 18時 JST東京本部別館（K's五番町ビル） 1階ホール

  3. 小寺正明. 生体分子とその機能のオントロジー構築と利用 第5回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2016）（東京国際交流館プラザ平成）BoF「生命科学におけるセマンティックデータの高度利活用に向けた課題と展望」

  4. 小寺正明. データ統合とオミックス解析による昆虫・植物間相互作用解析と昆虫代謝予測 日本昆虫学会第76回大会・第60回日本応用動物昆虫学会大会合同大会（大阪）(2016)

  5. 昆虫植物間相互作用データベースとマルチオミックス基盤 生命情報若手の会（神戸）(2014)

  6. 再帰的教師付き学習によるメタボロームスケールでの代謝反応中間代謝物予測 ゲノム微生物若手の会(2014)

  7. 昆虫種横断遺伝子検索データベースの開発 第３６回日本分子生物学会年会, 神戸 (2013).

  8. 化学構造に基づいたメタボロームスケール酵素反応ネットワーク予測 第８回メタボロームシンポジウム, 福岡 (2013).

  9. アブイニシオ代謝経路再構築のための酵素反応オントロジー 第７回メタボロームシンポジウム, 鶴岡 (2012)

  10. 酵素反応式中の化合物グラフマッチング簡略化手法の開発 SIG BIO 2011, 京都 (2011).

その他

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