Skip to content

nandobfer/Automacao-de-Analise-in-silico-Genetica-

Folders and files

NameName
Last commit message
Last commit date

Latest commit

 

History

36 Commits
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Repository files navigation

Automacao-de-Analise-in-silico-Genetica-

Esse script tem como funcionalidade transformar os resultados da análise de FGENESH do software Softberry do formato pdf para o formato de planilha Excel.

Após realizar a análise de FGENESH pelo software Softberry, você encontra todos os resultados dispostos em arquivos de pdf. Para facilitar o manejo dos dados, esse script serve para obter os dados do pdf e colocá-los em uma planilha de Excel contendo: posição de início e fim dos exons/ORFs, o score geral, o score específico de cada exon/ORF e a quantidade de pb para cada exon/ORF.

O script também coloca na planilha do Excel o nome de cada arquivo de pdf, ao lado dos resultados, para facilitar a identificação de cada linha de dados.

Além disso, caso exista mais de uma possibilidade para conformação dos exons/ORFs na sequência, ele identifica elas e imprimi na planilha todas as possibilidades.

About

No description, website, or topics provided.

Resources

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Packages

No packages published