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lauraluebbert committed Jan 11, 2024
1 parent be9c727 commit 57227b1
Showing 1 changed file with 6 additions and 6 deletions.
12 changes: 6 additions & 6 deletions docs/src/es/elm.md
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -1,14 +1,14 @@
> Parámetros de Python són iguales a los parámetros largos (`--parámetro`) de Terminal, si no especificado de otra manera. Banderas son parámetros de verdadero o falso (True/False) en Python. El manuál para cualquier modulo de gget se puede llamar desde la Terminal con la bandera `-h` `--help`.
## gget elm 🎭
Prediga localmente motivos lineales eucarióticos (ELMs) a partir de una secuencia de aminoácidos o UniProt ID utilizando datos de la [base de datos ELM](http://elm.eu.org/). Los datos de ELM se pueden descargar y distribuir para uso no comercial de acuerdo con el [Acuerdo de licencia de software de ELM](http://elm.eu.org/media/Elm_academic_license.pdf).
Prediga localmente motivos lineales eucarióticos (ELMs) a partir de una secuencia de aminoácidos o UniProt Acc utilizando datos de la [base de datos ELM](http://elm.eu.org/). Los datos de ELM se pueden descargar y distribuir para uso no comercial de acuerdo con el [Acuerdo de licencia de software de ELM](http://elm.eu.org/media/Elm_academic_license.pdf).
Produce: Resultados en formato JSON (Terminal) o Dataframe/CSV (Python). Este módulo devuelve dos tipos de resultados (ver ejemplos).

Antes de usar `gget elm` por primera vez, ejecute `gget setup elm` / `gget.setup("elm")` una vez (consulte también [`gget setup`](setup.md)).

**Parámetro posicional**
`sequence`
Secuencia de aminoácidos o ID de Uniprot (str).
Al proporcionar una ID de Uniprot, use la bandera `--uniprot` (Python: `uniprot==True`).
Secuencia de aminoácidos o Uniprot Acc (str).
Al proporcionar una Uniprot Acc, use la bandera `--uniprot` (Python: `uniprot==True`).

**Parámetros optionales**
`-s` `sensitivity`
Expand All @@ -26,7 +26,7 @@ Ruta al archivo en el que se guardarán los resultados (str), p. ej. "ruta/al/di

**Banderas**
`-u` `--uniprot`
Use esta bandera cuando `sequence` es un ID de Uniprot en lugar de una secuencia de aminoácidos.
Use esta bandera cuando `sequence` es una Uniprot Acc en lugar de una secuencia de aminoácidos.

`-e` `--expand`
Amplíe la información devuelta en el marco de datos de expresiones regulares para incluir los nombres de proteínas, los organismos y las referencias en las que se validó originalmente el motivo.
Expand All @@ -51,7 +51,7 @@ gget.setup(“elm”) # Descarga/actualiza la base de datos ELM local
ortholog_df, regex_df = gget.elm("LIAQSIGQASFV")
```

Encuentre ELM que proporcionen un ID de UniProt como entrada:
Encuentre ELM que proporcionen a una UniProt Acc:
```bash
gget setup elm # Descarga/actualiza la base de datos ELM local
gget elm -o gget_elm_results --uniprot Q02410 -e
Expand All @@ -65,7 +65,7 @@ ortholog_df, regex_df = gget.elm("Q02410", uniprot=True, expand=True)

ortholog_df:

|Ortholog_UniProt_ID|ProteinName|class_accession|ELMIdentifier |FunctionalSiteName |Description |Organism ||
|Ortholog_UniProt_Acc|ProteinName|class_accession|ELMIdentifier |FunctionalSiteName |Description |Organism ||
|:-----------------:|:---------:|:-------------:|:-------------:|:-----------------------------------:|:---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------:|:----------:|:-:|
|Q02410 |APBA1_HUMAN|ELME000357 |LIG_CaMK_CASK_1|CASK CaMK domain binding ligand motif|Motif that mediates binding to the calmodulin-dependent protein kinase (CaMK) domain of the peripheral plasma membrane protein CASK/Lin2.|Homo sapiens||
|Q02410 |APBA1_HUMAN|ELME000091 |LIG_PDZ_Class_2|PDZ domain ligands |The C-terminal class 2 PDZ-binding motif is classically represented by a pattern such as |Homo sapiens||
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