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pandemiaventana/pandemiaventana

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La pandemia por la ventana

Ilustración por Bernardo Dinamarca

Ilustración por Bernardo Dinamarca

Intro

La pandemia por la ventana es un sitio, realizado con formato de libro gracias a Jupyter Books, hecho por Alejandro Dinamarca, que recaba el trabajo de Numeral.lab en la Región de Tarapacá.

La página posee los siguientes ejes:

  • Reunir antecedentes del trabajo de Numeral.lab en la Región de Tarapacá en la pandemia del COVID-19.

  • Recopilar experiencias personales de Alejandro Dinamarca en el trabajo voluntario en Numeral.lab.

  • Monitoreo de la pandemia del COVID-19 en la Región de Tarapacá de forma automática.

  • Recabar información del repositorio del MICITEC en GitHub, específicamente, de la Región de Tarapacá.

  • Procesar datos recabados.

  • Generar informes (epidemiológicos, avance en campaña de vacunación y predictor de fase del Paso a Paso).

  • Generar concientización en ciudadanía bajo tendencias de la pandemia.

Agradecimientos al Equipo Futuro del MICITEC por la democratización de los datos de la pandemia en Chile, a los desarrolladores de Jupyter Notebook, Jupyter Book y a todas las librerías de Python implicadas en los scripts, como también, a los propios desarrolladores de Python.

Favor, cualquier sugerencia o comentario, hacerlo llegar mediante Issues de GitHub.

Funcionamiento

Básicamente, a través de Notebooks de Jupyter y un poco de Markdown. Python, por contraparte, genera los CSV, y Jupyter Books se encarga de generar la página web a partir de los Notebooks y el Markdown.

El despliegue del libro en gh-pages se realiza cada vez que:

  • Desencadeno un cambio en main

  • Periódicamente desde las 11:30 hrs. a las 19:30 hrs. (hora de Santiago de Chile).

A través del action actualiza_libro.

Estado

deploy-book

DOI

DOI

Archivos CSV generados

Disponibles en el siguiente enlace, los cuales se adjuntan a continuación:



"NUMERALAB.CSV"

Tiene las siguientes columnas (156 sin el índice):

- Fecha con 1475 datos válidos.

- Casos confirmados acumulados con 1186 datos válidos.

- Casos recuperados acumulados con 1151 datos válidos.

- Casos fallecidos acumulados con 1167 datos válidos.

- Casos activos confirmados con 1166 datos válidos.

- Casos activos probables con 1076 datos válidos.

- Casos nuevos con 1186 datos válidos.

- Casos nuevos con sintomas con 1186 datos válidos.

- Casos nuevos sin sintomas con 1129 datos válidos.

- Casos nuevos por laboratorio con 1079 datos válidos.

- Casos nuevos por antigeno con 827 datos válidos.

- Casos con sospecha de reinfeccion con 827 datos válidos.

- Casos recuperados nuevos con 1150 datos válidos.

- Casos fallecidos nuevos con 1166 datos válidos.

- Antigenos informados nuevos con 727 datos válidos.

- Antigenos informados acumulados con 727 datos válidos.

- PCR informados nuevos con 1141 datos válidos.

- PCR informados acumulados con 1141 datos válidos.

- Cupos en residencias con 1098 datos válidos.

- Usuarios en residencias con 1098 datos válidos.

- Numero de residencias con 1098 datos válidos.

- UCI habilitadas con 981 datos válidos.

- UCI ocupadas por confirmados con 1157 datos válidos.

- UCI ocupadas por no confirmados con 981 datos válidos.

- UCI ocupacion media movil real con 975 datos válidos.

- Re regional con 1114 datos válidos.

- Re Iquique con 1109 datos válidos.

- Re Tamarugal con 1109 datos válidos.

- Positividad diaria con 1141 datos válidos.

- Vacunados acumulados 1° dosis con 777 datos válidos.

- Vacunados acumulados 2° dosis con 777 datos válidos.

- Vacunados acumulados unica dosis con 777 datos válidos.

- Vacunados acumulados dosis de refuerzo con 777 datos válidos.

- Vacunados acumulados 4° dosis con 777 datos válidos.

- Casos acumulados en Alto Hospicio con 289 datos válidos.

- Casos acumulados en Camiña con 289 datos válidos.

- Casos acumulados en Colchane con 289 datos válidos.

- Casos acumulados en Huara con 289 datos válidos.

- Casos acumulados en Iquique con 289 datos válidos.

- Casos acumulados en Pica con 289 datos válidos.

- Casos acumulados en Pozo Almonte con 289 datos válidos.

- Casos acumulados en Comuna desconocida con 263 datos válidos.

- Casos activos en Alto Hospicio con 283 datos válidos.

- Casos activos en Camiña con 283 datos válidos.

- Casos activos en Colchane con 283 datos válidos.

- Casos activos en Huara con 283 datos válidos.

- Casos activos en Iquique con 283 datos válidos.

- Casos activos en Pica con 283 datos válidos.

- Casos activos en Pozo Almonte con 283 datos válidos.

- Casos activos en Comuna desconocida con 263 datos válidos.

- Paso a Paso Alto Hospicio con 625 datos válidos.

- Paso a Paso Camiña con 625 datos válidos.

- Paso a Paso Colchane con 625 datos válidos.

- Paso a Paso Huara con 625 datos válidos.

- Paso a Paso Iquique con 625 datos válidos.

- Paso a Paso Pica con 625 datos válidos.

- Paso a Paso Pozo Almonte con 625 datos válidos.

- Paso a Paso (dias) Alto Hospicio con 833 datos válidos.

- Paso a Paso (dias) Camiña con 833 datos válidos.

- Paso a Paso (dias) Colchane con 833 datos válidos.

- Paso a Paso (dias) Huara con 833 datos válidos.

- Paso a Paso (dias) Iquique con 833 datos válidos.

- Paso a Paso (dias) Pica con 833 datos válidos.

- Paso a Paso (dias) Pozo Almonte con 833 datos válidos.

- Movilidad Iquique con 843 datos válidos.

- Movilidad Pica con 843 datos válidos.

- Movilidad Alto Hospicio con 843 datos válidos.

- Movilidad Pozo almonte con 843 datos válidos.

- Movilidad Huara con 843 datos válidos.

- Notificacion PCR Alto Hospicio con 765 datos válidos.

- Notificacion PCR Camiña con 765 datos válidos.

- Notificacion PCR Colchane con 765 datos válidos.

- Notificacion PCR Huara con 758 datos válidos.

- Notificacion PCR Iquique con 765 datos válidos.

- Notificacion PCR Pica con 765 datos válidos.

- Notificacion PCR Pozo Almonte con 765 datos válidos.

- BAC Alto Hospicio con 765 datos válidos.

- BAC Camiña con 765 datos válidos.

- BAC Colchane con 765 datos válidos.

- BAC Huara con 758 datos válidos.

- BAC Iquique con 765 datos válidos.

- BAC Pica con 765 datos válidos.

- BAC Pozo Almonte con 765 datos válidos.

- Positividad Alto Hospicio con 765 datos válidos.

- Positividad Camiña con 765 datos válidos.

- Positividad Colchane con 765 datos válidos.

- Positividad Huara con 758 datos válidos.

- Positividad Iquique con 765 datos válidos.

- Positividad Pica con 765 datos válidos.

- Positividad Pozo Almonte con 765 datos válidos.

- Cobertura de testeo Alto Hospicio con 765 datos válidos.

- Cobertura de testeo Camiña con 765 datos válidos.

- Cobertura de testeo Colchane con 765 datos válidos.

- Cobertura de testeo Huara con 758 datos válidos.

- Cobertura de testeo Iquique con 765 datos válidos.

- Cobertura de testeo Pica con 765 datos válidos.

- Cobertura de testeo Pozo Almonte con 765 datos válidos.

- Oportunidad en notificacion Alto Hospicio con 765 datos válidos.

- Oportunidad en notificacion Camiña con 765 datos válidos.

- Oportunidad en notificacion Colchane con 765 datos válidos.

- Oportunidad en notificacion Huara con 758 datos válidos.

- Oportunidad en notificacion Iquique con 765 datos válidos.

- Oportunidad en notificacion Pica con 765 datos válidos.

- Oportunidad en notificacion Pozo Almonte con 765 datos válidos.

- Fallecidos Alto Hospicio con 0 datos válidos.

- Fallecidos Camiña con 0 datos válidos.

- Fallecidos Colchane con 0 datos válidos.

- Fallecidos Huara con 0 datos válidos.

- Fallecidos Iquique con 0 datos válidos.

- Fallecidos Pica con 0 datos válidos.

- Fallecidos Pozo Almonte con 0 datos válidos.

- Fallecidos Comuna desconocida con 0 datos válidos.

- Fallecidos total comunal con 0 datos válidos.

- Fallecidos confirmados DEIS Alto Hospicio con 855 datos válidos.

- Fallecidos confirmados DEIS Camiña con 855 datos válidos.

- Fallecidos confirmados DEIS Colchane con 855 datos válidos.

- Fallecidos confirmados DEIS Huara con 855 datos válidos.

- Fallecidos confirmados DEIS Iquique con 855 datos válidos.

- Fallecidos confirmados DEIS Pica con 855 datos válidos.

- Fallecidos confirmados DEIS Pozo Almonte con 855 datos válidos.

- Fallecidos probables DEIS Alto Hospicio con 855 datos válidos.

- Fallecidos probables DEIS Camiña con 855 datos válidos.

- Fallecidos probables DEIS Colchane con 855 datos válidos.

- Fallecidos probables DEIS Huara con 855 datos válidos.

- Fallecidos probables DEIS Iquique con 855 datos válidos.

- Fallecidos probables DEIS Pica con 855 datos válidos.

- Fallecidos probables DEIS Pozo Almonte con 855 datos válidos.

- Incidencia regional estimada con 1090 datos válidos.

- Incidencia Iquique estimada con 1085 datos válidos.

- Incidencia Tamarugal estimada con 1085 datos válidos.

- Tasa de casos nuevos Iquique estimada con 1079 datos válidos.

- Tasa de casos nuevos Tamarugal estimada con 1079 datos válidos.

- Incidencia acumulada Alto Hospicio con 289 datos válidos.

- Incidencia acumulada Camina con 289 datos válidos.

- Incidencia acumulada Colchane con 289 datos válidos.

- Incidencia acumulada Huara con 289 datos válidos.

- Incidencia acumulada Iquique con 289 datos válidos.

- Incidencia acumulada Pica con 289 datos válidos.

- Incidencia acumulada Pozo Almonte con 289 datos válidos.

- Incidencia acumulada regional con 289 datos válidos.

- Positividad media movil * con 1123 datos válidos.

- Mortalidad especifica * con 1167 datos válidos.

- Crecimiento semanal * con 1166 datos válidos.

- Crecimiento diario * con 1165 datos válidos.

- UCI ocupacion media movil aprox * con 1138 datos válidos.

- UCI error abs * con 975 datos válidos.

- Tasa casos nuevos * con 1180 datos válidos.

- Positividad antigeno * con 727 datos válidos.

- Positividad antigeno media movil * con 721 datos válidos.

- Mortalidad especifica comunal Alto Hospicio * con 855 datos válidos.

- Mortalidad especifica comunal Camiña * con 855 datos válidos.

- Mortalidad especifica comunal Colchane * con 855 datos válidos.

- Mortalidad especifica comunal Huara * con 855 datos válidos.

- Mortalidad especifica comunal Iquique * con 855 datos válidos.

- Mortalidad especifica comunal Pica * con 855 datos válidos.

- Mortalidad especifica comunal Pozo Almonte * con 855 datos válidos.

- Tasa de activos (incidencia) * con 1166 datos válidos.




"DATA1.CSV"

Tiene las siguientes columnas (3 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Casos nuevos históricos con 1049 datos válidos.

- Recuperados nuevos históricos con 1013 datos válidos.

- Fallecidos nuevos históricos con 1029 datos válidos.




"DATA2.CSV"

Tiene las siguientes columnas (2 sin el índice):

- Fecha con 940 datos válidos.

- Casos activos confirmados con 939 datos válidos.

- Casos activos probables con 939 datos válidos.




"DATA3.CSV"

Tiene las siguientes columnas (4 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Casos confirmados acumulados con 1049 datos válidos.

- Casos recuperados acumulados con 1014 datos válidos.

- Casos activos confirmados con 1029 datos válidos.

- Casos fallecidos acumulados con 1030 datos válidos.




"DATA4.CSV"

Tiene las siguientes columnas (3 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Media móvil semanal de casos nuevos con 1043 datos válidos.

- Media móvil semanal de recuperados nuevos con 1007 datos válidos.

- Media móvil semanal de fallecidos nuevos con 1023 datos válidos.




"DATA5.CSV"

Tiene las siguientes columnas (2 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Positividad diaria con 1004 datos válidos.

- Positividad media movil * con 986 datos válidos.




"DATA6.CSV"

Tiene las siguientes columnas (3 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Re regional con 1023 datos válidos.

- Re Iquique con 1018 datos válidos.

- Re Tamarugal con 1018 datos válidos.




"DATA7.CSV"

Tiene las siguientes columnas (8 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Incidencia acumulada Alto Hospicio con 290 datos válidos.

- Incidencia acumulada Camina con 290 datos válidos.

- Incidencia acumulada Colchane con 290 datos válidos.

- Incidencia acumulada Huara con 290 datos válidos.

- Incidencia acumulada Iquique con 290 datos válidos.

- Incidencia acumulada Pica con 290 datos válidos.

- Incidencia acumulada Pozo Almonte con 290 datos válidos.

- Incidencia acumulada regional con 290 datos válidos.




"DATA8.CSV"

Tiene las siguientes columnas (3 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Incidencia regional estimada con 999 datos válidos.

- Incidencia Iquique estimada con 994 datos válidos.

- Incidencia Tamarugal estimada con 994 datos válidos.




"DATA9.CSV"

Tiene las siguientes columnas (2 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Tasa de casos nuevos Iquique estimada con 988 datos válidos.

- Tasa de casos nuevos Tamarugal estimada con 988 datos válidos.




"DATA10.CSV"

Tiene las siguientes columnas (2 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Crecimiento diario * con 1028 datos válidos.

- Crecimiento semanal * con 1029 datos válidos.




"DATA11.CSV"

Tiene las siguientes columnas (8 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Casos acumulados en Alto Hospicio con 290 datos válidos.

- Casos acumulados en Camiña con 290 datos válidos.

- Casos acumulados en Colchane con 290 datos válidos.

- Casos acumulados en Huara con 290 datos válidos.

- Casos acumulados en Iquique con 290 datos válidos.

- Casos acumulados en Pica con 290 datos válidos.

- Casos acumulados en Pozo Almonte con 290 datos válidos.

- Casos acumulados en Comuna desconocida con 264 datos válidos.




"DATA12.CSV"

Tiene las siguientes columnas (7 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Positividad Alto Hospicio con 765 datos válidos.

- Positividad Camiña con 765 datos válidos.

- Positividad Colchane con 765 datos válidos.

- Positividad Huara con 758 datos válidos.

- Positividad Iquique con 765 datos válidos.

- Positividad Pica con 765 datos válidos.

- Positividad Pozo Almonte con 765 datos válidos.




"DATA13.CSV"

Tiene las siguientes columnas (9 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Casos activos en Alto Hospicio con 284 datos válidos.

- Casos activos en Camiña con 284 datos válidos.

- Casos activos en Colchane con 284 datos válidos.

- Casos activos en Huara con 284 datos válidos.

- Casos activos en Iquique con 284 datos válidos.

- Casos activos en Pica con 284 datos válidos.

- Casos activos en Pozo Almonte con 284 datos válidos.

- Casos activos en Comuna desconocida con 264 datos válidos.

- Tasa de activos (incidencia) * con 1029 datos válidos.




"DATA14.CSV"

Tiene las siguientes columnas (9 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Fallecidos Alto Hospicio con 942 datos válidos.

- Fallecidos Camiña con 942 datos válidos.

- Fallecidos Colchane con 942 datos válidos.

- Fallecidos Huara con 942 datos válidos.

- Fallecidos Iquique con 942 datos válidos.

- Fallecidos Pica con 942 datos válidos.

- Fallecidos Pozo Almonte con 942 datos válidos.

- Fallecidos Comuna desconocida con 935 datos válidos.

- Fallecidos total comunal con 942 datos válidos.




"DATA15.CSV"

Tiene las siguientes columnas (7 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Fallecidos confirmados DEIS Alto Hospicio con 855 datos válidos.

- Fallecidos confirmados DEIS Camiña con 855 datos válidos.

- Fallecidos confirmados DEIS Colchane con 855 datos válidos.

- Fallecidos confirmados DEIS Huara con 855 datos válidos.

- Fallecidos confirmados DEIS Iquique con 855 datos válidos.

- Fallecidos confirmados DEIS Pica con 855 datos válidos.

- Fallecidos confirmados DEIS Pozo Almonte con 855 datos válidos.




"DATA16.CSV"

Tiene las siguientes columnas (7 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Fallecidos probables DEIS Alto Hospicio con 855 datos válidos.

- Fallecidos probables DEIS Camiña con 855 datos válidos.

- Fallecidos probables DEIS Colchane con 855 datos válidos.

- Fallecidos probables DEIS Huara con 855 datos válidos.

- Fallecidos probables DEIS Iquique con 855 datos válidos.

- Fallecidos probables DEIS Pica con 855 datos válidos.

- Fallecidos probables DEIS Pozo Almonte con 855 datos válidos.




"DATA17.CSV"

Tiene las siguientes columnas (2 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Media móvil real de ocupación UCI con 975 datos válidos.

- Media móvil hipotética de ocupación UCI con 1001 datos válidos.




"DATA18.CSV"

Tiene las siguientes columnas (2 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Cupos en residencias con 961 datos válidos.

- Usuarios en residencias con 961 datos válidos.




"DATA19.CSV"

Tiene las siguientes columnas (2 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- PCR informados nuevos con 1004 datos válidos.

- Media móvil semanal de PCR informados nuevos con 997 datos válidos.




"DATA20.CSV"

Tiene las siguientes columnas (2 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Antígenos informados nuevos con 590 datos válidos.

- Media móvil semanal de antígenos informados nuevos con 584 datos válidos.




"DATA21.CSV"

Tiene las siguientes columnas (4 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Casos nuevos con síntomas con 1049 datos válidos.

- Casos nuevos sin síntomas con 992 datos válidos.

- Casos nuevos por laboratorio con 942 datos válidos.

- Casos nuevos por antígeno con 690 datos válidos.




"DATA22.CSV"

Tiene las siguientes columnas (1 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Casos con sospecha de reinfección con 690 datos válidos.




"DATA23.CSV"

Tiene las siguientes columnas (1 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Tasa de casos nuevos de casos nuevos por cien mil habitantes con 1043 datos válidos.




"DATA24.CSV"

Tiene las siguientes columnas (1 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Tasa de activos (incidencia) con 1029 datos válidos.




"DATA25.CSV"

Tiene las siguientes columnas (1 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Mortalidad específica por cien mil habitantes con 1030 datos válidos.




"DATA26.CSV"

Tiene las siguientes columnas (7 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Mortalidad especifica comunal Alto Hospicio * con 855 datos válidos.

- Mortalidad especifica comunal Camiña * con 855 datos válidos.

- Mortalidad especifica comunal Colchane * con 855 datos válidos.

- Mortalidad especifica comunal Huara * con 855 datos válidos.

- Mortalidad especifica comunal Iquique * con 855 datos válidos.

- Mortalidad especifica comunal Pica * con 855 datos válidos.

- Mortalidad especifica comunal Pozo Almonte * con 855 datos válidos.




"DATA27.CSV"

Tiene las siguientes columnas (5 sin el índice):

- Fecha con 1050 datos válidos.

- Vacunados acumulados 1° dosis con 746 datos válidos.

- Vacunados acumulados 2° dosis con 746 datos válidos.

- Vacunados acumulados unica dosis con 746 datos válidos.

- Vacunados acumulados dosis de refuerzo con 746 datos válidos.

- Vacunados acumulados 4° dosis con 746 datos válidos.