水(TIP3P)の分子動力学プログラム(NVE/NVT) 3 次元ベクトル計算に http://cms.phys.s.u-tokyo.ac.jp/~naoki/CIPINTRO/CIP/SRC/vector3.h を使用します(注: abs を vabs に変えて下さい)。 解説記事を Qiita に書きましたのでご一緒にどうぞ: 水(TIP3P)の古典 MD プログラム part 1 水(TIP3P)の古典 MD プログラム part 2 水(TIP3P)の古典 MD プログラム part 3