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通过配置文件实现一条命令完成常见DNA线的生信分析

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pzweuj/DNApipeline

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DNApipeline

基本用法

python3 DNA.py -i <yaml>

更新

20210530 snakemake与WDL版本用于内部生产环境,不公开

20210517 着手用WDL重写

20210510 着手用snakemake重写

20210428 基本完成,着手写文档,另外或者打包成docker?或者用WDL重写?

20210415 注释模式固定为先用snpEff再用annovar,不再可选。更新中。脚本目前保留hg38的使用接口,但是鉴于hg38在很长一段时间都不会成为国内主流,因此暂停hg38部分的更新。

20210402 配对样本模式开始动工。

20210326 完整流程已跑通。

20210222 先搞一条线。

20210220 破土动工,开工大吉!

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