Uma vez instalado, é muito fácil usar o Artisan Obfuscator. Acessando o terminal e estando na raiz do projeto Laravel, basta usar o artisan com o seguinte comando:
$ php artisan obfuscate:app
Ao executar o comando acima o diretório app do Laravel será ofuscado e os arquivos originais serão copiados para um diretório chamado app_backup, para que possa ser armazenado em outro lugar, não sendo necessário enviá-lo para o sistema em produção.