Skip to content
This repository has been archived by the owner on May 10, 2022. It is now read-only.

Commit

Permalink
updated readme, fixed missing alt tag in rofooter image, fixes #41
Browse files Browse the repository at this point in the history
  • Loading branch information
@sckott
sckott committed Jan 6, 2015
1 parent 9137549 commit 1535c43
Show file tree
Hide file tree
Showing 5 changed files with 52 additions and 69 deletions.
4 changes: 2 additions & 2 deletions README.Rmd
View file
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -174,7 +174,7 @@ plot_density(input = alm, source = c("counter_total", "crossref_total",

Crossref

```{r}
```{r eval=FALSE}
crurl <- "http://alm.labs.crossref.org/api/v5/articles"
crkey <- getOption("crossrefalmkey")
alm_ids(doi='10.1371/journal.pone.0086859', url = crurl, key = crkey)
Expand Down Expand Up @@ -202,4 +202,4 @@ alm_ids(doi='10.3897/zookeys.88.807', url = psurl, key = pskey)
* License: MIT
* Get citation information for `alm` in R doing `citation(package = 'alm')`

[![](http://ropensci.org/public_images/github_footer.png)](http://ropensci.org)
[![rofooter](http://ropensci.org/public_images/github_footer.png)](http://ropensci.org)
117 changes: 50 additions & 67 deletions README.md
View file
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -91,22 +91,22 @@ alm_ids(doi = "10.1371/journal.pone.0029797")
## $data
## .id pdf html readers comments likes total
## 1 citeulike NA NA 1 NA NA 1
## 2 crossref NA NA NA NA NA 8
## 2 crossref NA NA NA NA NA 7
## 3 nature NA NA NA NA NA 4
## 4 pubmed NA NA NA NA NA 2
## 5 scopus NA NA NA NA NA 8
## 6 counter 2524 30801 NA NA NA 33443
## 5 scopus NA NA NA NA NA 9
## 6 counter 2550 31308 NA NA NA 33980
## 7 researchblogging NA NA NA NA NA 1
## 8 wos NA NA NA NA NA 7
## 9 pmc 78 534 NA NA NA 612
## 10 facebook NA NA 149 22 60 231
## 10 facebook NA NA 150 22 60 232
## 11 mendeley NA NA 80 NA NA 80
## 12 twitter NA NA NA 12 NA 12
## 13 wikipedia NA NA NA NA NA 50
## 13 wikipedia NA NA NA NA NA 49
## 14 scienceseeker NA NA NA NA NA 0
## 15 relativemetric NA NA NA NA NA 157436
## 16 f1000 NA NA NA NA NA 0
## 17 figshare 0 21 NA NA 0 21
## 17 figshare 0 25 NA NA 0 25
## 18 pmceurope NA NA NA NA NA 4
## 19 pmceuropedata NA NA NA NA NA 49
## 20 openedition NA NA NA NA NA 0
Expand All @@ -117,6 +117,7 @@ alm_ids(doi = "10.1371/journal.pone.0029797")
## 25 articlecoverage NA NA NA 0 NA 0
## 26 articlecoveragecurated NA NA NA 0 NA 0
## 27 plos_comments NA NA NA 11 NA 16
## 28 orcid NA NA 0 NA NA 0
```

### Details for a single DOI
Expand All @@ -134,40 +135,42 @@ alm_ids(doi = "10.1371/journal.pone.0029797", info = "detail")
##
## $data
## $data$info
## doi
## 1 10.1371/journal.pone.0029797
## id
## 1 doi/10.1371/journal.pone.0029797
## title
## 1 Ecological Guild Evolution and the Discovery of the World's Smallest Vertebrate
## canonical_url
## 1 http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0029797
## pmid pmcid mendeley_uuid
## 1 22253785 3256195 897fbbd6-5a23-3552-8077-97251b82c1e1
## update_date issued
## 1 2014-11-12T21:41:48Z 2012-01-11
## publisher_id doi
## 1 340 10.1371/journal.pone.0029797
## canonical_url
## 1 http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0029797
## pmid pmcid scp wos update_date
## 1 22253785 3256195 84855712734 000301355700052 2015-01-06T19:10:32Z
## issued
## 1 2012-01-11
##
## $data$signposts
## doi viewed saved discussed cited
## 1 10.1371/journal.pone.0029797 34055 81 243 8
## 1 10.1371/journal.pone.0029797 34592 81 244 9
##
## $data$totals
## .id pdf html readers comments likes total
## 1 citeulike NA NA 1 NA NA 1
## 2 crossref NA NA NA NA NA 8
## 2 crossref NA NA NA NA NA 7
## 3 nature NA NA NA NA NA 4
## 4 pubmed NA NA NA NA NA 2
## 5 scopus NA NA NA NA NA 8
## 6 counter 2524 30801 NA NA NA 33443
## 5 scopus NA NA NA NA NA 9
## 6 counter 2550 31308 NA NA NA 33980
## 7 researchblogging NA NA NA NA NA 1
## 8 wos NA NA NA NA NA 7
## 9 pmc 78 534 NA NA NA 612
## 10 facebook NA NA 149 22 60 231
## 10 facebook NA NA 150 22 60 232
## 11 mendeley NA NA 80 NA NA 80
## 12 twitter NA NA NA 12 NA 12
## 13 wikipedia NA NA NA NA NA 50
## 13 wikipedia NA NA NA NA NA 49
## 14 scienceseeker NA NA NA NA NA 0
## 15 relativemetric NA NA NA NA NA 157436
## 16 f1000 NA NA NA NA NA 0
## 17 figshare 0 21 NA NA 0 21
## 17 figshare 0 25 NA NA 0 25
## 18 pmceurope NA NA NA NA NA 4
## 19 pmceuropedata NA NA NA NA NA 49
## 20 openedition NA NA NA NA NA 0
Expand All @@ -178,6 +181,7 @@ alm_ids(doi = "10.1371/journal.pone.0029797", info = "detail")
## 25 articlecoverage NA NA NA 0 NA 0
## 26 articlecoveragecurated NA NA NA 0 NA 0
## 27 plos_comments NA NA NA 11 NA 16
## 28 orcid NA NA 0 NA NA 0
##
## $data$sum_metrics
## .id year month day total X[[1L]]
Expand Down Expand Up @@ -268,7 +272,7 @@ names(out) # names of sources
## [7] "researchblogging" "pmc" "facebook"
## [10] "mendeley" "twitter" "wikipedia"
## [13] "relativemetric" "figshare" "pmceuropedata"
## [16] "plos_comments"
## [16] "plos_comments" "orcid"
```


Expand Down Expand Up @@ -435,27 +439,6 @@ crkey <- getOption("crossrefalmkey")
alm_ids(doi='10.1371/journal.pone.0086859', url = crurl, key = crkey)
```

```
## $meta
## total total_pages page error
## 1 1 1 1 NA
##
## $data
## .id pdf html readers comments likes total
## 1 crossref NA NA NA NA NA 0
## 2 mendeley NA NA NA NA NA 0
## 3 facebook NA NA NA NA NA 0
## 4 pmc NA NA NA NA NA 0
## 5 citeulike NA NA NA NA NA 0
## 6 pubmed NA NA NA NA NA 0
## 7 wordpress NA NA NA NA NA 0
## 8 reddit NA NA NA NA NA 0
## 9 wikipedia NA NA NA NA NA 2
## 10 datacite NA NA NA NA NA 0
## 11 pmceurope NA NA NA NA NA 0
## 12 pmceuropedata NA NA NA NA NA 0
```

eLife


Expand All @@ -472,19 +455,19 @@ alm_ids(doi='10.7554/eLife.00471', url = elifeurl, key = elifekey)
##
## $data
## .id pdf html shares groups comments likes citations total
## 1 pmc 337 884 NA NA NA NA NA 1221
## 2 crossref NA NA NA NA NA NA 139 139
## 3 scopus NA NA NA NA NA NA 138 138
## 1 pmc 485 1109 NA NA NA NA NA 1594
## 2 crossref NA NA NA NA NA NA 154 154
## 3 scopus NA NA NA NA NA NA 149 149
## 4 facebook NA NA 3 NA 0 0 NA 3
## 5 mendeley NA NA 454 0 NA NA NA 454
## 6 twitter_search NA NA NA NA 0 NA NA 0
## 7 citeulike NA NA 1 NA NA NA NA 1
## 8 pubmed NA NA NA NA NA NA 80 80
## 8 pubmed NA NA NA NA NA NA 96 96
## 9 wordpress NA NA NA NA NA NA 0 0
## 10 reddit NA NA NA NA 0 0 NA 0
## 11 wikipedia NA NA NA NA NA NA 0 0
## 11 wikipedia NA NA NA NA NA NA 1 1
## 12 datacite NA NA NA NA NA NA 0 0
## 13 pmceurope NA NA NA NA NA NA 135 135
## 13 pmceurope NA NA NA NA NA NA 144 144
## 14 pmceuropedata NA NA NA NA NA NA 1 1
## 15 scienceseeker NA NA NA NA NA NA 0 0
## 16 nature NA NA NA NA NA NA 0 0
Expand Down Expand Up @@ -515,23 +498,23 @@ alm_ids(doi='10.3897/zookeys.88.807', url = psurl, key = pskey)
## $data
## .id pdf html readers comments likes total
## 1 facebook NA NA NA NA NA 0
## 2 copernicus 0 0 NA NA NA 0
## 3 wikipedia NA NA NA NA NA 136
## 4 nature NA NA NA NA NA 0
## 5 citeulike NA NA 1 NA NA 1
## 6 crossref NA NA NA NA NA 81
## 7 datacite NA NA NA NA NA 0
## 8 pmceuropedata NA NA NA NA NA 0
## 9 pubmed NA NA NA NA NA 51
## 10 f1000 NA NA NA NA NA 0
## 11 scopus NA NA NA NA NA 176
## 12 figshare NA NA NA NA NA 0
## 13 counter NA NA NA NA NA 0
## 14 mendeley NA NA 123 NA NA 123
## 15 reddit NA NA NA 0 0 0
## 16 twitter_search NA NA NA 0 NA 0
## 17 wordpress NA NA NA NA NA 0
## 18 pmceurope NA NA NA NA NA 52
## 2 citeulike NA NA 1 NA NA 1
## 3 mendeley NA NA 123 NA NA 123
## 4 wikipedia NA NA NA NA NA 136
## 5 datacite NA NA NA NA NA 0
## 6 copernicus 0 0 NA NA NA 0
## 7 nature NA NA NA NA NA 0
## 8 f1000 NA NA NA NA NA 0
## 9 pmceuropedata NA NA NA NA NA 0
## 10 figshare NA NA NA NA NA 0
## 11 counter NA NA NA NA NA 0
## 12 crossref NA NA NA NA NA 81
## 13 reddit NA NA NA 0 0 0
## 14 twitter_search NA NA NA 0 NA 0
## 15 wordpress NA NA NA NA NA 0
## 16 scopus NA NA NA NA NA 176
## 17 pmceurope NA NA NA NA NA 52
## 18 pubmed NA NA NA NA NA 51
```

## Meta
Expand All @@ -540,4 +523,4 @@ alm_ids(doi='10.3897/zookeys.88.807', url = psurl, key = pskey)
* License: MIT
* Get citation information for `alm` in R doing `citation(package = 'alm')`

[![](http://ropensci.org/public_images/github_footer.png)](http://ropensci.org)
[![rofooter](http://ropensci.org/public_images/github_footer.png)](http://ropensci.org)
Binary file modified inst/assets/img/unnamed-chunk-11-1.png
View file
Loading
Sorry, something went wrong. Reload?
Sorry, we cannot display this file.
Sorry, this file is invalid so it cannot be displayed.
Binary file modified inst/assets/img/unnamed-chunk-15-1.png
View file
Loading
Sorry, something went wrong. Reload?
Sorry, we cannot display this file.
Sorry, this file is invalid so it cannot be displayed.
Binary file modified inst/assets/img/unnamed-chunk-16-1.png
View file
Loading
Sorry, something went wrong. Reload?
Sorry, we cannot display this file.
Sorry, this file is invalid so it cannot be displayed.

0 comments on commit 1535c43

Please sign in to comment.