Vegetationsaufnahmen vom Info Flora Online-Feldbuch exportieren und in R oder VEGEDAZ importieren

Inhalt

• 1. Exportieren von Vegetationsaufnahmen aus dem Online-Feldbuch von Info Flora
• 2. Vegetationsdaten vom Info Flora Online-Feldbuch mit R transformieren
• 3. Vegetationsdaten vom Info Flora Online-Feldbuch mit VEGEDAZ transformieren

1. Exportieren von Vegetationsaufnahmen aus dem Online-Feldbuch

1. Login im Info Flora Online-Feldbuch

2. Auf «Beobachtungen» klicken.

3. Im Drop-Down Menü von Maske: «Vegetationsaufnahmen» wählen.
   

   

   
   

4. Mit gedrückter Ctrl- oder Shift-Taste Vegetationsaufnahmen, die exportiert werden sollen, markieren.

5. Auf «Export der Aufnahmen» klicken -> Neues Fenster erscheint
   

   

   
   

6. «Export der Vegetationsaufnahmen» anklicken, um die Kopfdaten zu speichern. «Export der Beobachtungen» anklicken, um die Artdaten zu speichern.
   (Hinweis: Die Artdaten können auch über die Maske Standart heruntergeladen werden. Vorteil: Die Beschränkung auf 50 Aufnahmen entfällt. Nachteil: Die Selektion der zu den gewünschten Aufnahmen gehörenden Artdaten mit der Filter-Funktion ist etwas umständlich bzw beschränkt möglich.)

7. Beide exportierten Dateien mit Excel öffnen und als «CSV UTF-8 (durch Trennzeichen-getrennt) (*.csv)» speichern und wieder schliessen. Nun sind die Daten parat zur weiteren Bearbeitung mit R oder VEGEDAZ

2. Vegetationsdaten vom Online-Feldbuch in R importieren

Artdaten vom Info Flora Online-Feldbuch zu Kreuztabelle transformieren

R-Skript das die Artdaten in eine Kreuztabelle transfomiert. Als PlotID wird vom Feldbuch generierte "releve_id" verwendet.

Vegetationsdaten vom Info Flora Online-Feldbuch transformieren

R Skript das die Kopf-/Umweldaten mit Einträgen aus den Beobachtungen ergänzt und die Artdaten in eine Kreuztabelle transfomiert. Als PlotID wird der in der FlorApp erfasste "Name der Vegetationsaufnahme" verwendet

3. Vegetationsdaten vom Online-Feldbuch in VEGEDAZ importieren

Artdaten importieren

1. VEGEDAZ öffnen. Datei - Import --> oder

2. Im neuen Fenster (siehe unten) Beobachtungen einzeln auswählen. Artdaten (obs_releve_export.csv) aus Zwischenanblage importieren (Trennzeichen TAB (Tabulator-Zeichen)
   oder
   Artdaten als Datei importieren (Trennzeichen SEM (Semikolon) - Ok - Datei auswählen
   

   

   
   

3. Im neuen Fenster (siehe unten):

   • erwünschte Kopfdaten: "releve_id", weitere nach Bedarf z.B "x", "y", "xy_precision", "municipality.name", "altitude_min","altitude_max", "v_co_canton", "v_observers"

   • Artnamen: "taxon.taxon_name" (Artname Checklist 2017 & addenda) oder "taxon_orig" (Taxaname mit cf. vor Gattung oder cf. vor Art oder Taxaname welcher als Freitext erfasst wurde. Wenn der Taxaname von der Dropdown-Liste und als "Sichere Bestimmung" gewählt wurde = Artname Checklist 2017 & addenda ohne Autor)

   • Deckungen: "supplements.cover.abs" (Wenn Deckungen in Prozent geschätzt wurden ansonsten "cover" oder "abundance_code")

   Wenn Schicht erfasst wurde:

   • erwünschte Art-Zusätze: supplements.releve.stratum
   
   

   

   
   

4. File speichern (Ctrl + S)

Kopf-/Umweldaten importieren

5. Kopfdaten (releve_export.csv) öffnen mit Ctrl + A alles markieren (alternativ nur relevante Spalten markieren) mit Ctrl + C alles kopieren

6. VEGEDAZ: Datei - Import --> oder

7. Im neuen Fenster (siehe unten) Transponiert auswählen. Aus Zwischenanblage importieren (Trennzeichen TAB (Tabulator-Zeichen)
   oder
   Daten von Datei importieren (Trennzeichen SEM (Semikolon) - Ok - Datei auswählen
   

   

Kopf-/Umweldaten mit Artdaten verknüpfen

9. Datei - Dateien verknüpfen --> File mit zuvor gespeicherte "Artdaten" auswählen
   Verknüpfen über Schlüsselfelder "id" und "relve_id" wählen Optionen: "Arten aus Datei auch einfügen" anwählen

   

   
   

10. Wenn Schichten Importiert wurden Menü Bearbeiten - Ersetzten um die Schicht Codes vom Feldbuch durch die Schicht-Codes von VEGEDAZ zu ersetzten

Codes Feldbuch: ♃ = Krautschicht; v = Strauchschicht; Y = Baumschicht; ψ = Moosschicht

Codes VEGEDAZ: /K = Krautschicht; /S = Strauchschicht; /B = Baumschicht; / M = Moosschicht