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soerenmetje/HMM

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Hidden Markov Model

Modelliert Emissionswahrscheinlichkeiten von Beobachtungen und Übergangswahrscheinlichkeiten zwischen Zuständen.

Casino-HMM

Ein unehrliches Casino spielt mit fairem und gezinkten Würfel. Anhand einer Wurffolge wird berechnet, wann am wahrscheinlichsten mit welchem Würfel gespielt wurde.

  • Viterbi Algorithmus

Profil-HMM

Training und Klassifikation mittels eines Profil-HMM am Beispiel von rRNA.

  • Viterbi Algorithmus
  • Argument-Parser
  • FASTA-Parser