node.jsで作っていましたが、
- コンパイラではない
- 型指定がいまいち
- ejsが助長
- ORMでない
などのいくつかの理由からやはり記述言語を変えるべきと思われました
候補にあがったのが swiftか goでしたが、ここはgoがdockerと親和性がよさそうだったので試してみました。
- webフレームワークには echo
- ORMには sqlboiler
go開発環境のインストール
brew install go
gomodを使ったので
go build
で必要なモジュールは自動的にダウンロードされるはず..
Sequel Proなどでデータベースを設計
sqlboiler.tomlファイルを作り
[mysql]
dbname = "studydb"
host = "localhost"
port = 3306
user = "oge"
pass = "hogehogeA00"
sslmode = “false"
(mysqlのパスワードが@を含んでいるとsql URLに"@"が含まれていて問題だったのでやむなく変更しました)
データ構造ができたところで、sqlboiler mysqlとすると
データベースの構造を読み込んでmodelsディレクトリ内に go ファイルを作ってくれる
現在の構造のデータ(+sample)を使うときの準備
mysqlにoge, hogehogeA00というユーザを準備する
make import (SQLが読み込まれデータ構造とサンプルデータが入ります)
ディレクトリ構造
├── models
├── routes
├── static
│ ├── css
│ ├── img
│ └── javascript
└── views
実行
go run .
あるいは
make run
サーバが起動している状態で、ブラウザで http://127.0.0.1:3000/ へアクセスしてみてください
- サンプル病院1 : userid test pass test
- サンプル病院2 : userid test2 pass test2
- admin : user admin pass admin （これは hospital_id=1である必要があります)
- logoutするとcookieは消えます
更新
- きちんと試験開始日を入力すると、経過日を計算してくれる
- おおよそ30,60,90日後などに特定の検査を入れたりする場合にわかりやすいか
- admin/adminでログインするとadmin consoleが表示
- [現在の日付でKM曲線を描く] をクリックすると、Rscriptを使ってデータベースから無理矢理Kaplan-Meier グラフを書きます
- /usr/local/bin/Rscriptがあり、DBI/RMySQL/surviveがインストールされていることが前提
- 詳しくはanalysis.Rを見て適宜変更を (現在は死亡イベントを解析)
- 昔ダウンロードしてきた TatsukiRcodeKMplot.r を使用していますが、いまそこにアクセスできないし..
- https://github.com/SteveLane/CodeLibrary 内にも TatsukiRcodeKMplot.r はありますね
- 非同期計算にしました
- Docker対応にした
- 作成：docker-compose build
- 起動：docker-compose up -d
- 終了：docker-compose down
注意
- cookieのsecret keyがハードコードされているので変更を。
- VSCodeのlintはかなーり強力だが、html templateの中の typo までは指摘してくれず真っ白画面になる html comment {{/* */}} なんぞを使って切り分けしていくしかない go template lintは思ってたのとは違う