глава 1:

Связь, валидность, интерпретируемость коннектомики по анатомии их взаимно заменяемость/дополняемость:

1. Исследование их взаимосвязи и понимание сколько информации несет каждая?

   • Canonical correlation

   • regularized regression (Total Variation + L1 for example) predicting individual graph edges with vertex-level predictor variables

2. Какие можно дальше задачи решать с помощью их связи?

   • Knowing anatomy-connectivity relationships, we can make formal brain connection/functional alteration interpretations from anatomical associations with biological variables (of which there is a lot more than connectivity associations published). This could be done both as a review of existing literature, and as tool for new (e.g. the big ENIGMA) studies. Kind of my (BG’s) big goal with this project.

Данные:

Обычные коннектомы 68 вершин Десикан: - 789 человек с толщинами, площадями и лог якобианами

Выборка HCP на которой просчитаны непрерывные коннектомы, на каждого человека 20к x 20к (~40) вершин, всего ~1000 человек.

recon all:

-повоксельные лейблы роев (кортикальные+субкортикальные)

-регистрация в общее пространство (матрица 4x4 пространство MNI)

-геометрические модели кортикальных поверхностей белого и серого вещества

-толщина площадь и элемент объема для каждой точки сетки

• csd - constrains spherical deconvolutions