make ctgB in test data be a little over 6kb, add some features to it

GMOD · Sep 13, 2012 · c4d15bb · c4d15bb
1 parent 77d1959
commit c4d15bb
Show file tree

Hide file tree

Showing 2 changed files with 67 additions and 1 deletion.
diff --git a/docs/tutorial/data_files/volvox.fa b/docs/tutorial/data_files/volvox.fa
@@ -835,4 +835,63 @@ tagttgtacctgggtatgttagtgaaattacaagtacctcaaaaacgaattacgtgtata
 gagattatgtcactccgtcac
 >ctgB
 ACTGATCGATGATGACTGACTAGTAGA
-ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGC
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
+ACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGATACATGCTAGCTACGTGCATGCTCGACATGCATCATCAGCCTGATGCTGAT
diff --git a/docs/tutorial/data_files/volvox.gff3 b/docs/tutorial/data_files/volvox.gff3
@@ -256,3 +256,10 @@ ctgA	est	match_part	5000	5500	.	+	.	Parent=Match5;Name=agt767.5;Target=agt767.5
 ctgA	est	match_part	7000	7200	.	+	.	Parent=Match5;Name=agt767.5;Target=agt767.5 853 1153
 
 ctgA	est	EST_match	8000	9000	.	-	.	ID=Match6;Name=agt767.3;Target=agt767.3 1 1001
+
+
+
+ctgB	example	contig	1	50000	.	.	.	Name=ctgA
+ctgB	example	remark	1659	1984	.	+	.	Name=f07;Note=This is an example
+ctgB	example	remark	3014	6130	.	+	.	Name=f06;Note=This is another example
+ctgB	example	remark	4715	5968	.	-	.	Name=f05;Note=ああ、この機能は、世界中を旅しています！