-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
Home
Welcome to the hematopoiesis-on-SAS wiki!
Это должно быть множество модулей, т.е. библиотека макросов для создания полноценной инфрастуктуры
метафайл. Описание данных. Парсер конфига -- не нужен. SAS-macro и так скриптовый язык. Надо на Sm-е же писать модульную систему (фреймворк?)
Каие данные:
количество компартментов ссылка на начальные данные
схема вычислений
Модуля: с одинаковым интерфейсом должны инкапсулировать внутренне содержание. Слой -- основной эелемент инкапсуляции, может содержать подслои и соединяться с другими слоями
Основной класс это стек слоев. В терминологии SAS это???
слои делятся на грид-слои, компартмент слои и ...
В SAS-е нельзя на 100% создать фреймворк.
Хотя можно сделать например переменную границу стохастического слоя.
Итак, нижние коспартменты стохастические, верхние детеминистические. За счет статистической множественности хаотическое поведение превращается в управляющее. Ну как-то так...
- граница
- является ли вероятность событий функцией от управляющего параметра?
- а почему нельзя все компартмент-моделью делать? Ответить для себя на этот вопрос
- Система (непременно с бифуркациями) как фильтр для стохастических импульсов. Может как-то скрестить это со статистической физикой? Но это не долженбыть велосипед!
Вот внезапно обнаружились такие статьи. Читать и думать:
- Compartment Architecture and Dynamics of Hematopoiesis -- Наверное, рассматривается или сравнивается динамика гемопоеза в реальности и что мы теряем при компартмент-подходе. Если нет, то сделать это самому. Кстати, серьезная работа для статьи!
- Dynamics of Mutant Cells in Hierarchial Organized Tissues -- предлагается очередная стохастическая модель. Чем меня это заинтересовало, не понятно, надо смотреть.
- New Computational Tools for Modeling CML -- подробный анализ ХМЛ, компартмент, и что-то про обратные связи и вроде бы и непрерывный тоже.
- A mathematical model with time-varying delays in the combined treatment of CML -- ключевая вещь, это график-описание динамики ХМЛ. ПОсмотреть как они это описывают.
- Stability Analisis of a Simplified Yet Complete Model for CML -- ассимптотическое исследование модели ХМЛ в частных производных. Посмотреть какой. --> Следующей:
- An "age"-Structured Model of Hematopoietic Stem Cell Organization with Application to CML -- что да как надо смотреть уравнения
- Lifespan Differences in Hematopoietic Stem Cells are Due to Imperfect Repair and Unstable Mean-Revision -- поведение клеток в течении жизни. ВАЖНО! В статье рассматривается проблема того, что у стволовых клеток имеется определенная продолжительность жизни (время, которое клетка делится и продуцирует потомков) Базируется на теории надежности (reliability theoery), исследуется интенсивность отказов (failure rate) -- интенсивность выхода клеток. Отслеживание осуществлялось по CD45 маркеру различному для мышей доноров и рецепиентов.
Все гемопоетические клетки характеризуются способностью продуцировать… Основной интерпретацией полученных в статье результатов является то, что продолжительность жизни (lifespan) определяется эпигенетически пре-программируемыми изменениями в способности к репарации.
А значит это управляемая статистически величина! Интересным является рассмотрение порога чувствительности приборов. Т.е. оценочной характеристикой является не динамика, а анализы. Это, кстати, очень важный, и может даже ключевой момент.