Las imagenes de los tres canales deben ser guardadas con una logica de nombres en donde el fluoroforo este al final del nombre del archivo. Por ejemplo:
20X-WT-D0-Foto1-DAPI.tif
20X-WT-D0-Foto1-Oct4-488.tif
20X-WT-D0-Foto1-Nanog-595.tif
Ademas, hay que tener el plugin de Stardist instalado en FIJI
En la carpeta donde estan las fotos, hay que crear una subcarpeta "PNGs" previo a correr el script para que se guarden las fotos pngs, cuyo unico objetivo es la visualizacion posterior, no el analisis.