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biomarble/ngsScripts

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在生物信息分析的实际操作中,经常会遇到一些例如格式转换和信息提取等琐碎的小工作;

  • 有编程基础者,可利用命令组合或一些文本处理工具(awk/sed等)完成;
  • 但对无编程基础者,手工处理耗费时间精力大;

我编写了这些脚本程序,供无编程基础者使用,让用户关注点回归生物学问题

使用方法

  • 下载此链接
  • 解压,并将脚本放到一个统一的目录下(通常为bin),方便调用;
  • 使用perl 文件名的方式,查看脚本的使用帮助信息(例如:perl bin/gff2gtf.pl

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a bundle of scripts for simplifying NGS analysis.

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