Home

Togothon

ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) が2012年10月より毎月開催している技術交流開発会議で、もともとSPARQLthonとして開催していたものを、2022年10月よりTogothonと改称し継続しています。 参加者は、DBCLSで進めている知識グラフによるデータ統合やそのための技術開発に興味のある研究者、NBDCの統合化推進プログラム （DICP)の関係者が多いですが、アカデミック・企業・デザイナーなどなど所属機関や立場を問わず、関心のある方は誰でもご参加頂ける会ですので、ぜひお気軽にお越しください。

年１回開催の国際版 BioHackathonや国内版バイオハッカソンでは、様々な進捗がありますが未完成のプロジェクトが残りがちです。Togothonは月１回定期的に顔を合わせることでこれを補完し、立ちあげたプロジェクトをモチベーションをキープしながら着実に進展させて成果を出すプロトコルとして有効に機能してきていると思います。様々な分野からの参加者同士で交流が進むことにより、これから発展が期待される知識グラフの技術者・研究者層の拡大とコミュニティの醸成にも役立つことを目指しています。

開催予定

場所未定のままの場合は、基本的に DBCLS 柏の葉キャンパス駅前での開催となります。

• 2024-07-18〜19 Togothon142 @ 京都大学東京オフィス (千代田区丸の内)
• 2024-08-19〜20 Togothon143 @ 日本橋ライフサイエンスハブ (日本橋室町)
  • 注意： これまで数回利用している GLOBAL LIFESCIENCE HUB ではありません
• 2024-09-未定 Togothon144

※ 次回以降の開催予定更新時にはGitHub Pagesのソースも書き換えること（SEO対策）

オンラインツール

Slack

Togothon用のSlackで連絡や議論を進めていますので、ぜひご参加ください。最新の招待リンクは次回開催予定のTogothonのページに記載しています。

メーリングリスト

重要なアナウンスなどは国内版バイオハッカソンのメーリングリストで通知することがありますので、興味ある方は各自ご登録頂ければと思います。参加や退会は自由、投稿内容は参加者だけに公開となっています。

統合化推進プログラム

2023年度

2023年度新規採択研究開発課題

• ATTED-II: 非モデル植物のための遺伝子ネットワーク情報活用基盤 (大林)
• Japanese Open Genome Omics Platform: 日本人塩基配列情報の公開可能なゲノム・オミクス情報基盤による双方向型研究教育データベース開発と国際連携 (長崎)
• Spatial Genomics Atlas of Cells and Tissues: 空間オミックスデータ解析用データベースの開発 (Vandenbon)
• jPOST prime: コミュニティ連携を基盤とするプロテオームデータベース環境の実現 (石濱)
• Shin-Mass Bank: 次世代低分子マススペクトルデータベース シン・マスバンクの構築 (松田)

2022年度

2022年度新規採択研究開発課題

• SSBD: バイオイメージングデータのグローバルなデータ共有システムの構築 (大浪)
• シスエレメントDB(仮): 細胞ごとの多様な活性やゲノム変異・多型との関連を探索できるシスエレメント・データベースの開発 (粕川）
• KEGG MEDICUS: ヒトゲノム・病原体ゲノムと疾患・医薬品をつなぐ統合データベース (金久)
• GlyCosmos Portal: 異分野融合を志向した糖鎖科学ポータルのデータ拡充と品質向上 (木下)
• PDBj: 蛋白質構造データバンクのデータ駆動型研究基盤への拡張 (栗栖)
• Microbiome Datahub: マイクロバイオーム研究を先導するハブを目指した微生物統合データベースの特化型開発 (森)

終了

• 物質循環を考慮したメタボロミクス情報基盤 (有田) - http://www.massbank.jp/
• プロテオームデータベースの機能深化と連携基盤強化（石濱）- https://jpostdb.org/
• データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発 (黒川) - http://microbedb.jp/
• 糖鎖科学ポータルの構築 (木下) - https://glycosmos.org/
• 蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化 (栗栖) - http://pdbj.org/
• 個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築 (田畑) - http://pgdbj.jp/
• 疾患ヒトゲノム変異の生物学的機能注釈を目指した多階層オーミクスデータの統合 (菅野) - http://kero.hgc.jp/
• エピゲノミクス統合データベースの開発と機能拡充 (沖) - http://chip-atlas.org/
• ゲノム・疾患・医薬品のネットワークデータベース (金久) - http://www.kegg.jp/kegg/medicus/
• 生命と環境のフェノーム統合データベース (桝屋)
• 生物種メタボロームモデル・データベースの構築 (有田)
• 個別化医療に向けたヒトゲノムバリエーションデータベース (徳永)
• プロテオーム統合データベース：jPOST (石濱) - http://jpostdb.org/
• 生命動態システム科学のデータベースの統合化 (大浪)

開催記録

Togothon

• 2024-06-10〜11 Togothon141 @ GLOBAL LIFESCIENCE HUB　カンファレンスルーム (日本橋室町)
• 2024-05-13〜14 Togothon140 @ 北里大学相模原キャンパス 未来工学部棟
• 2024-04-18〜19 Togothon139 @ GLOBAL LIFESCIENCE HUB　カンファレンスルーム (日本橋室町)
• 2024-03-21〜22 Togothon138 @ GLOBAL LIFESCIENCE HUB　カンファレンスルーム (日本橋室町)
• 2024-02-19〜20 Togothon137 @ 北里大学 白金キャンパス
• 2024-01-25〜26 Togothon136 @ GLOBAL LIFESCIENCE HUB　カンファレンスルーム (日本橋室町)
• 2023-12-21〜22 Togothon135 @ GLOBAL LIFESCIENCE HUB　カンファレンスルーム (日本橋室町)
• 2023-11-20〜21 Togothon134 @ DBCLS(柏)
  • 2023-10-30〜11-03 EU BH23
• 2023-10-19〜20 Togothon133 @ GLOBAL LIFESCIENCE HUB
  • 2023-09-25〜29 BH23.9
• 2023-09-14〜15 Togothon132 @ GLOBAL LIFESCIENCE HUB
• 2023-08-24〜25 Togothon131 @ 早稲田大学
• 2023-07-13〜14 Togothon130 @ 京都大学 東京オフィス
  • 2023-06-25〜07-01 BH23
• 2023-06-15〜16 Togothon129 @ 京都大学 東京オフィス
• 2023-05-25〜26 Togothon128 @ DBCLS (柏)
• 2023-04-20〜21 Togothon127 @ DBCLS (柏)
• 2023-03-23〜24 Togothon126 @ DBCLS (柏)
• 2023-02-21〜22 Togothon125 @ DBCLS (柏)
• 2023-01-19〜20 Togothon124 @ DBCLS (柏)
• 2022-12-22〜23 Togothon123 @ DBCLS (柏)
• 2022-11-24〜25 Togothon122 @ DBCLS (柏)
• 2022-10-20〜21 Togothon121 @ DBCLS (柏)

SPARQLthon

• これまでのSPARQLthon