Skip to content

The edge-preserving JPEG compression artifact removal algorithms implementation. The algorithm is designed to remove the artifacts from H&E stained medical images.

Notifications You must be signed in to change notification settings

julimer228/ArtifactsRemoval

Folders and files

NameName
Last commit message
Last commit date

Latest commit

 

History

42 Commits
 
 
 
 
 
 
 
 

Repository files navigation

ArtifactsRemoval

Repozytorium zawiera pliki będące częścią projektu inżynierskiego realizowanego na Politechnice Śląskiej na kierunku Informatyka.

Autor: Julia Merta

Promotor: Dr Inż. Michał Marczyk

Rok Akademicki: 2022/2023

Temat pracy: Usuwanie artefaktów na obrazach histopatologicznych barwionych H&E.

Wykorzystane środowisko: MATLAB

  • ArtifactsRemoval - tutaj znajdują się pliki programu
  • BreCaHad
    • compressed
    • - folder jest podzielony na podfoldery w których zamieszczono obrazy skompresowane z różnym parametrem jakości kompresji Q w formacie JPEG.
    • images
    • - obrazy w formacie TIFF pochodzące ze zbioru danych BreCaHAD
  • Results
  • - folder z uzyskanymi wynikami
    • ResultsAllMethods - folder zawiera wyniki uzyskane dla rozmycia oraz trzech metod usuwania artefaktów opisanych w pracy.
        • Tables - folder zawierający pliki z wynikami
          • Heatmap - tutaj znadują się foldery z mapami cieplnymi wykonanymi na podstawie średnich wyników każdej z metod
          • Mean - zawiera pliki .csv ze średnimi wynikami każdej z metod
          • Raw - zawiera pliki .csv z danymi dla każdego obrazu
        • ExampleImages - zbiór przykładowych obrazów po usunięciu artefaktów kompresji
      • ResultsCorrelation - folder zawiera wyniki uzyskane dla drugiego algorytmu w celu określenia zależności pomiędzy parametrami filtra Gaussa, a parametrem jakości kompresji, zawiera folder Tables w którym znajdują się pliki wynikowe.
        • Heatmap - tutaj znadują się foldery z mapami cieplnymi wykonanymi na podstawie średnich wyników każdej z metod
        • Mean - zawiera pliki .csv ze średnimi wynikami każdej z metod
        • Raw - zawiera pliki .csv z danymi dla każdego obrazu

About

The edge-preserving JPEG compression artifact removal algorithms implementation. The algorithm is designed to remove the artifacts from H&E stained medical images.

Topics

Resources

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Languages