EasyShermo 是 Kimariyb 开发的一款全自动批处理 Shermo 的 Python 脚本。EasyShermo 使用极其简单无脑，可以瞬间用 Shermo 批处理几十个量子化学计算的输出文件。
鉴于 Shermo 已经是一个功能十分强大的科学计算程序了，所以 EasyShermo 也只是提高了 Shermo 的使用效率，并没有做其他的工作。 EasyShermo 开发者 Kimariyb 仅使用 Gaussian 和 Orca 作为计算单点的程序，尽管 Shermo 支持很多量化计算程序，但是 EasyShermo 也只支持 Orca 和 Gaussian 单点任务的自动化。
本项目已经开源在 Github 上，您可以通过以下步骤安装 EasyShermo：
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首先，您需要确保已经安装了 Python 环境和 pip 包管理工具。如果您还没有安装它们，请先安装它们。
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下载 EasyShermo 源代码：
git clone https://github.com/kimariyb/easy-shermo.gitEasyShermo 的作者 Kimariyb 同时用 Go 语言将 EasyShermo 编译打包了一遍，实现的效果和用 Python 语言的相差无几。可以前往 https://github.com/kimariyb/easy-Shermo/releases/tag/v1.2.2 下载已经编译好的 EasyShermo，下载后解压即可。
- 在使用 EasyShermo 之前，可以根据自己的需要配置好
settings.ini，settings.ini中大部分的配置选项和 Shermo 的settings.ini一致。在使用 EasyShermo 前，必须配置settings.ini中的shermoPath。
; The path to the Shermo executable file.
shermoPath = D:\\environment\\Shermo\\Shermo.exe
; The program for performing a single point calculation task.
; 1. Gaussian
; 2. Orca
spFile = 1
; Printing contribution of each vibrational mode.
; 1: Printing contribution of each vibrational mode.
; -1: Printing to vibcontri.txt.
; 0: Do not print
prtvib = 0
; Temperature in K.
; By specifying lower, upper limits and stepsize, e.g. 50,200,10, it can be scanned
T = 298.15
; Pressure in atm.
; By specifying lower, upper limits and stepsize, e.g. 0.5,20,0.1, it can be scanned
P = 1.0
; Frequency scale factor for ZPE
sclZPE = 1.0
; Frequency scale factor for U(T)-U(0) (the same as that for H(T)-H(0))
sclheat = 1.0
; Frequency scale factor for S(T)
sclS = 1.0
; Frequency scale factor for heat capacity
sclCV = 1.0
; Treatment of low frequencies.
; 0: Harmonic.
; 1: Raising low frequencies.
; 2: Entropy interpolation.
; 3: Entropy and internal energy interpolations
ilowfreq = 2
; Raising lower frequencies to this value (cm^-1) when ilowfreq=1
ravib = 100
; Mode of evaluating thermodynamic quantities.
; 0: Consider all terms.
; 1: Ignore translation and rotation
imode = 0
; If not 0, will calculate variation of Gibbs free energy due to concentration change from present state to the specific state.
; e.g. "conc= 1.5M" and "conc= 2.3atm"
conc = 0
; Exporting .shm file after loading QC program output file.
; 1: Exporting .shm file after loading QC program output file.
; 0: Do not export
outshm = 0
; Default atomic masses used during reading QC program output file.
; 1: Element mass.
; 2: Most abundant isotope.
; 3: Same as the output file
defmass = 3- 在配置文件中将
shermoPath配置好以后，分别将单点任务和振动分析任务的输出文件放入sp和opt文件夹里。同时，根据计算单点使用的程序是 Gaussian 还是 Orca 配置spFile选项。下面是 EasyShermo 测试文件的示例（单点、优化以及输出文件分别在sp/example、opt/example和output/example中）
- sp
- C_sp.out
- C2H2_sp.out
- C2H4_sp.out
- CH4_sp.out
- H2_sp.out
- opt
- C_opt.out
- C2H2_opt.out
- C2H4_opt.out
- CH4_opt.out
- H2_opt.out- 一切准备就绪之后，运行命令启动项目。EasyShermo 首先会扫描
sp目录下的所有文件，并得到单点能。之后通过命令行批量调用 Shermo 执行opt目录下的文件。最后将 Shermo 输出内容写入到output文件夹的文本文件中，文件名与opt中的文件相同。
python easyShermo.pyoutput 文件夹里的所有文件的内容，都和单独使用 Shermo 输出的内容一致。
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========== Total ==========
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Total q(V=0): 2.951881E+030
Total q(bot): 2.951881E+030
Total q(V=0)/NA: 4.901713E+006
Total q(bot)/NA: 4.901713E+006
Total CV: 12.472 J/mol/K 2.981 cal/mol/K
Total CP: 20.786 J/mol/K 4.968 cal/mol/K
Total S: 148.871 J/mol/K 35.581 cal/mol/K -TS: -10.609 kcal/mol
Zero point energy (ZPE): 0.000 kJ/mol 0.000 kcal/mol 0.000000 a.u.
Thermal correction to U: 3.718 kJ/mol 0.889 kcal/mol 0.001416 a.u.
Thermal correction to H: 6.197 kJ/mol 1.481 kcal/mol 0.002360 a.u.
Thermal correction to G: -38.189 kJ/mol -9.127 kcal/mol -0.014545 a.u.
Electronic energy: -37.7865397 a.u.
Sum of electronic energy and ZPE, namely U/H/G at 0 K: -37.7865397 a.u.
Sum of electronic energy and thermal correction to U: -37.7851234 a.u.
Sum of electronic energy and thermal correction to H: -37.7841792 a.u.
Sum of electronic energy and thermal correction to G: -37.8010850 a.u.
约定：为了避免出现 sp 文件和 opt 文件顺序不一致导致的问题，请按照约定分别将单点文件和优化文件的文件名该为 xxx_sp.out 和 xxx_opt.out。约定大于配置！
EasyShermo 可以直接通过已经编译好的可执行文件运行，省去了下载 Python 和配置 Python 环境变量的步骤，对于不会编程的人来说相当友好。使用的步骤和用 Python 脚本的步骤一致，只是省略了安装 Python 和相关的库。
Shermo 是 Sobereva@北京科音 开发的一个免费的可以独立运行的计算分子热力学数据的程序，需要从量子化学程序振动分析的输出文件里读取信息来进行计算，计算时基于理想气体假设。如果有对 Shermo 程序不熟悉的，可以浏览以下网址。
- Shermo 的官方网站：Shermo
- Shermo 的中文教程：使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
- Shermo 程序的原文：Shermo: A general code for calculating molecular thermochemistry properties
EasyShermo 基于 MIT 许可证开源。这意味着您可以自由地使用、修改和分发代码。有关更多信息，请参见 LICENSE 文件。