baseph

Les fonctions de base pour un projet simple de recherche clinique en R, particuièrement adapté pour une thèse ou un mémoire de DES.

Plusieurs tableaux :

• tab1ph Descriptif simple
• tabcph Comparaison simple
• glmph Régression logistique

Pour ces tableaux, possibilité d'avoir les intitulés vrais des variables & non les codes. Il vous faut alors créer une liste des "beaux intitulés" en csv qui doit être importé dans un data-frame.

Autres aides :

• debutph Importation d'un csv avec normalisation des noms de variables, colonnes de type caractère converties en facteur
• listrandph listes de randomisation multicentre, blocs variables.
• beaup Écrire un p = 0,05 esthétique avec p< 0,001 si nécessaire.
• bmiph Couper en facteurs un BMI numérique, version française & anglaise.

Graphiques

• barconfph Graphique en barres avec intervalle de confiance pour une variable numérique (y) & une variable factorielle de tri (x).
• barsimpleph Graphique en barre exprimé en % des modalités pour une variable factorielle (x)
• bardecph Même graphique que barsimpleph mais les % sont en ordre décroissant
• bardeuxph Graphique en barre. Une variable exprimée en % (y) pour chaque modalité (x) de l'autre.
• barouiph Graphique en barre avec barres d'erreur. Une variable binaire (oui/non) exprimée en % d'une modalité (oui par ex.) pour chaque modalité de l'autre.
• pyrph Pyramide des âges. La fonction epiDisplay::pyramid() donne aussi un très bon rendu. (en travaux)

Calcul du nombre de sujets nécessaires

• nbobsph Enquète simple
• nb.equi.ph Étude d'équivalence
• nb.obs.ph Étude de non-infériorité