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baseph

Lifecycle: stable

Les fonctions de base pour un projet simple de recherche clinique en R, particuièrement adapté pour une thèse ou un mémoire de DES.

Plusieurs tableaux :

  • tab1ph Descriptif simple
  • tabcph Comparaison simple
  • glmph Régression logistique

Pour ces tableaux, possibilité d'avoir les intitulés vrais des variables & non les codes. Il vous faut alors créer une liste des "beaux intitulés" en csv qui doit être importé dans un data-frame.

Autres aides :

  • debutph Importation d'un csv avec normalisation des noms de variables, colonnes de type caractère converties en facteur
  • listrandph listes de randomisation multicentre, blocs variables.
  • beaup Écrire un p = 0,05 esthétique avec p< 0,001 si nécessaire.
  • bmiph Couper en facteurs un BMI numérique, version française & anglaise.

Graphiques

  • barconfph Graphique en barres avec intervalle de confiance pour une variable numérique (y) & une variable factorielle de tri (x).
  • barsimpleph Graphique en barre exprimé en % des modalités pour une variable factorielle (x)
  • bardecph Même graphique que barsimpleph mais les % sont en ordre décroissant
  • bardeuxph Graphique en barre. Une variable exprimée en % (y) pour chaque modalité (x) de l'autre.
  • barouiph Graphique en barre avec barres d'erreur. Une variable binaire (oui/non) exprimée en % d'une modalité (oui par ex.) pour chaque modalité de l'autre.
  • pyrph Pyramide des âges. La fonction epiDisplay::pyramid() donne aussi un très bon rendu. (en travaux)

Calcul du nombre de sujets nécessaires

  • nbobsph Enquète simple
  • nb.equi.ph Étude d'équivalence
  • nb.obs.ph Étude de non-infériorité

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