Sin perder el original
ffmpeg -i file.mkv -codec copy file.mp4
La opción
-i
indicamos la ruta del fichero de vídeo que queremos procesar
ffmpeg -i file.mkv -map 0 -default_mode infer_no_subs -ss 02:00:00 -to 02:30:00 -c copy file_short.mvk
La opcion
-ss
indica el inicio del corte. Acepta varios formatos, mi recomendacion es usar HH:MM:SS. El valor00:01:00
es 1 minuto.
La opcion
-to
inica el final del corte. El formato es igual al anterior.
-c copy
indica que se copien todas las pistas de audio, video y subtitulos sin transcodificar.