SeqACompare

GUI基于tkinter库，序列比对基于Smith-Waterman Algorithm的一个快速进行序列比对软件。

打分表：

情况	变量名	得分
配对	match_award	1
不配对	mismatch_penalty	-2
不确定的碱基	N	-1
产生空位	gap_penalty	-3
空位延伸罚分修正	Extendgap_recalibration	1（在空位罚分-3的基础上）

使用方法

• 程序运行后，在Original Sequence上填写用fasta格式表示的原序列。
• 在Sequencing Result上填写用fasta格式表示的正向反向两段测序结果，5‘->3'填在第一个。
• 单击align，结果会在output窗口中输出。每次点击align会清空输出窗口。
• clear按钮用于清空所有窗口内容。

待办事项

• 输出时换行
• 标尺