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vhfsantos/2021FAPESP

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Estudo da instabilidade genômica de Halobacterium salinarum via sequenciamento de reads longas

Vinícius H. F. Santos1,2, Tie Koide1
1. Laboratório de Biologia Sistêmica de Microrganismos (LaBiSisMi) Departamento de Bioquímica e Imunologia, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, Brazil
2. Departamento de Biologia, Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, Brazil


Este repositório contém dados gerados na segunda etapa do trabalho de iniciação científica intitulado Estudo da instabilidade genômica de Halobacterium salinarum via sequenciamento de reads longas, financiado pela Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP).

Arquivos e explicações

Nome do arquivo Explicação breve
SC.fasta Sequência genômica da referência SC de H. salinarum estabelecida no projeto na abordagem Supervisão+Canu
SC.gff Anotação da referência SC feita pelo programa PROKKA
BC02.fasta Genoma da linhagem Δura3 montado na abordagem Supervisão+Canu
BC03.fasta Genoma da linhagem Δura3ΔLSm montado na abordagem Supervisão+Canu
BC04.fasta Genoma da linhagem Δura3ΔRNase R montado na abordagem Supervisão+Canu
BC05.fasta Genoma da linhagem Δura3B montado na abordagem Supervisão+Canu
BC06.fasta Genoma da linhagem Δura3ΔLSmB montado na abordagem Supervisão+Canu

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