一応Linuxでコンパイルしてみた

g++用makefileを追加、g++にない関数をinline asemblerで追加。
文字コードがSJISになっているものが多い気がするので、環境依存はありそうです。

src/makefile

@@ -0,0 +1,68 @@
+#
+# なのはminiにするときはNANOHAMINI=1の前の#を取り、
+# なのはnanoにするときはNANOHAMINI=1の前に#を付け、NANOHANANO=1の前の#を取る
+# nanoperyにするときはNANOPERY=1の前の#を取る
+#
+#NANOHAMINI=1
+#NANOHANANO=1
+
+EVAL_TYPE=EVAL_APERY
+EVAL_OBJ=evaluate_apery.o
+EXE = usapyon2dashAVX
+PGD = usapyon2dashAVX.pgd
+PGOLOG = usapyon2dashAVX_prof.txt
+
+OBJS = mate1ply.o misc.o timeman.o $(EVAL_OBJ) position.o \
+	 tt.o main.o move.o \
+	 movegen.o search.o uci.o movepick.o thread.o ucioption.o \
+	 benchmark.o book.o \
+	 shogi.o mate.o problem.o
+
+CC=g++
+LD=link
+
+
+
+# Compile Options
+#
+# -DEVAL_MINI      なのはmini(2駒関係(KP+PP)の評価関数)
+# -DEVAL_NANO      なのはnano(2駒関係(KPのみ)の評価関数)
+# -DEVAL_APERY     nanopery(Aperyの評価関数)
+#
+# -DTWIG           Apery(大樹の枝)の評価関数を使う
+# -DUSE_AVX2_EVAL  評価関数の計算時にAVX命令を使う
+#
+# Visual C++オプション
+#
+# /D_CRT_SECURE_NO_WARNINGS
+#                   secureな関数を使っていないときの警告を出さない
+# /Zc:forScope      スコープ ループに標準 C++ を適用する
+# /Wall             警告をすべて有効にする
+# /GS[-]            セキュリティ チェックを有効にする
+# /favor:<blend|AMD64|EM64T> 最適化するプロセッサ
+# /GL[-]            リンク時のコード生成を行う
+# /RTCs             スタック フレーム ランタイム チェック
+# /RTCu             初期化されていないローカル変数のチェック
+
+FLAGS = -DNDEBUG -D$(EVAL_TYPE) -DUSAPYON2 -DNANOHA -DCHK_PERFORM -DTWIG -DUSE_AVX2_EVAL\
+	-DOLD_LOCKS \
+
+#CXXFLAGS=$(FLAGS) /MT /W4 /Wall /nologo /Od /GS /RTCsu
+CXXFLAGS=$(FLAGS) -O3 -DIS_64BIT -msse -std=c++11 -mavx2 -Wa,-q -c
+LDFLAGS=-lpthread -o$(EXE)
+PGOLDFLAGS1=/NOLOGO /STACK:16777216,32768 /out:$(EXE) /LTCG:PGI
+PGOLDFLAGS2=/NOLOGO /STACK:16777216,32768 /out:$(EXE) /LTCG:PGO
+
+
+all: $(EXE)
+
+$(EXE) : $(OBJS)
+	$(CC) -o $@ $(OBJS) $(LDFLAGS)
+
+.cpp.o :
+	$(CC) $(CXXFLAGS) $*.cpp
+
+clean :
+	rm -f *.o
+	rm -f    $(EXE)
+

src/misc.h

@@ -103,6 +103,40 @@ class PRNG {
   { return T(rand64() & rand64() & rand64()); }
 };
 
+#ifdef _MSC_VER
+    #include <intrin.h>
+    #ifdef _WIN64
+        #pragma intrinsic(_BitScanForward64)
+        #pragma intrinsic(_BitScanReverse64)
+        #define USING_INTRINSICS
+    #endif
+#elif defined(__GNUC__) && defined(__LP64__)
+    static inline unsigned char _BitScanForward64(unsigned long* Index, uint64_t Mask)
+    {
+        uint64_t Ret;
+        __asm__
+        (
+            "bsfq %[Mask], %[Ret]"
+            :[Ret] "=r" (Ret)
+            :[Mask] "mr" (Mask)
+        );
+        *Index = (unsigned long)Ret;
+        return Mask?1:0;
+    }
+    static inline unsigned char _BitScanReverse64(unsigned long* Index, uint64_t Mask)
+    {
+        uint64_t Ret;
+        __asm__
+        (
+            "bsrq %[Mask], %[Ret]"
+            :[Ret] "=r" (Ret)
+            :[Mask] "mr" (Mask)
+        );
+        *Index = (unsigned long)Ret;
+        return Mask?1:0;
+    }
+    #define USING_INTRINSICS
+#endif
 
 inline unsigned long lsb(int64_t b) {
 	unsigned long idx;

src/position.h

@@ -30,6 +30,11 @@
 #include <memory> // For std::unique_ptr
 #include <string>
 
+#ifdef _MSC_VER
+#else
+#include <immintrin.h> // AVX2
+#endif
+
 #ifndef NANOHA 
 #include "bitboard.h"
 #endif