forked from sawsimeon/Modeller
-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
NSP4.D00000003
240 lines (240 loc) · 16.7 KB
/
NSP4.D00000003
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 66901.60938 0.0000 0.0000 1 3.00738e+06
10 299.52338 0.0617 0.7344 21 1687.37
20 87.45837 0.0579 0.2105 41 170.222
30 45.79712 0.0433 0.3026 61 53.1055
40 30.40642 0.0224 0.1437 81 19.0679
50 23.13546 0.0224 0.1734 101 20.0105
60 18.46723 0.0184 0.1506 121 5.91841
70 16.14322 0.0225 0.1029 141 4.11183
80 14.65451 0.0034 0.0181 162 1.50076
90 13.37632 0.0242 0.1841 182 3.40269
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 143.28209 0.0000 0.0000 1 263.646
10 134.22279 0.0118 0.0915 21 220.533
20 126.28658 0.0117 0.0843 41 123.846
30 120.21869 0.0041 0.0220 62 79.0259
40 116.02903 0.0102 0.0951 82 127.078
50 110.17622 0.0129 0.1219 102 103.84
60 106.80272 0.0088 0.0795 122 65.4091
70 103.62325 0.0093 0.0783 142 42.9504
74 102.69729 0.0013 0.0066 151 32.6766
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 546.90137 0.0000 0.0000 1 908.617
1 546.44910 0.0006 0.0041 3 547.413
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 1251.38220 0.0000 0.0000 1 4073.78
10 1193.81055 0.0134 0.2967 21 22460.4
20 1150.07166 0.0069 0.1078 41 6553.03
30 1118.27832 0.0090 0.0602 61 5440.59
35 1105.11389 0.0011 0.0082 72 2341.45
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 1267.15540 0.0000 0.0000 1 4443.2
4 1256.82861 0.0011 0.0074 9 3735.14
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 1846.70300 0.0000 0.0000 1 26990.3
10 1531.46716 0.0123 0.2051 21 21889.1
20 1409.81238 0.0074 0.0869 41 15026.9
30 1348.86133 0.0073 0.0957 61 16430.8
40 1292.62244 0.0062 0.0469 81 7554.36
50 1255.39697 0.0052 0.0454 101 3896.07
60 1223.35583 0.0090 0.0803 121 4980.51
70 1203.40479 0.0030 0.0224 141 3364.18
78 1191.69653 0.0012 0.0061 157 2730.25
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 1661.15894 0.0000 0.0000 1 11084.9
10 1515.69739 0.0119 0.1019 21 21873.2
20 1429.03186 0.0077 0.0538 41 11394.8
30 1391.37476 0.0079 0.0474 61 5190.01
40 1360.45386 0.0029 0.0236 81 7677.46
50 1324.00000 0.0054 0.0757 101 4994.28
60 1302.91724 0.0073 0.0490 121 4386.94
70 1285.63538 0.0096 0.0679 141 3322.47
73 1281.62244 0.0013 0.0099 148 6098.16
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 2033.58118 0.0000 0.0000 1 96928.6
10 1593.12085 0.0049 0.0398 21 25255.4
20 1491.02405 0.0054 0.0764 41 13634.7
30 1449.53650 0.0051 0.0531 61 6397.79
40 1426.28235 0.0044 0.0373 81 4465.07
49 1414.06653 0.0011 0.0058 99 3820.35
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 1680.44348 0.0000 0.0000 1 104174
10 1517.31836 0.0038 0.0218 21 5749.16
20 1495.12585 0.0034 0.0250 41 4328.24
30 1478.90918 0.0039 0.0235 61 3489.64
32 1476.10229 0.0007 0.0069 66 1237.23
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 1505.00500 0.0000 0.0000 1 14427.6
# Molecular dynamics simulation at 150.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 1489.30640 0.0000 0.0000 547.73737 151.34085
10 1805.13599 0.0156 0.0486 316.96378 87.57768
20 1887.69409 0.0187 0.0542 457.63336 126.44495
30 1930.36206 0.0194 0.0674 492.71680 136.13857
40 1953.07996 0.0200 0.0640 525.79987 145.27948
50 1948.57361 0.0201 0.1029 538.37598 148.75429
# Molecular dynamics simulation at 400.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 1948.57361 0.0000 0.0000 542.88458 150.00002
10 1937.47852 0.0207 0.1316 569.22485 157.27789
20 2341.70996 0.0279 0.0983 1029.68567 284.50406
30 2528.46265 0.0323 0.1264 1386.63110 383.12875
40 2547.00854 0.0314 0.1227 1307.73535 361.32971
50 2655.41138 0.0322 0.1148 1393.10962 384.91879
# Molecular dynamics simulation at 1000.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 2655.41138 0.0000 0.0000 1447.69250 400.00012
10 2625.27026 0.0331 0.1128 1438.70557 397.51703
20 3577.05005 0.0453 0.1625 2739.60498 756.95795
30 3964.31787 0.0494 0.1497 3255.98438 899.63452
40 4336.87207 0.0496 0.1789 3287.09546 908.23059
50 4422.65381 0.0518 0.1774 3552.88843 981.66968
# Molecular dynamics simulation at 1000.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 4422.65381 0.0000 0.0000 3619.22974 999.99994
10 4397.20215 0.0516 0.1658 3542.90039 978.90997
20 4401.37549 0.0519 0.1813 3558.59009 983.24506
30 4501.78564 0.0509 0.1423 3401.18726 939.75439
40 4561.88770 0.0512 0.1545 3438.93262 950.18347
50 4593.62549 0.0506 0.1884 3373.91284 932.21838
60 4510.73877 0.0513 0.1521 3433.61597 948.71448
70 4530.35449 0.0510 0.1513 3402.26416 940.05194
80 4548.35791 0.0511 0.1338 3392.05640 937.23151
90 4531.88818 0.0503 0.1397 3333.79541 921.13391
100 4445.45557 0.0519 0.1354 3520.81177 972.80682
110 4481.43604 0.0524 0.1455 3544.02905 979.22180
120 4524.77100 0.0519 0.1623 3502.42871 967.72760
130 4610.44531 0.0517 0.1660 3449.65894 953.14722
140 4520.64355 0.0518 0.1371 3484.64185 962.81305
150 4523.04639 0.0522 0.1499 3514.33911 971.01843
160 4525.73877 0.0519 0.1553 3503.86963 968.12573
170 4511.64258 0.0528 0.1438 3577.98853 988.60492
180 4547.01709 0.0520 0.1437 3512.40771 970.48480
190 4572.72607 0.0513 0.1809 3450.82153 953.46844
200 4559.49219 0.0520 0.1567 3498.55688 966.65778
210 4612.75537 0.0526 0.1437 3551.44775 981.27161
220 4520.59473 0.0531 0.1426 3668.43628 1013.59576
230 4618.67578 0.0527 0.1546 3606.36401 996.44507
240 4617.52197 0.0521 0.1409 3550.76733 981.08362
250 4506.81396 0.0531 0.1443 3658.54614 1010.86310
260 4590.21240 0.0535 0.1375 3647.38940 1007.78046
270 4578.60938 0.0525 0.1474 3578.75635 988.81702
280 4583.81885 0.0529 0.1504 3603.04028 995.52673
290 4717.60449 0.0523 0.1588 3526.53394 974.38788
300 4633.60986 0.0525 0.1321 3537.87012 977.52008
# Molecular dynamics simulation at 800.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 4633.60986 0.0000 0.0000 3619.23193 1000.00055
10 4614.82666 0.0530 0.1345 3655.96338 1010.14948
20 4672.84570 0.0526 0.1375 3535.41919 976.84290
30 4722.98828 0.0528 0.1498 3615.21484 998.89062
40 4652.74072 0.0531 0.1357 3613.65747 998.46027
50 4659.20264 0.0531 0.1423 3631.80493 1003.47449
60 4651.60449 0.0526 0.1498 3631.59302 1003.41589
70 4644.14844 0.0532 0.1445 3657.64624 1010.61444
80 4622.69336 0.0531 0.1635 3676.04614 1015.69843
90 4719.79980 0.0522 0.1474 3517.71069 971.95001
100 4615.98633 0.0536 0.1425 3701.93262 1022.85089
110 4171.11084 0.0506 0.1334 3303.72461 912.82526
120 4300.60840 0.0500 0.1384 3214.61060 888.20288
130 4292.64355 0.0500 0.1552 3243.21802 896.10718
140 4208.01367 0.0506 0.1344 3297.00073 910.96747
150 4216.57178 0.0502 0.1363 3268.49561 903.09143
160 4201.87793 0.0502 0.1347 3257.10547 899.94434
170 4313.90479 0.0501 0.1459 3240.24756 895.28644
180 4124.56348 0.0508 0.1387 3335.79980 921.68768
190 4164.10547 0.0508 0.1412 3310.69653 914.75165
200 4308.95117 0.0496 0.1442 3183.14331 879.50842
210 4064.25610 0.0495 0.1527 3168.94434 875.58521
220 4168.30029 0.0486 0.1287 3035.76196 838.78668
230 4009.30273 0.0501 0.1330 3242.63623 895.94641
240 4016.91016 0.0497 0.1319 3174.65405 877.16284
250 4123.53174 0.0488 0.1661 3108.37158 858.84888
260 4049.00024 0.0495 0.1348 3184.89111 879.99133
270 4122.75977 0.0484 0.1322 3029.88062 837.16168
280 4055.38843 0.0496 0.1285 3159.18359 872.88831
290 4037.97510 0.0492 0.1245 3125.77954 863.65869
300 4054.84521 0.0496 0.1255 3150.52515 870.49597
# Molecular dynamics simulation at 500.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 4054.84521 0.0000 0.0000 2895.38281 799.99969
10 3998.71484 0.0480 0.1283 2990.53198 826.28955
20 4041.87354 0.0478 0.1200 2932.93848 810.37634
30 3970.68408 0.0484 0.1246 2988.11060 825.62054
40 3997.09082 0.0480 0.1314 2972.02075 821.17487
50 4004.33521 0.0482 0.1269 3008.04077 831.12726
60 4000.55396 0.0477 0.1521 2924.09863 807.93390
70 4033.30713 0.0480 0.1292 2970.90967 820.86786
80 3940.92676 0.0480 0.1392 2997.33252 828.16858
90 3994.33545 0.0486 0.1186 3025.05811 835.82916
100 3939.47827 0.0483 0.1272 3006.82031 830.79004
110 3420.56396 0.0429 0.1312 2373.11890 655.69714
120 3335.55103 0.0429 0.1439 2365.88770 653.69916
130 3455.34375 0.0431 0.1065 2401.82153 663.62775
140 3396.52246 0.0430 0.1137 2371.61548 655.28180
150 3402.73438 0.0433 0.1315 2410.03467 665.89709
160 3450.37671 0.0427 0.1068 2333.87549 644.85413
170 3409.23145 0.0430 0.1108 2375.57764 656.37653
180 3416.99829 0.0428 0.1092 2364.75537 653.38629
190 3421.63110 0.0428 0.1115 2359.87231 652.03711
200 3390.18237 0.0430 0.1148 2382.55273 658.30377
210 3119.39868 0.0404 0.1183 2119.80981 585.70740
220 3105.23438 0.0403 0.1240 2107.43726 582.28882
230 3133.14307 0.0400 0.1117 2072.02441 572.50421
240 3151.29639 0.0405 0.1103 2106.13477 581.92896
250 3145.68286 0.0401 0.1092 2092.45044 578.14795
260 3132.38623 0.0403 0.1065 2082.18945 575.31281
270 3048.43481 0.0408 0.1112 2152.64600 594.78009
280 3052.95410 0.0411 0.1036 2174.98755 600.95312
290 3112.62305 0.0407 0.0984 2132.85742 589.31250
300 3102.54175 0.0405 0.1033 2116.44995 584.77905
# Molecular dynamics simulation at 300.00 K
# Step Current energy Av shift Mx shift Kinetic energy Kinetic temp.
0 3102.54175 0.0000 0.0000 1809.61438 499.99982
10 2994.99048 0.0387 0.0992 1915.58826 529.28058
20 2945.30298 0.0393 0.1014 1965.07825 542.95477
30 2975.61499 0.0387 0.0967 1931.98315 533.81055
40 3042.17651 0.0383 0.1002 1874.02124 517.79553
50 2968.25781 0.0390 0.0999 1953.21057 539.67572
60 2959.89160 0.0390 0.1120 1958.99146 541.27301
70 2953.16772 0.0390 0.1008 1958.85425 541.23511
80 2985.58936 0.0388 0.1008 1954.60864 540.06201
90 2962.43652 0.0388 0.0998 1940.88635 536.27051
100 3007.55566 0.0388 0.0941 1922.33679 531.14526
110 2611.82129 0.0345 0.0871 1527.04810 421.92624
120 2534.16895 0.0342 0.0988 1514.80542 418.54355
130 2643.83228 0.0346 0.0933 1535.71570 424.32111
140 2565.20264 0.0343 0.0918 1531.69568 423.21036
150 2598.69507 0.0341 0.0876 1488.00342 411.13812
160 2544.34082 0.0347 0.0909 1534.94543 424.10828
170 2592.03735 0.0344 0.0916 1536.36646 424.50092
180 2569.49463 0.0344 0.0938 1529.76672 422.67740
190 2605.66919 0.0343 0.0899 1519.11194 419.73346
200 2537.48047 0.0347 0.0948 1555.78394 429.86600
210 2342.39209 0.0320 0.0793 1316.11475 363.64496
220 2342.34790 0.0315 0.0855 1284.84485 355.00504
230 2346.24072 0.0316 0.0874 1297.15613 358.40665
240 2325.51001 0.0317 0.0827 1285.79578 355.26776
250 2368.85986 0.0316 0.0797 1279.65259 353.57040
260 2339.39648 0.0317 0.0792 1288.64001 356.05365
270 2355.06812 0.0316 0.0827 1287.08960 355.62524
280 2346.53174 0.0316 0.0794 1282.86377 354.45764
290 2332.08301 0.0318 0.0780 1296.91125 358.33899
300 2354.10376 0.0312 0.0877 1266.06238 349.81540
# Conjugate gradients optimization
# Step Current energy Av shift Mx shift Funcs Gradient
0 2354.10376 0.0000 0.0000 1 1.99335e+06
10 1296.92944 0.0113 0.0380 21 27562.5
20 1202.33447 0.0084 0.0295 41 10336.9
24 1187.57458 0.0018 0.0075 50 3165.23