sequentialDVI: check-problem. Add seed, mutation

[thoree]

Fra/til Thore: Sjekk sequentialDVI. Legge til seed slik at resultater blir reproduserbare?
Hvordan håndteres mutasjoner?

library(dvir)
data(planecrash)
pm = planecrash$pm
am = planecrash$am
missing = planecrash$missing
sequentialDVI(pm, am, missing)
#> Error in checkDVI(pm, am, missing = missing, moves = moves): Third vector must a vector with names of missing persons

^{Created on 2021-01-15 by the reprex package (v0.3.0)}

[magnusdv]

Generelt tror jeg checkDVI() fortjener en gjennomgang. Noen sjekker er unødvendige, mens andre mangler. Spesielt kan man vurdere om den skal kontrollere at markør-attributter er identiske mellom AM og PM.

[thoree]

Enig, jeg skal se på checkDVI senere

[thoree]

Problem med sequentialDVI ikke knyttet til checkDVI, feilmelding fra nMarkers():

library(dvir)
pm = example2$pm
am = example2$am
missing = example2$missing
sequentialDVI(pm, am, missing, check = F, verbose = T)
#> Iteration 1 
#>    M1 M2 M3
#> V1  1  0  0
#> V2  1  5  0
#> V3  0  0  5
#> --> V2 = M2
#> Iteration 2 
#>    M1 M3
#> V1 10  0
#> V3  0  5
#> --> V1 = M1
#> Iteration 3 
#>    M3
#> V3  5
#> --> V3 = M3
#> Error: Input to `nMarkers()` must be a `ped` object or a list of such

^{Created on 2021-01-19 by the reprex package (v0.3.0)}

[magnusdv]

Ah, I see the problem. I suggest to insert the following line in singleSearch.R, just before ### Update the LR matrix (line 66):

if(i == length(RES)) 
  break 

[thoree]

Thanks, problem solved! (I figured out that you meant in sequentialDVI.R)

[magnusdv]

(Correct - sorry!)