Здесь преставлены основные файлы проекта. Запуск производился на суперкомпьютере.
- Write_lammps создает начальную конфигурацию системы
- in.water непосредственно файл запуска lammps
- ngl.ipynb ноутбук с визуализацией начальной конфигурации
- report.ipynb ноутбук с итоговыми графиками и сеарилизацией
- ovv_vis.py скрипт для визуализации поведения системы
- Файлы rr* служат для вычисления параметра негауссовости
Остальные скрипты служат для автоматизации процесса