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Custom support software for the CR300 and a specific setup with radiometers at Marambio antarctic base

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GOA-UVa/apogeo

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Apogeo

Version 24.03 License: GPL v3

Software encargado de recibir los datos del DataLogger CR300 que recibe datos de los apogees situados en la Base Marambio, y enviar esos mismos datos a un servidor FTP/SFTP del GOA.

Las medidas realizadas por el GOA en la Base Marambio pueden observarse en goa.uva.es/marambio-station.

Archivos presentes:

  • apogeo: Modulo de python con el código necesario para acceder a los datos y enviarlos al servidor FTP/SFTP.
  • apogeo/cr300: Modulo de python que permite acceder a los datos del CR300.
  • read_data.py: Script principal en python que lee el CR300 y sube los datos al servidor FTP/SFTP.
  • apo2.CR300: Programa que se ejecuta dentro del CR300.
  • requirements.txt: Requisitos del entorno de python para poder ejecutar el read_data.py
  • config.mock.json: Fichero json con datos de ejemplo que deberán ser sustituidos con los reales en producción, y guardado como config.json.
  • draw_apogees_graph.py: Script que genera las imágenes que muestran datos de los últimos 3 días aplicando un filtro gaussiano.

Instalación y ejecución

Código del CR300

Para instalar/actualizar el código del DataLogger el usuario deberá abrir el programa PC400 y establecer una conexión con el CR300. Ahí se le presentará la opción "Send Program...", la cual pulsará. A partir de ahí el usuario ha de seleccionar el programa apo2.CR300 que se enviará al DataLogger. Es importante cambiar el formato de ficheros a mostrar de 'Program Files (*.crb)' a 'All files (*)'.

Código de python

Entorno virtual

La siguiente información está explicada para ejecutar en Windows, en Linux es levemente distinto pero se asume que el usuario de Linux sabe encontrar los cambios necesarios.

Idealmente este código se ejecutará en un entorno de ejecución de venv, que debería llamarse '.venv'. Si este directorio no existe, debería ser creado con:

python -m venv .venv

A continuación se activa el entorno de ejecución con:

.venv\Scripts\activate

Y finalmente se prepara el entorno virtual instalando los paquetes necesarios con:

pip install -r requirements.txt

En dichos requisitos está comentada una línea con la librería necesaria para SFTP, que en caso de que sea el protocolo a usarse deberá ser descomentada.

Ejecución

La ejecución simplemente deberá ser realizada mediante el programador de tareas de Windows, al cual se le deberá indicar que se quiere ejecutar el archivo .venv/Scripts/python.exe con el fichero read_data.py como argumento, desde el directorio en el que se encuentre este repositorio. La tarea deberá ser desencadenada una vez a una hora concreta arbitraria, y se repetirá cada 2 horas indefinidamente.

Configuración

La configuración deberá estar guardada en un fichero llamado 'config.json'. Para generarlo se debe copiar el fichero 'config.mock.json' y llamar 'config.json' a la copia. A continuación se deberán modificar los valores de dicho fichero a conveniencia. Los parámetros disponibles son:

  • serialport: Puerto donde se establece la comunicación en serie con el datalogger.
  • remoteuser: Nombre de usuario para acceder al servidor donde se envían los datos.
  • remotepass: Contraseña para acceder al servidor donde se envían los datos.
  • remotehost: Dirección del host servidor a donde se envían los datos.
  • remotedir: Ruta del directorio donde se guardaran los datos dentro del servidor.
  • remoteprotocol: Protocolo a usar para la comunicación de los datos con el servidor. Disponibles: "ftp" y "sftp". Se recomienda usar SFTP, pues la librería FTP por defecto de python es notablemente más lenta que la de SFTP.
  • host_key_checking: Valor booleano (true o false). Sólo útil en comunicaciones SFTP, donde en caso de ser true se realizará una comprobación de host-keys del host al que se conecta.

Cómo encontrar el puerto

El nombre del puerto al que está conectado el CR300 deberá introducirse en el campo "serialport" del fichero config.json.

En Windows habitualmente es "COM4" y en Linux "/dev/ttyACM0". En Linux también puede introducirse el id directamente, lo cual quedaría para la instalación actual como: "/dev/serial/by-id/usb-Campbell_Scientific__Inc._CR300_00000000050C-if00". Esto es útil en caso de que se quieran leer todos los datos del CR300, pues se fuerza el reinicio del CR300 lo cual cambia normalmente de "/dev/ttyACM0" a "/dev/ttyACM1", pero el id sigue igual.

Linux

sudo dmesg | grep tty

Windows

Via el explorador de dispositivos.

Otros

Serial CMD help output

El módulo de python cr300 se comunica con el datalogger mediante comunicación serial. Los comandos disponibles en dicha comunicación se pueden ver tras ejecutar el comando 'help' en dicha comunicación, cuyo output es el siguiente:

Status Commands
  show timeout list (PakBus timeout list)
  show time queue (Time Queue (RTOS))
  show time (Display Time)
  show status (Status)
  show errors (Errors)
  show settings fields (Settings Fields)
  show settings (Settings)
  show scan (Scan Information)
  show vars (Public Variables)
  show records (Start / Continue Record Output)
  show table structure (Table structure (CRBASIC Format))
  show table (Data Table Info)
  show inlocs (Read Inloc Binary)
  show device info (Device Information)
  show tasks (Task / Debug Info)
  show task memory (Task Memory)
  show watchdog counters (Watchdog Counters)
  show watchdog timers (Watchdog timers)
  show watchdog (Watchdog File)
  show wnvars (Public Variables w/o names)
  show trace detail xx_hex_xx (Mem Trace Detail)
  show mem trace (Memory Trace List)
  show memory (Memory)
  show os history (OS Update History)
  show program line number (Program execution line numbers)
  show program (CR-Basic Program)
  show calibration (Calibration Table)
  show temperature (Temperature (Internal))
  show battery (Battery Voltage)
  show dnp stats (DNP3 stats)
  show routers neighbors (Routers and neighbors)
  show routes (Routes)
  show link states (PakBus link states)
  show expect more (PakBus expect more list)
  show tcp listen (TCP Listen list)
  show tcp sockets (TCP socket list)
  show pakbus clients (PakBus/TCP Clients)
  show file system (File System Information)
  show IP INFO #net (IP Info)
  show IP mem (IP memory detail)
  show IP Route (IP Route list)
  show events (Events (RTOS))
  show web status (Web update status)
  show cellular Info (Cellular info)
  show cellular errors (Cellular error summary)
  show cellular log (Cellular error log)
  show cellular update status (Cellular firmware update status
  show modbus stats (Modbus stats)
  show preserve (PreserveVariables Info)
  show GOES (GOES state)
  show SMS TX (SMS Tx Log)
  show SMS RX (SMS Rx Queue)
Set Commands
  set comms watch (Comms Watch)
  set const table (Edit const table)
  set term mast (Terminal Master)
  set cellular pdp clear (sets flag to clear stored PDP conten
  set cellular MBN reset (sets flag to reset cellular MBN)
Action Commands
  reboot (Restart, compile and run program)
  clear watchdog (Clear watchdog counts)
  clear SFE (Clear SF errors)
  stop comms watch (stop comms watch)
  SDI12 (SDI-12 talk through)
  talk through (Serial Talk Through)
  web update (Web files update start)
  cellular update (Cellular update)
  cellular radio update (Cellular radio update)
  cellular reset (Cellular reset)
  PCAP capture (Wireshark PCAP capture)

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