KamilSuchanek95 / micaff Public

Notifications You must be signed in to change notification settings
Fork 0
Star 0

MicAff is a genomic data analysis tool. Application made with Shiny. It is used to analyze the data from the microarray experiment. Running on a local server, it allows you to load CEL data, their initial processing and further analysis.

Unlicense license

0 stars 0 forks Branches Tags Activity

Notifications

Name		Name	Last commit message	Last commit date
Latest commit History 41 Commits
micaff		micaff
moje pliki		moje pliki
sprawozdanie		sprawozdanie
.gitignore		.gitignore
LICENSE.md		LICENSE.md
README.md		README.md
renaming.rb		renaming.rb

Repository files navigation

Narzędzie do analizy danych genomicznych - MicAff.

Aplikacja stworzona przy pomocy Shiny-R. Służy do przykładowej analizy danych, pochodzących z eksperymentu mikromacierzowego.

Narzędzie umożliwia:

Odczytanie plików .CEL
Przetwarzanie wstępne (podsumowanie sond i normalizację)
Kontrolę jakości
Wizualizację danych
Obliczenie statystyk z ewentualną korektą wartości p
Typowanie istotnych genów zgodnie z zadanymi kryteriami
Przedstawienie ewentualnych wzorców
Pobranie danych po normalizacji oraz wykonanych statystyk

Przykładowy przebieg pracy aplikacji:

About

MicAff is a genomic data analysis tool. Application made with Shiny. It is used to analyze the data from the microarray experiment. Running on a local server, it allows you to load CEL data, their initial processing and further analysis.

r tool bioconductor microarray-data shiny-apps microarray-analysis

Unlicense license

Report repository

Releases

No releases published

Packages

No packages published

Languages