实验环境搭建

• python (tested on version 3.8.13)
• pytorch (tested on version 1.11.0+cu115)
• torch-geometric (tested on version 2.1.0post1)
• numpy (tested on version 1.22.3)
• scikit-learn(tested on version 1.1.2)

文件夹:

• code：GraphCDA 的模型代码和训练代码。
• data：GraphCDA 所需的数据。
• datasets：几个公共数据库
• results：GraphCDA 运行的结果。

数据描述:

• d_d.csv: 疾病综合相似性
• c_c.csv: circRNA 综合相似性
• d_c.csv: 疾病-circRNA 关联表
• dss.csv: 疾病语义相似性
• cfs.csv: circRNA 功能相似性
• dgs.csv: 疾病高斯内核相似性
• cgs.csv: circRNA 高斯内核相似性
• disname.txt: 疾病名称列表
• circname.txt: circRNA 名称列表