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DBMS Project

系统基本说明

本系统主要是基于针对NVM优化的数据结构FPTree,实现一个简单的键值存储引擎FPTreeDB。我们通过将其包装成一个调用库,供用户程序使用并管理其数据存储,与LevelDB的使用方式类似。对外可用的数据基本操作有增(insert)删(remove)改(update)查(find)。在系统恢复操作上,使用BulkLoading的方式。系统实现上主要是非叶子结点节点的结构类B+Tree、叶子节点要用PMDK与NVM进行数据交互。

作者

温鸿玮(17308164)、王俊焕(17308154)、王鑫基(17309084)

使用方法

使用环境

Linux Ubuntu 14.0.4及以上

源码下载,使用

git clone https://github.com/colorfuljor/www.git

编译链接

在main函数中编写自己所用代码
进入./Programming-FPTree/src输入make编译出可运行文件
(若要在自己的代码文件里书写代码,最后要链接fptree.cpp、p_allocator.cpp、utility.cpp

函数接口

  1. FPTree::FPTree(uint64_t degree)构造一个度为degree的FPTree
  2. FPTree中键值对数据类型
    typedef uint64_t Key; // key(8 byte)
    typedef uint64_t Value; // value(8 byte)
  3. void FPTree::insert(Key k, Value v)向FPTree中插入键值对<k,v>
  4. bool FPTree::remove(Key k)向FPTree中删除键k对应的数据项,成功则返回true,否则返回else
  5. bool FPTree::update(Key k, Value v); 将FPTree中键k对应的值更新为v
  6. Value FPTree::find(Key k); 获得FPTree中键k对应的值
  7. void FPTree::printTree()以字符串形式打印树

测试与结果分析

fptree与levelDB性能对比

220w-50-50测试中,发现fptree插入效率是levelDB的6倍以上,而RUN阶段效率却比较低。

现在分析下面三次测试,三次测试insert/search比率依次增大。
load阶段fptree有绝对优势。 run阶段fptree的吞吐量依次为18264, 29092, 43072, levelDB吞吐量依次为10928, 9323, 8305。
由此可见fptree插入效率高,查询效率低,而levelDB则相反。

fptree查询效率低的原因

fptree叶子节点中的键值对是无序的,我们使用了fingerprint,在对比fingerprint时调用的keyHash,我们注释掉相关函数,不使用fingerprint机制后,发现性能大大提升,fptree的插入删除都比levelDB效率高,如下图。
fptree中的fingerprint是否有存在的必要呢?

测试方法

[2019/5/30]可进行fptree与levelDB的性能对比测试

  1. 在终端进入到./Programming-FPTree/src 输入make编译运行出可运行文件(先进行make clean)
  2. 进入./Progaming-FPTree/src 输入./bin/ycsb即可进行性能对比测试
  3. 如果希望修改所用的测试文件,可以修改./Programing-FPTree/src/ycsb.cpp行11、12、14的文件名,文件路径在./Programing-FPTree/workload

[2019/5/30]可进行删除操作的测试

  1. 在终端进入到./Programing-FPTree/test 输入make编译运行出可运行文件
  2. 进入./Programing-FPTree/test/bin 输入./utility_test即可测试系统分配叶子空间,````./fptree_test```即可测试叶子结点的删除操作

[2019/5/18]可进行系统查询和更新操作的测试

  1. 在终端进入到./Programing-FPTree/test 输入make编译运行出可运行文件
  2. 进入./Programing-FPTree/test/bin 输入./utility_test即可测试系统分配叶子空间,./fptree_test即可测试叶子结点的查询和更新操作

[2019/5/11]可进行系统分配叶子空间以及树节点插入的测试

  1. 在终端进入到./Programing-FPTree/test 输入make编译运行出可运行文件
  2. 进入./Programing-FPTree/test/bin 输入./utility_test即可测试系统分配叶子空间,./fptree_test即可测试叶子结点的插入操作

[2019/5/4]系统尚未完成,只能进行系统分配节点的测试,增删改查功能尚未完成。

  1. 进入到./Programing-FPTree/test 新建data文件夹或修改p_allocator.h内路径
  2. 在终端进入到./Programing-FPTree/test 输入make编译运行出可运行文件
  3. 进入./Programing-FPTree/test/bin 输入./utility_test即可测试

实现时间计划

  1. 5月4日前:系统说明书,PAllocator实现并通过utility测试,LevelDB的使用以及测试(对应lycsb.cpp,p_allocator.cpp的实现和运行,utility_test.cpp的运行)
  2. 5月4日-5月11日:FPTreeDB插入和重载操作并通过相关测试(对应fptree.cpp的实现和fptree_test.cpp部分的运行)
  3. 5月11日-5月18日:FPTreeDB查询和更新操作并通过相关测试(对应fptree.cpp的实现和fptree_test.cpp部分的运行)
  4. 5月18日-5月31日:FPTreeDB删除操作和所有剩下实现以及测试(对应fptree.cpp的实现和fptree_test.cpp所有的运行)

实现进度

[2019/5/30]完成树的叶子结点的删除

1.完成InnerNode::remove()相关操作,其间递归调用remove(),遇到子结点删除不满足degree的约束条件时就重定位,如果不能重定位就进行merge操作。
2.完成InnerNode::restributeLeft()、InnerNode::restributeRight()分别为与左兄弟重定位操作、右兄弟重定位操作。
3.完成InnerNode::mergeLeft()、InnerNode::mergeRight()、InnerNode::mergeParentLeft()、InnerNode::mergeParentRight()的合并操作。

[2019/5/18]完成树的叶子节点的查询、更新

  1. 完成InnerNode::find(const Key& k)递归地查询,最终调用LeafNode::find(const Key& k)循环查询到符合条件的键值,查询失败则返回MAX_VALUE
  2. 完成InnerNode::update(const Key& k, const Value& v)递归地查询,最终调用LeafNode::update(const Key& k, const Value& v)进行实际地键值更新,查询方式与find函数相同,更新后需调用persist()进行数据持久化
  3. 修补p_allocator.cpp中getleaf与freeleaf的关于startLeaf的更新,并增加了数据持久化

[2019/5/11]完成树的叶子节点的插入、重载

  1. 完成InnerNode::findIndex(Key)二分查找找到键插入的合适下标
  2. 完成InnerNode::insertNonFull(Key,Node *)、InnerNode::insert(Key,value&)、InnerNode::insertLeave(Keynode&)递归的插入非叶子键值,最终插入叶子结点
  3. 完成InnerNode::split()中间结点的分裂
  4. 完成FPTree::bulkloading(),利用pAllocator->startLeaf以链表形式载入,通过root->insertLeave()插入结点

[2019/5/4]PAllocator.cpp实现、通过utility测试、通过LevelDB测试

  1. LevelDB是google实现的键值数据库。我们需要学会文件读写、调用LevelDB的接口完成相应写入、读取(增删改查)功能。我们通过编写lycsb.cpp实现将workload中的txt文件转化为键值对,存入到LevelDB中,并对LevelDB功能进行测试。
  2. PAlloctor是NVM文件管理的主要对象,负责分配LeafNode在NVM的空间,映射数据文件并返回虚拟地址给LeafNode使用。主要实现叶结点的分配、get、free方法,该过程需要使用到PMDK的libpmem库对NVM进行操作。