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Latest commit 42d40f3 Feb 28, 2019
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Type Name Latest commit message Commit time
Failed to load latest commit information.
R语言小作业 first Feb 23, 2019
README.md add links to readme Feb 28, 2019
SRR_Acc_List.txt second version Feb 28, 2019
SraRunTable.txt
advancedR 2.pdf
advancedR.pdf second version Feb 28, 2019
base-r.pdf
basicR.pdf

README.md

针对B站R语言视频的配套代码

本来呢,视频都免费送给大家学习了,我是不想再耗费时间去整理这些学习资料和代码了。

但是不少重量级嘉宾都表示督促其学生在学习我的视频,大佬的面子还是要给的,勉为其难把代码整理一下,并且系统性介绍一下B站R语言视频吧。

视频应该是都在:https://www.bilibili.com/video/av25643438/

如果是需要安装R包,请务必参考:http://www.bio-info-trainee.com/3727.html 代码

第3期视频

目录如下:

00.安装R包
01.基础变量
02.数据导入导出
03.画个热图-学习R包
04.ensembl2symbol
05.任意基因任意癌症表达量分组的生存分析
06.任意基因任意癌症表达量和临床性状关联
07.相关性分析
08.芯片表达矩阵下游分析
09.RNA-seq差异分析
10.超几何分布检验示例及原理
11.生信绘图大全
12.GSEA
13.shiny

第3期视频配套练习题是,R语言小作业:http://www.bio-info-trainee.com/3750.html

练习题代码(答案)在: 【R语言小作业】 文件夹 ,下载我这个GitHub的project,然后直接进入文件夹,打开里面的文件 tmp.Rproj 就可以唤起你电脑的Rstudio软件,开始跟着我的视频完成作业啦!!!

视频解答在:https://www.bilibili.com/video/av25643438/?p=13

大约有十万人观看了我的视频教程,下面是一些优秀学习笔记列表:

该列表持续更新,欢迎大家踊跃发邮件(jmzeng1314@163.com)给我,展现你的学习过程,我会认识你的。

第2期视频

再次强调,视频是免费的,并不是为了服务你,所以这些视频讲解的知识点会有部分重合,但是我每次录制视频教程,都是我的思考方式,我的知识点组织形式的展现,都值得初学者学习,所以请务必仔细听!

目录如下:

R-1-学习资源介绍.mp4
R-2-与excel的区别.mp4
R-3-简单统计及数学函数.mp4
R-4-基础语法.mp4
R-5-高级数据处理技巧.mp4
R-6-绘图该如何学.mp4
R-7-作业.mp4
R-总结.mp4

课程配套讲义在:文档链接:https://mubu.com/doc/HGT7XBmgg 密码:muwu

大概问的最多的问题,就是在R-2-与excel的区别视频里面,我演示的文件来自于哪里,其实呢,你仔细看视频,然后如果学会我一直想传达的搜索能力,你就应该明白是可以自己搜索找到的

来自于文献:Identifying and Targeting Sporadic Oncogenic Genetic Aberrations in Mouse Models of Triple Negative Breast Cancer - BioProject 的数据:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA398328 点击 RunSelector. Send results to Run selector 就可以下载那两个文件啦。

第1期视频

虽然后面还有十几个视频,但主要是很久以前我的一些R碎片化知识点讲解,并不介意大家继续学习。

关于速查表

GitHub里面还有速查表,自取,不谢。

关于进阶

很多朋友之所以学习R语言其实就是为了重复一些简单的数据库挖掘文章,所以我也顺便录制了GEO数据库挖掘课程:

配套练习题

初级10 个题目,尽量根据参考代码理解及完成:http://www.bio-info-trainee.com/3793.html

中级要求是:http://www.bio-info-trainee.com/3750.html

高级要求是完成20题: http://www.bio-info-trainee.com/3415.html

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