Skip to content
master
Go to file
Code

Latest commit

 

Git stats

Files

Permalink
Failed to load latest commit information.
Type
Name
Latest commit message
Commit time
src
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

README.md

License Build Status GitHub repo size in bytes

Realfagstermers prosjektrom

Dette er et åpent prosjektrom for Realfagstermer, et kontrollert emneordsvokabular som utvikles og brukes av Universitetsbiblioteket i Oslo og Universitetsbiblioteket i Bergen. Vokabularet har termer på bokmål, nynorsk og engelsk og har overganger til Tekord, Dewey og Wikidata.

Søk i vokabularet via Emnesøk, Skosmos eller visuelt med LodLive.

Vi bruker sakssystemet (issue trackeren) til GitHub for å diskutere og behandle nye termer og endringer.

Sakene organiseres med etiketter (labels). Se CONTRIBUTING.md for forklaring av de ulike etikettene.

GitHub-tips for bidragsytere:

  • Du blir varslet hver gang noen nevner deg. Du blir også varslet når det kommer nye innlegg i diskusjoner du har opprettet eller kommentert. Som standard får du varslinger på e-post, men du kan endre dette i innstillingene dine.

  • Hvis du ønsker tilbakemeldinger fra bestemte personer, for eksempel fagansvarlige for bestemte fag, kan det være lurt å nevne dem. Under finnes det en oversikt over hvem som er hvem.

  • Funksjonaliteten watch gir varslinger om alle oppdateringer i alle saker og kan fort gi varslingsutmattelse.

Bidragsytere

(For å varsle alle: @realfagstermer/alle)

Aktive deltakere fra Universitetsbiblioteket i Oslo, sortert alfabetisk etter brukernavn:

  • @BioHeidi : Heidi Konestabo, klassifiserer biovitenskap.
  • @danmichaelo : Dan Michael O. Heggø, klassifiserer fysikk og materialvitenskap, utvikler Emnesøk.
  • @edinab : Edina Pozer Bue, klassifiserer geofag og meteorologi.
  • @grosyn :  Gro Synnøve Nesland, klassifiserer litt innimellom katalogiseringen.
  • @jessiclo : Jessica Lönn-Stensrud, mikrobiolog.
  • @haraldse : Kirsten Borse Haraldsen, klassifiserer biovitenskap.
  • @kyrretl : Kyrre Traavik Låberg, biolog, utvikler Emnesøk.
  • @Quether : Trine Høyås, klassifiserer informatikk (UiO, 2019-).
  • @superLine : Line Nybakk Akerholt, klassifiserer astrofysikk.
  • @TorgunnKarolineMoe : Karoline Moe, klassifiserer matematikk.
  • @violabibaluba : Viola Kuldvere, redaksjonsleder.
  • Tone Charlotte Gadmar, klassifiserer kjemi.
  • Bente Kathrine Rasch, klassifiserer farmasi.

Aktive deltakere fra Universitetsbiblioteket i Bergen, sortert alfabetisk etter brukernavn:

  • @beatekh : Beate Krøvel Humberset, klassifiserer matematikk, informatikk og fysikk.
  • @bubir : Ingunn Rødland, klassifiserer kjemi.
  • @ken075 : Kjersti Enerstvedt, klassifiserer geofag og teknologi.
  • @Caroline-A : Caroline Susanne Armitage, klassifiserer marinbiologi, delvis vikar for @Hypsibus.
  • @Hypsibius : Hege Folkestad, klassifiserer biovitenskap.

Tidligere bidragsytere:

  • @bibliomari : Mari Lundevall, tidligere redaksjonsleder (UiO, –2016).
  • @jw-geo : Johannes Wiest, student med prosjektstilling for å klassifisere geologi (UiB, 2016–2017).
  • @knuthe : Knut Hegna, klassifiserte informatikk, utviklet Roald og Sonja (UiO, –2017).
  • @kristinran : Kristin Rangnes, klassifiserte geofag (UiO).
  • @mittinatten : Simon Mitternacht, klassifiserte matematikk, informatikk og (teoretisk) fysikk (UiB).
  • @mzyg : Marta Zygmuntowska, klassifiserte geofag, fysikk (anvendt) og teknologi (UiB)
  • @iloveyellow : Solveig Isis Sørbø, taksonomist
  • @starseekr : Trude Westby, klassifiserte informatikk (UiO, 2017–2019).

Prosjekt Realfagstermar på nynorsk

Omsetjing til nynorsk ble ferdigstilt ved årsskiftet 2015/2016 av:

  • Maria Svendsen (@mariaksv): biologi/kjemi)
  • Jørgen Eriksson Midtbø (@jorgenem): fysikk/matte)
  • Vebjørn Sture (@totlevase): korrektur/nynorsk)

Sjå retningslinjer/diskusjon og eigen prosjektside.

Prosjekt Kinderegg

I perioden 2017-2019 har Realfagstermer blitt oversatt til engelsk, kategorisert og mappet til Wikidata med hjelp fra en rekke studenter:

En bieffekt har vært generell kvalitetsheving av vokabularet gjennom at en rekke feil og sammenslåingskandidater har blitt oppdaget. Se Prosjekt «Kinderegg» for mer om prosjektet.

Prosjekt Mapping mot Norsk WebDewey

I perioden 2015-2019 har Humord og Realfagstermer blitt mappet til Norsk WebDewey. Som med Kinderegg-prosjektet har en bieffekt vært en generell kvalitetsheving av begge vokabular. Takk særlig til Hege Nenseth (@HegeNenseth), Kristine Aalrust Kristoffersen (@kaalrust) og Vibeke Stockinger Lundetræ (@vibekelundetrae) som har bidratt med mye på Realfagstermer-siden.

Conversion

Authority data is currently maintained in Sonja and converted to JSON (RoaldIII data model) using RoaldIII. RoaldIII is also used to mix in mappings and translations before exporting RDF/SKOS and MARC21.

The conversion is done by running python publish.py, which only runs a conversion if any of the source files have changed. You can run python publish.py -f to force a conversion even if no source files have changed (useful during development).

Please see the RoaldIII repo for more details on the conversion.

The RoaldIII JSON data is found in realfagstermer.json. This does not currently include data from the Nynorsk translation project. Complete, distributable RDF/SKOS and MARC21 files are found in the dist folder. These includes mappings and all translations.

Data model

Example concept in JSON:

{
  "id": "REAL004162",
  "type": [
    "Topic"
  ],
  "created": "2014-08-25T00:00:00Z",
  "modified": "2014-12-17T00:00:00Z",
  "prefLabel": {
    "nb": {
      "value": "Cellekommunikasjon"
    },
    "en": {
      "value": "Cell signalling"
    }
  },
  "altLabel": {
    "nb": [
      {
        "value": "Cellesignalisering"
      }
    ],
    "en": [
      {
        "value": "Cell signaling"
      }
    ]
  },
  "hiddenLabel": {}
},

Characteristics:

  • Realfagstermer contains only concepts, no facets, arrays or other thesaurus constructs.

  • Concept properties

    • id (string): an unique identifier.

    • type (array): at least one type (Topic, Geographic, Temporal, GenreForm, CompoundHeading or VirtualCompoundHeading).

    • created (datetime string): a creation date.

    • modified (datetime string): a modification date.

    • prefLabel (language map): one preferred term per language. A preferred term for the language code nb is required, while others are optional.

    • altLabel (language map array): any number of alternative terms per language.

    • hiddenLabel (langauge map array): any number of hidden terms (not yet implemented).

    • editorialNote (array): any number of editorial notes (in Bokmål only).

    • definition (language map): one definition per language (currently only Bokmål though).

    • ddc (string): a DDC number (these should eventually be moved to the mapping project).

    • msc (string): a MSC number.

    • elementSymbol (string): a chemical element symbol.

    • related (array): Any number of IDs for related concepts.

    • broader (array): Any number of IDs for broader concepts.

    • narrower (array): Any number of IDs for narrower concepts.

    • component (array): Any number of IDs for components that make up the CompoundHeading or VirtualCompoundHeading (emnestreng). Note that concepts of this type do not have their own terms, since the compound terms are generated from the concepts. Example:

      {
        "id": "REAL014060",
        "type": [
          "CompoundHeading"
        ],
        "created": "2015-03-10T10:07:34Z",
        "component": [
          "REAL002845",
          "REAL007608"
        ]
      }
  • Term properties:

    • value (string): The term value.
    • hasAcronym (string): An acronym (used only if value is the full form).
    • acronymFor (string): The full form (used only if value is an acronym).
  • Note that terms do not have their own IDs, so the relationship between acronyms and their full form is represented by embedding. Example:

    {
      "prefLabel": {
        "nb": {
          "hasAcronym": "DCOM",
          "value": "Distributed component object model"
        }
      }
    }

    When converting to SKOS core, we simplify the model by removing term-term relationships.

Mapping to Wikidata

A large part of the vocabulary (~ 8000 concepts as of Nov 2018) has been mapped to Wikidata:

PREFIX skos: <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX real: <http://data.ub.uio.no/realfagstermer/>

SELECT ?concept ?term ?wd_item
FROM <http://data.ub.uio.no/realfagstermer>
WHERE
{
  ?concept a skos:Concept ;
           skos:prefLabel ?term ;
           skos:mappingRelation ?wd_item .

  FILTER(LANG(?term) = "nb")
  FILTER(STRSTARTS(STR(?wd_item), "http://www.wikidata.org"))
  FILTER NOT EXISTS { ?concept owl:deprecated true . }
}
LIMIT 10
concept term wd_item
http://data.ub.uio.no/realfagstermer/c006328 Strukturgeologi http://www.wikidata.org/entity/Q334823
http://data.ub.uio.no/realfagstermer/c030694 Rogaland http://www.wikidata.org/entity/Q50624
http://data.ub.uio.no/realfagstermer/c030446 Luxemburg http://www.wikidata.org/entity/Q32
http://data.ub.uio.no/realfagstermer/c013836 Stjernerotasjon http://www.wikidata.org/entity/Q6464
http://data.ub.uio.no/realfagstermer/c006404 Patologi http://www.wikidata.org/entity/Q7208
http://data.ub.uio.no/realfagstermer/c004699 Utmarksbeiter http://www.wikidata.org/entity/Q30121
http://data.ub.uio.no/realfagstermer/c005522 Tungmetaller http://www.wikidata.org/entity/Q105789
http://data.ub.uio.no/realfagstermer/c030118 Bibliografier http://www.wikidata.org/entity/Q134995
http://data.ub.uio.no/realfagstermer/c030681 USA http://www.wikidata.org/entity/Q30
http://data.ub.uio.no/realfagstermer/c000237 Tidsmåling http://www.wikidata.org/entity/Q11471

(Try the query)

This opens the possibility for federated queries, combining data from Realfagstermer with data from Wikidata. We can for instance list all concepts that are identified as species on Wikidata (wdt:P105 wd:Q7432) and have a mapping to wdt:P815 and a scientific name (wdt:P225):

PREFIX wd: <http://www.wikidata.org/entity/>
PREFIX wdt: <http://www.wikidata.org/prop/direct/>
PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>
PREFIX skos: <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#>

SELECT
  ?rtTerm ?wdItem ?itisUrl ?sciName
FROM <http://data.ub.uio.no/realfagstermer>
WHERE{
  SERVICE <https://query.wikidata.org/sparql>
{
  ?wdItem wdt:P31 wd:Q16521 ;  # er et taxon
    wdt:P105 wd:Q7432 ;  # rang: art
    wdt:P815 ?itisTsn ;  # har ITIS TSN
    wdt:P225 ?sciName .  # har vitenskapelig navn
}
?rtConcept skos:closeMatch ?wdItem ;
  skos:prefLabel ?rtTerm

FILTER(LANG(?rtTerm) = 'nb')
BIND(IRI(CONCAT("http://www.itis.gov/servlet/SingleRpt/SingleRpt?search_topic=TSN&search_value=",?itisTsn)) AS ?itisUrl)}
LIMIT 100 
rtTerm wdItem itisUrl sciName
Løver http://www.wikidata.org/entity/Q140 http://www.itis.gov/servlet/SingleRpt/SingleRpt?search_topic=TSN&search_value=183803 Panthera leo
Escherichia coli http://www.wikidata.org/entity/Q25419 http://www.itis.gov/servlet/SingleRpt/SingleRpt?search_topic=TSN&search_value=285 Escherichia coli
Ekorn http://www.wikidata.org/entity/Q4388 http://www.itis.gov/servlet/SingleRpt/SingleRpt?search_topic=TSN&search_value=632439 Sciurus vulgaris
Ål http://www.wikidata.org/entity/Q26387 http://www.itis.gov/servlet/SingleRpt/SingleRpt?search_topic=TSN&search_value=161128 Anguilla anguilla
Blodigle http://www.wikidata.org/entity/Q30041 http://www.itis.gov/servlet/SingleRpt/SingleRpt?search_topic=TSN&search_value=69417 Hirudo medicinalis
Jerv http://www.wikidata.org/entity/Q14334 http://www.itis.gov/servlet/SingleRpt/SingleRpt?search_topic=TSN&search_value=180551 Gulo gulo
Tårnugler http://www.wikidata.org/entity/Q25317 http://www.itis.gov/servlet/SingleRpt/SingleRpt?search_topic=TSN&search_value=177851 Tyto alba
Fasaner http://www.wikidata.org/entity/Q25432 http://www.itis.gov/servlet/SingleRpt/SingleRpt?search_topic=TSN&search_value=175905 Phasianus colchicus
Kongeørn http://www.wikidata.org/entity/Q41181 http://www.itis.gov/servlet/SingleRpt/SingleRpt?search_topic=TSN&search_value=175407 Aquila chrysaetos
Sitronmelisse http://www.wikidata.org/entity/Q148396 http://www.itis.gov/servlet/SingleRpt/SingleRpt?search_topic=TSN&search_value=32565 Melissa officinalis

(Try the query)

In practice, the software behind the sparql endpoint at https://data.ub.uio.no (Fuseki) is not good at optimizing federated queries. In the example above, the best would be to swap the remote query and the local query, so the local query is carried out first, but in that case, Fuseki makes one request to Wikidata for each item rather than querying all items in a single query (using VALUES), making it terribly slow. In practice, at least with our current stack, it's therefore better to rather have a script that first queries our local endpoint, then the Wikidata endpoint, and combines the data. But while slow, federated queries are good for demonstrating the possibilities. Here's a query that compares the preferred terms in our vocabulary and the mapped Wikidata items:

PREFIX schema: <http://schema.org/>
PREFIX wd: <http://www.wikidata.org/entity/>
PREFIX wdt: <http://www.wikidata.org/prop/direct/>
PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>
PREFIX skos: <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#>

SELECT ?realTerm ?wikidataItem ?wikidataTerm
FROM <http://data.ub.uio.no/realfagstermer>
WHERE {
  ?realConcept skos:mappingRelation ?wikidataItem ;
             skos:prefLabel ?realTerm .

  FILTER(LANG(?realTerm) = "nb")
  FILTER(STRSTARTS(STR(?wikidataItem), "http://www.wikidata.org")) 

  SERVICE <https://query.wikidata.org/sparql>
  {
    ?wikidataItem schema:version ?o .
    OPTIONAL {
      ?wikidataItem rdfs:label ?wikidataTerm .
      FILTER(LANG(?wikidataTerm) = "nb")
    }
  }
}
LIMIT 10 
realTerm wikidataItem wikidataTerm
Luxemburg http://www.wikidata.org/entity/Q32 Luxembourg
Stjernerotasjon http://www.wikidata.org/entity/Q6464 stjernerotasjon
Tungmetaller http://www.wikidata.org/entity/Q105789 tungmetall
Aktiv læring http://www.wikidata.org/entity/Q1542052
Elektronspektra http://www.wikidata.org/entity/Q905243
Elektronspektroskopi http://www.wikidata.org/entity/Q905243
Dislokasjoner http://www.wikidata.org/entity/Q737571 dislokasjon
Darmstadtium http://www.wikidata.org/entity/Q1266 darmstadtium
Metadata http://www.wikidata.org/entity/Q180160 metadata
Balkan http://www.wikidata.org/entity/Q23522 Balkan

(Try it)

This makes it easy to identify cases where a Norwegian term is missing on Wikidata, or where there is a mismatch between terms – in which case we might want to change either our own term or the Wikidata term or keep them different from each other. Automatic comparison is still complicated by the fact that we use plural for our terms, while Wikidata use singular.

About

Realfagstermer (Science subject terms) is a trilingual (Norwegian Bokmål, Nynorsk and English) controlled vocabulary for indexing library material

Topics

Resources

License

Releases

No releases published

Packages

No packages published
You can’t perform that action at this time.