TogoAnnotator

API request examples

1. Input "DnaA" query

#!sh
$ curl -s 'http://togoannotator.dbcls.jp/gene/DnaA' | jq

2. Input annotation_list.txt

#!sh
$ curl -s http://togoannotator.dbcls.jp/annotation_list.txt | curl -s -F 'upload=@-' 'http://togoannotator.dbcls.jp/genes' | jq

3. Input ddbj_submission.txt

#!sh
$ curl -s http://togoannotator.dbcls.jp/ddbj_submission.txt | curl -s -F 'upload=@-' 'http://togoannotator.dbcls.jp/ddbj' | jq

4. Input GenBank format file BA000022.gb

#!sh
$ curl -s http://togows.dbcls.jp/entry/nucleotide/BA000022.gb | curl -s -F 'upload=@-' 'http://togoannotator.dbcls.jp/genbank' | jq

5. Input BLAST report file 7XS7A95B015-Alignment.txt

#!sh
$ curl -s http://togoannotator.dbcls.jp/7XS7A95B015-Alignment.txt | curl -s -F 'upload=@-' 'http://togoannotator.dbcls.jp/blast' | jq

6. Input GFF3 format file BA000022.gff

#!sh
$ curl -s http://togows.dbcls.jp/entry/nucleotide/BA000022.gff | curl -s -F 'upload=@-' 'http://togoannotator.dbcls.jp/gff'

7. Input FASTA format file ABA25090.1.fasta

#!sh
$ curl -s http://togows.dbcls.jp/entry/nucleotide/ABA25090.1.fasta | curl -s -F 'upload=@-' 'http://togoannotator.dbcls.jp/fasta' | jq