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[팀 과제 Humanscape] django-crontab을 이용한 open API 배치 프로세스 구현, open API 데이터에 맞는 RDB 설계 및 임의 필터링을 적용한 임상정보를 조회할 수 있는 REST API 구현

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목차

Humanscape_기업과제

원티드 프리온보딩 코스 _ 세번째 기업과제 _ 휴먼스케이프

배포주소 --> 현재 비용 문제로 인해 내려둔 상태입니다.

팀 노션 GoTo

  • 요구사항 분석, 정보 공유 및 프로젝트 진행을 위해 사용

과제 해석

Client에게 의료 연구과제를 모아, 필터링과 서치 서비스를 제공하는 과제로 해석하였습니다.

구현 요구사항

  1. Github Repository 조건

    • production key 값 절대 올리지 않도록 유의(히스토리에 남아있을 경우 0점)
    • 팀원간 동일한 commit 단위
    • README.md
      • 개인별 구현 방법과 이유, 어려웠던 점에 대해 간략히 서술
      • 누구나 따라 할 수 있을 정도의 자세한 실행 방법, 트러블 슈팅 가이드

  2. 구현 조건

    • 구현 방식 - Django/Django Rest Framework + postgreSQL + RESTful

    • 임상정보 수집 batch task

      • open API GoTo
      • open API 데이터 주기적으로 적재하는 기능
        • 실제 데이터를 추가하면서 중복 방지
        • 기존 데이터와 API 데이터 간 수정된 사항을 비교해 해당 임상시험이 업데이트 된 것인지 구별
        • 실행 완료 이후 업데이트 된 건 수 출력/로깅

    • 임상정보 API

      • 특정 임상정보 조회
      • 최근 일주일내에 업데이트(변경사항이 있는) 된 임상정보 리스트 조회 + pagination(offset, limit)

    • 직접 API 호출해서 볼 수 있는 API document

    • API 형식 예시
    	# retrive(read)
	curl https://api.clinicaltrialskorea.com/api/v1/studies/22162/
	# search
	curl https://api.clinicaltrialskorea.com/api/v1/studies/?condition=%EA%B0%84&offset=0&limit=10

  3. 가산점 조건

    • 임상 시험 정보를 제공하는 다른 API 발굴해 batch task 추가
      • 중복되는 임상 시험 merge 가능하다면, 규칙과 과정 명시
    • 배포
      • 배포 과정에 대한 가이드 + 주소
    • 임상정보 리스트 임의의 파라미터 검색 기능 API

구현

기술 스택

개발 기간

  • 2022.05.10 - 2022.05.13

ERD

erd

API 명세

--> 현재 비용 문제로 인해 내려둔 상태입니다.

swagger

Step to run

GET API url을 통해 api_key를 받아주세요

batch 관련

django-cronjob의 실행에 필요한 fcntl은 유닉스 운영체제에서만
쓰이기 때문에 윈도우 환경에서는 실행이 불가능 합니다.
따라서 로컬에서 진행한다면 cronjob을 통한 api데이터 받기가 아닌
직접 실행을 해야합니다.

배포 서버 즉, 유닉스(리눅스)기반 운영체제에서의 빌드시, 주기적으로
실행되는 스케줄에 따라 api데이터 받기가 가능합니다.

로컬 서버 실행 방법(cronjob 실행x 수동으로 api data 받기)

1. 리포지터리에서 clone을 합니다
$ git clone https://github.com/wanted-team-e/Humanscape.git
2-1. Pgadmin4에서 application과 연동할 DB를 생성합니다
1. Servers를 register합니다
2. Database를 생성합니다
2-2. .env 파일을 루트에 생성 후 Postgresql과 연동을 위한 정보를 담습니다
SECRET_KEY=''
api_secret_key_1='공공 데이터 포털api_key'

DB_NAME='DB이름'
DB_USER='유저이름'
DB_PASS='비밀번호'
DB_HOST='호스트주소'
uddi='공공데이터포털 api주소'
POSTGRES_NAME='컨테이너용 변수'
POSTGRES_USER='컨테이너용 변수'
POSTGRES_PASS='컨테이너용 변수'
3. 가상환경을 설정한 후 requirement.txt안의 라이브러리를 다운로드 받습니다
Windows:
1. python -m venv venv
2. venv\Scripts\activate.bat
3. pip install -r requirements.txt

Mac:
1. python -m venv venv
2. source venv\bin\activate
3. pip install -r requirements.txt
4. Model migrations을 진행합니다
$ python manage.py migrate
5. Cron Job을 실행합니다
studies.schedules.py 실행
6. Django 서버 실행합니다
$ python manage.py runserver --settings=config.settings.develop

배포 서버 실행 방법(cronjob 실행)

1. 레포지토리 내려받기
$ git clone https://github.com/wanted-team-e/Humanscape.git
2. 가상환경 설치 및 적용
$ sudo apt install virtualenv --> virtualenv 설치
$ virtualenv -p python3 venv --> 가상환경 구성
$ source venv/bin/activate --> 가상환경 실행
$ pip install -r requirements.txt --> 필요한 라이브러리 설치
3. 디레터리 최상단 .env 파일 생성
SECRET_KEY=''
api_secret_key_1='공공 데이터 포털api_key'

DB_NAME='DB이름'
DB_USER='유저이름'
DB_PASS='비밀번호'
DB_HOST='호스트주소'
uddi='공공데이터포털 api주소'
POSTGRES_NAME='컨테이너용 변수'
POSTGRES_USER='컨테이너용 변수'
POSTGRES_PASS='컨테이너용 변수'
4. nginx/nginx.conf 파일 server_name 변경
nginx.conf 파일
server_name 본인의 배포용 ip로 변경
5. docker compose up
$ sudo docker-compose up -d --build 
배치 파일의 실행의 경우 Dockerfile에 설정이 되어 있기 때문에 자동 실행됨 
-> 혹시 변경하고 싶다면?
$ sudo docker exec -it {container_id} /bin/bash -> 해당 컨테이너 접속
config/settings/base.py의 cronjob 수정

Trouble Shooting

postgresql서버와 pgadmin 연동 문제

  • pgAdmin4: 500 Internal Server Error

    1. 제어판 -> postgresql과 pgadmin 삭제
    2. Postgresql Install (pgadmin함께 설치 체크 해제)
    3. Pgadmin Install

  • postgresql의 컨테이너 통신

    1. 문제: 컨테이너간의 통신이 되지 않아 db연결이 안되는문제가 발생
    2. 해결: web컨테이너의 depends_on을 활용하여 해결함

Author

강정희

  • Study, Institute model 모델링 및 구현
    • 연구책임기관(institute), 진료과(department)는 타 opent API의 도입에서도 쓰일 수 있도록 확장성을 고려해 따로 테이블화하여 외래키로 선언하고, 데이터베이스에 업로드 될 때 사용되는 timestamp(created_at, updated_at)도 따로 테이블화하여 해당 테이블을 상속해 모델을 구현했습니다.
  • List/Retrieve API 구현
    • Django APIView, Django ORM을 이용해 CBV 형식으로 API를 구현했습니다.
    • List API
      • offset, limit를 파라미터로 받아 pagination을 할 수 있도록 구현했습니다.
      • 주 검색대상이 될 것이라 예상한 과제명(title), 과제번호(number), 연구책임기관명(institute)를 파라미터로 받아 데이터베이스 내에서 해당 내용을 like 검색하여 조회할 수 있도록 구현했습니다.
      • 추가적으로 page, page_size를 파라미터로 받아 pagenation을 할 수 있도록 구현했습니다.
  • Test Code 작성
    • Pytest, Factoryboy, Faker를 이용해 Model, List/Retrieve API에 대한 test code를 작성했습니다.
    • Model test code
      • 지정된 open API의 내용이 아니라 Factoryboy, Faker를 이용해 임의의 테스트용 모델을 생성해서 Model test를 구현했습니다.
  • Swagger 적용
    • 구현했던 List/Retrieve API의 request, response 상세 내용을 추가해 API document를 작성했습니다.
  • 어려웠던 점 및 보완할 점
    • API 구현과 Swagger 작성에서, 이전에 API 구현에 적용했던 방식인 ModelViewSet에 비해 함수를 선언해서 상세히 구현해야 했기 때문에 내부 로직을 어느 정도 이해하는데 추가적인 시간이 필요했습니다.
    • 처음 test code를 구현해보았기 때문에 필요한 라이브러리를 설치하는 것부터 어려움이 있었고, 각 라이브러리에 대한 이해도가 낮은 상태로 구현을 시작해서 시행착오가 많았던 것 같습니다.
    • APIView와 Viewset의 구현 방식의 차이, test code 작성에 대해 조금 더 알아보는 시간을 가지면 좋을 것 같고, 배포 과정에 대해서도 상세하게 익힐 시간이 필요할 것 같습니다.

이형준

  • 모델링 및 요구사항 분석
    • 공공 api의 데이터를 csv화 하여 모델링 구체화
    • 초기 요구 사항 해석
  • 배치 파일 구현
    • django-crontab을 활용하여 구현
    • update와 create를 고려한 구현
    • 추후 api의 확장이 용이하도록 공공데이터 주소부분 class로 구현
    • crontab의 경우, print문을 로그로 만들어주므로 중요로그 print로 구현
    • api/v1/schedules/logs 업데이트 내용 확인가능하도록 함수형뷰로 구현
  • 배포
    • gunicorn nginx ec2 postgresql을 활용한 배포
    • docker를 활용한 배포
  • 어려웠던 점 및 보완할 점
    • 배치파일을 불필요한 코드를 줄이려 노력하였으나 생각보다 어려움을 겪었습니다.
    • docker를 활용함에 있어 매번 같은 방식으로 진행해서 새로운 어려움을 만나 해결하는데 너무 많은 리소스가 소비되었습니다.
    • 그저 해결하기위해 오랜시간 바라만 보고 있는게 아닌 과제를 진행하는 코어시간에 집중을 하는 습관을 들여서 과제와 일상생활 간의 밸런스를 맞춰야 겠다는 생각이 들었습니다.

서재환

  • 배포
    • 배포를 위해 [gunicorn + Nginx + postgresql + EC2]를 이용하여 진행하였습니다. 처음 배포를 하는 부분이라서 많은 어려움을 겪었습니다. 웹서버 + WAS + Nginx + EC2에 대한 개념 없이 설정에 초점을 맞추어 작업을 진 행하였기 때문에 큰그림을 보지 못하였고 작업을 진행하는데 있어 마주하는 크고 작은 오류에 대해서 도 오류를 해결하기에 급급했습니다. 처음해보는 작업이라는 점으로 인해 두서없이 진행한 부분이 큰 것 같습니다. 다음 과제 때 배포를 맡진 않겠지만 다음에 있을 작업을 할 때에는 크게 보고 개념을 잘 챙기면서 과제를 진행해야 할 것 같습니다.

김채욱

  • 프로젝트 초기 세팅
    • 요구명세서 해석
    • 개발에 필요한 초기 라이브러리 설치
  • Studies 모델링 및 구축
    • 모델 확장성을 위해 과제와 기관 분리
    • 주요 반환 데이터는 과제 모델에서 반환
  • List/Retrieve API 구현
    • drf 내부 함수 이용 (limitoffsetpagination, djangobackendfilter)
    • 기능 구현은 되었지만, 자체적으로 함수 구현의 필요성을 주석처리
  • 어려웠던 점 및 보완할 점
    • 데이터베이스 정규화와 비즈니스 모델 사이의 합의점을 찾는 과정이 어려웠습니다.
      • 개발의 관점에서 데이터 중복과 정확성에 문제가 생길수도 있는 구조이지만, 이를 해결하기 위해 테이블을 분리할시 기능 구현 및 query 성능에 문제가 생겼습니다.
      • 서비스의 이해가 완전하지 않고 모델링을 짤 경우, 이후 모델 확장성 부분에서 주관적인 요소가 너무 많이 개입될 수 있었던것 같습니다.

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django django-rest-framework postgressql django-crontab

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