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xjsun1221/14-gse

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1.GSE474

3组,PCA图一般,热图火山图很好

2.GSE58979

两组,PCA图很好

热图有3个离群样本,火山图很好

上调基因偏多

(从临床信息中找不到有用的分组信息)-找到了呀

3.GSE1462

4组,各种都很好

4.GSE59045

就一个分组

5.GSE18732

三个分组,完全无差别

(探针id转换问题-没遇到啊)

6.GSE60291

两分组,完美

7.GSE20950

两分组,完美

8.GSE62832

两组,配对样本,无差异基因

(不显著,可能需要重新分组)

9.GSE21785

两分组,非常有差异,但上调基因一万多个,不太正常

10.GSE70529

四组,配对样本,放弃治疗了

(可能需要重新分组)

11.GSE26526

两组,热图有两个离群样本,其他很好

12.GSE72158

配对样本,完全无差异

13.GSE32575

4组,有的有差异,有的没有。logfc偏小

(阈值需要调整)

14.GSE43837

E-MEXP-1422(找不到探针id)/ E-MTAB-3017(找不到探针id)/

这两个是什么。

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